cluster # 4500

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Schistosoma mansoni
cluster # 4500 cluster # 4500 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4500#0 length = 867 sequences # 3

consensusID : consensus_4500#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 867
fasta sequence

                              [GGTGATTGTGTTCTTGTACCCTACAGTTGGCCATTTCCAAAGTGTCCCATCCTTAATATGGAAAAACCATCTAGTTTTGAGAATCTCCGTTACTATGCAGCTATCGTAGTTTCTGGTCGAGAACGGAGAGCTGACAAGTTAACTAAAACTAGAAACTTTACAAAAGATGATCAAAAACTTTTGGTTGAATTAGCTAGTTCGAACACTCGTGTTGGTCATATTTATGTCCCAAAACAAAAAGCTGTTTGGATTTCACCGAATACTTATCAACGTATTATATTAGAACAATATATGACACCAAAATGTAGGAAATGGTTAAAACATAAAACATTTCTTCCAAATAGTTATCCATTTCAATCAGCTCCAGGTTATCCTGCTGATGGATTTGGCAGATTTAAATCTTATAAAAATAGCCTTCAATCAGATTTACACATTCAACCGTTGACTTTCCAACAGTTCAGACATGGAACAGATGTTCAATTTGAATATTGTCCATCCCTTCAATGTTGGCCTCTTTATTCAGTCGTGAATGACTTATTACCAGTAACTAATGGATGCCCTGTTTGGTATGATAATGAAACAACAAGCAAAAATTTAATAAAATTACCCAANTA-TAAAGTTACAAATAATCTTTTACAGTCGGCTAGATCGAACTGTGAACAGAATTTTGAGCCTAAATTAGTGTACAGGTCACGAAATAAACATATCAATTAAGACATTTTTTATCTACTTTAAGACTGTTATGCTATCAAAATGATCTTGTACTGGGATTCAGTTTCAGTTTGGAAAGGACAGGAGGCTTGATGGCCCGTGTTATTCCTGGCAAATGAAAATTGGCTATTATTCCATAAACTATTTATTAAAATT]

[+] EMBL CD079041             [GGTGATTGTGTTCTTGTACCCTACAGTTGGCCATTTCCAAAGTGTCCCATCCTTAATATGGAAAAACCATCTAGTTTTGAGAATCTCCGTTACTATGCAGCTATCGTAGTTTCTGGTCGAGAACGGAGAGCTGACAAGTTAACTAAAACTAGAAACTTTACAAAAGATGATCAAAAACTTTTGGTTGAATTAGCTAGTTCGAACACTCGTGTTGGTCATATTTATGTCCCAAAACAAAAAGCTGTTTGGATTTCACCGAATACTTATCAACGTATTATATTAGAACAATATATGACACCAAAATGTAGGAAATGGTTAAAACATAAAACATTTCTTCCAAATAGTTATCCATTTCAATCAGCTCCAGGTTATCCTGCTGATGGATTTGGCAGATTTAAATCTTATAAAAATAGCCTTCAATCAGATTTACACATTCAACCGTTGACTTTCCAACAGTTCAGACATGGAACAGATGTTCAATTTGAATATTGTCCATCCCTTCAATGTTGGCCTCTTTATTCAGTCGTGAATGACTTATTACCAGTAACTAATGGATGCCCTGTTTGGTATGATAATGAAACAACAAGCANAAATTTAATANAATTACCCAANTA TANAGNTACAAA                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD073494             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGTAGGAAATGGTTAAAACATAAAACATTTCTTCCAAATAGTTATCCATTTCAATCAGCTCCAGGTTATCCTGCTGATGGATTTGGCAGATTTAAATCTTATAAAAATAGCCTTCAATCAGATTTACACATTCAACCGTTGACTTTCCAACAGTTCAGACATGGAACAGATGTTCAATTTGAATATTGTCCATCCCTTCAATGTTGGCCTCTTTATTCAGTCGTGAATGACTTATTACCAGTAACTAATGGATGCCCTGTTTGGTATGATAATGAAACAACAAGCAAAAATTTAATAAAATTACCCAATAA TAAAGTTACAAATAATCTTTTACAGTCGGCTAGATCGAACTGTGAACAGAATTTTGAGCCTAAATTAGTGTACAGGTCACGAAATAAACATATCAATTAAGACATTTTTTATCTACTTTAAGACTGTTATGCTATCAAAATGATCTTGTACTGGGATTCAGTTTCAGTTTGGAAAGGACAGGAGGCTTGATGGCCCGTGTTATTCCTGGCAAATGAAAATTGGCTATTATTCCATAAACTATTTATTAAAATT]
[+] EMBL SM726                [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCAGATTTAAATCTTATAAAAATAGCCTTCAATCAGATTTACACATTCAACCGTTGACTTTCCAACAGTTCAGACATGGAACAGATGTTCANTTTGAATATTGTCCATCCCTTCAATGTTGGNCTCTTTATTCAGTCGTGAATGACTTATTACCAGTAACTAATGGATGCCCTGTTGGGTATGATAATGAAACAACAAGCAAAAATTTAATAAAATTACCCAA TANTAAAGTTACAAATAATCTTTTACAGNCGGCTAGATCGAACTGTGA                                                                                                                                                                                                                ]




>consensus_4500#0
GGTGATTGTGTTCTTGTACCCTACAGTTGGCCATTTCCAAAGTGTCCCATCCTTAATATG
GAAAAACCATCTAGTTTTGAGAATCTCCGTTACTATGCAGCTATCGTAGTTTCTGGTCGA
GAACGGAGAGCTGACAAGTTAACTAAAACTAGAAACTTTACAAAAGATGATCAAAAACTT
TTGGTTGAATTAGCTAGTTCGAACACTCGTGTTGGTCATATTTATGTCCCAAAACAAAAA
GCTGTTTGGATTTCACCGAATACTTATCAACGTATTATATTAGAACAATATATGACACCA
AAATGTAGGAAATGGTTAAAACATAAAACATTTCTTCCAAATAGTTATCCATTTCAATCA
GCTCCAGGTTATCCTGCTGATGGATTTGGCAGATTTAAATCTTATAAAAATAGCCTTCAA
TCAGATTTACACATTCAACCGTTGACTTTCCAACAGTTCAGACATGGAACAGATGTTCAA
TTTGAATATTGTCCATCCCTTCAATGTTGGCCTCTTTATTCAGTCGTGAATGACTTATTA
CCAGTAACTAATGGATGCCCTGTTTGGTATGATAATGAAACAACAAGCAAAAATTTAATA
AAATTACCCAANTATAAAGTTACAAATAATCTTTTACAGTCGGCTAGATCGAACTGTGAA
CAGAATTTTGAGCCTAAATTAGTGTACAGGTCACGAAATAAACATATCAATTAAGACATT
TTTTATCTACTTTAAGACTGTTATGCTATCAAAATGATCTTGTACTGGGATTCAGTTTCA
GTTTGGAAAGGACAGGAGGCTTGATGGCCCGTGTTATTCCTGGCAAATGAAAATTGGCTA
TTATTCCATAAACTATTTATTAAAATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case