These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_4482#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 660 fasta sequence [CCTGATGGTCCTGGATTCAATCTTCACTTGGACCGTTGGTAGACAGTGCTGAAGAGTAGCATACTAAAACGAAACAACTATCCACTTCTTCCCAACTCCCAGTGATTTCTTATCAAAAGTCAATTCATTATGTAAAACTCCAAAGTCAATAATTTACAGAACATACTATAACAGTCATGTTATTATTTGAATTTTCGAACTACATATTTTACTGCTATTATTTTGTTAATATAAAATTTTTGACCCCATAAATTCATCTGTTTTCGCCATGTATTTCTCGAGTAAG-CAGTCA-C-CGAG-TTTAACTGGT-TCTGTGGGAATGTTGTCTTACGTTTCATATAGTTGTTACTGAAAAAAATAATTATGTGATAATAATGAACGTTTATGACTTCTGCTAATAGCCATTATCTACATAGGTTGGGGCTGCATTTCTTATATCTGTCGTATATTACTAACACAAACATCACAACTTCTTAATATTTCTTCTATGAGGTTTTAATGTCCTAATCTTTTATTAAAATGGCCAACAAGTTTCACTAGCTAGGATTCTAAATTTTTTGTCCCATTAATATATAATGCATTTCTGAAACCCCACTCCAGGATCCGATTAATTCACTTTTCCTATGACCTATGAGAGTCATTCATCATATATCTACAGTCTCG] [+] EMBL CD164620 [CCTGATGGTCCTGGATTCAATCTTCACTTGGACCGTTGGTAGACAGTGCTGAAGAGTAGCATACTAAAACGAAACAACTATCCACTTCTTCCCAACTCCCAGTGATTTCTTATCAAAAGTCAATTCATTATGTAAAACTCCAAAGTCAATAATTTACAGAACATACTATAACAGTCATGTTATTATTTGAATTTTCGAACTACATATTTTACTGCTATTATTTTGTTAATATAAAATTTTTGACCCCATAAATTCATCTGTTTTCGCCATGTATTTCTCGAGTAAG CAGTCA C CGAG TTTAACTGGT TCTGTGGGAATGTTGTCTTACGTTTCATATAGTTGTTACTGAAAAAAATAATTATGTGATAATAATGAACGTTTATGACTTCTGCTAATAGCCATTATCTACATAGGTTGGGGCTGCATTTCTTATATCTGTCGTATATTACTAACACAAACATCACAACTTCTTAATATTTCTTCTATGAGGTTTTAATGTCCTAATCTTTTATTAAAATGGCCAACAAGTTTCACTAGCTAGGATTCTAAATTTTTTGTCCCATTAATATATAATGCATTTCTGAAACCCCACTCCAGGATCCGATTAATTCACTTTTCCTATGACCTATGAGAGTCATTCATCATATATCTACAGTCTC ] [-] EMBL CD164524 [ TCGCCATGTATTTCTCGAGTAAG CAGTCA CGCGAG TTTAACTGGTNTCTGTGGGAATGTTGTCTTACGTCTCATATAGTTGTCACTGAAAAAAATAATTATGTGATAATAATGAACGTTTATGACTTCTGCTAATAGCCATTATCTACATAGGTTGGGGCTGCATTTCTTATATCTGTCGTATATTACTAACACAAACATCACAACTTCTTAATATTTCTTCTATGAGGTTTTAATGTCCTAATCTTTTATTAAAATGGCCAACAAGTTTCACTAGCTAGGATTCTAAATTTTTTGTCCCATTAATATATAATGCATTTCTGAAACCCCACTCCAGGATCCGATTAATTCACTTTTCCTATGACCTATGAGAGTCATTCATCATATATCTACAGTCTCG] [-] EMBL CD164522 [ GTATTTCTCGAGTAAGCCAGTCACC CGAGTTTTAACTGGT TCTGTGGGAATGTTGTCTTACGTTTCATATAGTTGTTACTGAAAAAAATAATTATGTGATAATAATGAACGTTTATGACTTCTGCTAATAGCCATTATCTACATAGGTTGGGGCTGCATTTCTTATATCTGTCGTATATTACTAACACAAACATCACGACTTCTTAATATTTCTTCTATGAGGTTTTAATGTCCTAATCTTTTATTAAAATGGCCAACAAGTTTCACTAGCTAGGATTCTAAATTTTTTGTCCCATTAATAAATAATGCATTTCTGAAACCCCACTCCAGGATCCGATTAATTCACTTTTCCTATGACCTATGAGAGTCATTCATCATATATCTACAGTCTCG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||