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Schistosoma mansoni
cluster # 4522 cluster # 4522       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4522#0 length = 1114 sequences # 3  

consensusID : consensus_4522#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1114
fasta sequence
                              [TTGGGCACGAGGCCGCACGAGGCATGCCAGTATTTTACTTTCTAGCAGTAAGACGAAATTTATTCCGCTTCTATTGCTGTTTATCTGAGCCTATATTGACTGCTTTCAGTTCGACCAGTTCTTTAATTGCTCTTCCACAACTTTTTCAAGTTTGTGATCGTTATGGAATTGAGTCAGATTTGGTACGAACTGTAGCACCGTTTCTCACAAGTTTCAATGCAAATGGATCTGCTGCATTTATTGCATCTGCTGTTTGCTTTGTAGCCCAATTAACTAAACAATCTTTAAATGCTGATTTTTATCCAGTGTCAATGTGATGGCACTGCCTGCAATTCCAAGTGCAAGTATTATAACTGTTATTCTAATAACACGTGCATTTGACATTTCTGAATCTACCTCCGTATCATTACTTTTTGTTACTGAGTTTATCGCTGATCGATTACGTACCGTTGTAAATGTTATGAGTCATGGTACTTGTGTTCTATTCATTCATATGAAGTTACACCAGGTGAGTTCGACGTCGAATATTCAAAATCATTTCATTCAAACCACAAAAGTTGTCAGCGATTCAGCATCATCCGACAGTGTATCATAGCTGCTGTTAAACAATTCATTGATCAAAAGAAAATAGTGTTCGGTTGGTGTTGTCTTTTCTTGTTTGTGTTTTATTGTTTTTATTTTCTGTTCACTAAAGTACACCCTTGTATTATTTTGTTTTACCTATTGGTCTTTTTGCTGTGATAACTAATTTGTTTAGTTTATGTTAAATAATACCTACCCTTTGTTGTGTTTACCATAGATGTATTTTTATTTCAAGTTTGTGATATTTTCATCAAAAAGACAATTTTTTTAAATCATATTATACGATAAATAAATTCGAATAAAAATTGATGATACTCAGACTAGTTTTTACAAGGTACGAACTAACCAGGGACTTCATTACATAAACTCCTAGCCAGGTTTAATTTTAATTTCAAACTTTCATGAAGATTGTTAAAAGTTTACTTCTTTATTATTTATACCTTTGTCATTTATTTTTTTAAAAATCTTCAAGAATAAACATATGCTGTTTAGTTCATTATTCTATTAGTTTTGTTTGATAAGTACATGTATT]

[+] EMBL CD081344             [TTGGGCACGAGGCCGCACGAGGCATGCCAGTATTTTACTTTCTAGCAGTAAGACGAAATTTATTCCGCTTCTATTGCTGTTTATCTGAGCCTATATTGACTGCTTTCAGTTCGACCAGTTCTTTAATTGCTCTTCCACAACTTTTTCAAGTTTGTGATCGTTATGGAATTGAGTCAGATTTGGTACGAACTGTAGCACCGTTTCTCACAAGTTTCAATGCAAATGGATCTGCTGCATTTATTGCATCTGCTGTTTGCTTTGTAGCCCAATTAACTAAACAATCTTTAAATGCTGATTTTTATCCAGTGTCAATGTGATGGCACTGCCTGCAATTCCAAGTGCAAGTATTATAACTGTTATTCTAATAACACGTGCATTTGACATTTCTGAATCTACCTCCGTATCATTACTTTTTGTTACTGAGTTTATCGCTGATCGATTACGTACCGTTGTAAATGTTATGAGTCATGGTACTTGTGTTCTATTCATTCATATGAAGTTACACCAGGTGAGTTCGACGTCGAATATTCAAAATCATTTCATTCAAACCACAAAAGTTGTCAGCGATTCAGCATCATCCGACAGTGTATCATAGCTGCTGTTAAACAATTCATTGATCAAAAG AAATAGTGTTCGGTTGGTGTTGc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD075176             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGTGAGTTCGACGTCGAATATTCAAAATCATTTCATTCAAACCACAAAAGTTGTCAGCGATTCAGCATCATCCGACAGTGTATCATAGCTGCTGTTAAACAATTCATTGATCAAAAGAAAATAGTGTTCGGTTGTTGTTGTCTTTTCTTGTTTGTGTTTTATTGTTTTTATTTTCTGTTCACTAAAGTACACCCTTGTATTATTTTGTTTTACCTATTGGTCTTTTTGCTGTGATAACTAATTTGTTTAGTTTATGTTAAATAATACCTACCCTTTGTTGTGTTTACCATAGATGTATTTTTATTTCAAGTTTGTGATATTTTCATCAAAAAGACAATTTTTTTAAATCATATTATACGATAAATAAATTCGAATAAAAATTGATGATACTCAGACTAGTTTTTACAAGGTACGAACTAACCAGGGACTTCATTACATAAACTCCTAGCCAGGTTTAATTTTAATTTCAAACTTTCATGAAGATTGTTAAAAGTTTACTTCTTTATTATTTATACCTTTGTCATTTATTTTTTTAAAAATCTTCAAGAATAAACATATGCTGTTTAGTTCATTATTCTATTAGTTTTGTTTGATAAGTACATGTATT]
[-] EMBL CD188855             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTATCAGCGATTCAGCATCATCCGACAGTGTATCATAGCTGCTGTTAAACAATTCATTGATCAAAAGAAAATAGTGTTCGGCTGAAGTTGTCATTTCTTGATTGTGTTTTATTGTTTTTATTTTCTGTTCACTAAAGTACACCCTCGTACTATTTTGTTTTACCTATTGGTCTTTTTGCTGTGATAACTAATTTGTTTAGTTTATGTTAAATAATACCTACCCTTTGTTGTGTTTACCATAGATGTATTTTTATTTCAAGTATGTGATATCTTCATCAAAAAGACAATTTTTCTAAATCATATTATTCGATAAATAAATTCGAATAAAAATTGATGATACTCAGACTAGTTTTTACAAGGTACGAACTAACACGGGAGTTCCTTACATA                                                                                                                                                                        ]


>consensus_4522#0 TTGGGCACGAGGCCGCACGAGGCATGCCAGTATTTTACTTTCTAGCAGTAAGACGAAATT TATTCCGCTTCTATTGCTGTTTATCTGAGCCTATATTGACTGCTTTCAGTTCGACCAGTT CTTTAATTGCTCTTCCACAACTTTTTCAAGTTTGTGATCGTTATGGAATTGAGTCAGATT TGGTACGAACTGTAGCACCGTTTCTCACAAGTTTCAATGCAAATGGATCTGCTGCATTTA TTGCATCTGCTGTTTGCTTTGTAGCCCAATTAACTAAACAATCTTTAAATGCTGATTTTT ATCCAGTGTCAATGTGATGGCACTGCCTGCAATTCCAAGTGCAAGTATTATAACTGTTAT TCTAATAACACGTGCATTTGACATTTCTGAATCTACCTCCGTATCATTACTTTTTGTTAC TGAGTTTATCGCTGATCGATTACGTACCGTTGTAAATGTTATGAGTCATGGTACTTGTGT TCTATTCATTCATATGAAGTTACACCAGGTGAGTTCGACGTCGAATATTCAAAATCATTT CATTCAAACCACAAAAGTTGTCAGCGATTCAGCATCATCCGACAGTGTATCATAGCTGCT GTTAAACAATTCATTGATCAAAAGAAAATAGTGTTCGGTTGGTGTTGTCTTTTCTTGTTT GTGTTTTATTGTTTTTATTTTCTGTTCACTAAAGTACACCCTTGTATTATTTTGTTTTAC CTATTGGTCTTTTTGCTGTGATAACTAATTTGTTTAGTTTATGTTAAATAATACCTACCC TTTGTTGTGTTTACCATAGATGTATTTTTATTTCAAGTTTGTGATATTTTCATCAAAAAG ACAATTTTTTTAAATCATATTATACGATAAATAAATTCGAATAAAAATTGATGATACTCA GACTAGTTTTTACAAGGTACGAACTAACCAGGGACTTCATTACATAAACTCCTAGCCAGG TTTAATTTTAATTTCAAACTTTCATGAAGATTGTTAAAAGTTTACTTCTTTATTATTTAT ACCTTTGTCATTTATTTTTTTAAAAATCTTCAAGAATAAACATATGCTGTTTAGTTCATT ATTCTATTAGTTTTGTTTGATAAGTACATGTATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)