cluster # 4554

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4554 cluster # 4554 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4554#0 length = 637 sequences # 3

consensusID : consensus_4554#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 637
fasta sequence

                              [TTAGATATATTAACTATGTAGCTCAGTTAAGTCATAATCGTGCATTTACACCTCATCATTTTCCATTGAATCTTATCAGTTTGATAATTGCACCGGTACCGACATTTAATAAATCCAAAAATGGATGTCGACCGTATGTGGAAATATTTGAAGGGAAGACCAAAGTGTACTCAACTTACGCAGATTACGATAATTTAAGATCCTATGTTCTTGAAGATGGAAAGATCCAAATACTTTTGAATGGATTAACTGTTTTAGGTGATCTCACAGTTATCATTTATCATTGTCGATCTGCATTTGCTGGACGTGGCAAGATCAGTTCAGTAAAGATTGCTCAGTTTCAATTACACACTGGATTTGTAGAACATAATTTAACTGAACTAATTTATTTCAAATCCGATTTAGATCATCTGGATAATAGTAGCAGCTTTGCCGGTTTCACTAGTCGTTATGCTGAAAGTTTTCATGTTACATTGGAATTTATGGTTTCACCAACTGAAAGACCAAGACAAAGTGACAATCTTGTTTATCCATGGGAAACTCTGCCATCAAATGATCTCCTTAGTCCTAAACTCTGTGTATCAAATCATGATGAACTAAAAGATATCTTATCTGATTACGGACGTNTTAATCGTAA]

[+] EMBL CD118913             [TTAGATATATTAACTATGTAGCTCAGTTAAGTCATAATCGTGCATTTACACCTCATCATTTTCCATTGAATCTTATCAGTTTGATAATTGCACCGGTACCGACATTTAATAAATCCAAAAATGGATGTCGACCGTATGTGGAAATATTTGAAGGGAAGACCAAAGTGTACTCAACTTACGCTGATTACGATAATTTAAGATCCTATGTTCTTGAAGGTGGAAAGATCCAAATACTTTTGAATGGATTAACTGTTTTAGGTGATCTCACAGTTATCATTTATCATTGTCGATCTGCATTTGCTGGACGTGGCAAGATCAGTTCAGTAAAGATTGCTCAGTTTCAATTACACACTGGATTTGTAGAACATAATTTAACTGAACTAATTTATTTCAAATCCGATTTAGATCATCTGGATAATAG                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD092839             [                          TTAAGTCATAATCGTGCATTTACACCTCATCATTTTCCATTGAATCTTATCAGTTTGATAATTGCACCGGTACCGACATTTAATAAATCCAAAAATGGATGTCGACCGTATGTGGAAATATTTGAAGGGAAGACCAAAGTGTACTCAACTTACGCAGATTACGATAATTTAAGATCCTATGTTCTTGAAGATGGAAAGATCCAAATACTTTTGAATGGATTAACTGTTTTAGGTGATCTCACAGTTATCATTTCTCATTGTCGATCTGCATTTGCTGGACGTGGCAAGATCAGTTCAGTAAAGATTGCTCAGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD201644             [                                                                                                                                CGACCGTATGTGGAANTATTTGAAGGGAAGACCAAAGTGTACTCAACTTACGCAGATTACGATAATTTAAGATCCTATGTTCTTGAAGATGGAAAGATCCAAATACTTTTGAATGGATTAACTGTTTTAGGTGATCTCACAGTTATCATTTATCATTGTCGATCTGCATTTGCTGGACGTGGCAAGATCAGTTCAGTAAAGATTGCTCAGTTTCAATTACACACTGGATTTGTAGAACATAATTTAACTGAACTAATTTATTTCAAATCCGATTTAGATCATCTGGATAATAGTAGCAGCTTTGCCGGTTTCACTAGTCGTTATGCTGAAAGTTTTCATGTTACATTGGAATTTATGGTTTCACCAACTGAAAGACCAAGACAAAGTGACAATCTTGTTTATCCATGGGAAACTCTGCCATCAAATGATCTCCTTAGTCCTAAACTCTGTGTATCAAATCATGATGAACTAAAAGATATCTTATCTGATTACGGACGTNTTAATCGTAA]




>consensus_4554#0
TTAGATATATTAACTATGTAGCTCAGTTAAGTCATAATCGTGCATTTACACCTCATCATT
TTCCATTGAATCTTATCAGTTTGATAATTGCACCGGTACCGACATTTAATAAATCCAAAA
ATGGATGTCGACCGTATGTGGAAATATTTGAAGGGAAGACCAAAGTGTACTCAACTTACG
CAGATTACGATAATTTAAGATCCTATGTTCTTGAAGATGGAAAGATCCAAATACTTTTGA
ATGGATTAACTGTTTTAGGTGATCTCACAGTTATCATTTATCATTGTCGATCTGCATTTG
CTGGACGTGGCAAGATCAGTTCAGTAAAGATTGCTCAGTTTCAATTACACACTGGATTTG
TAGAACATAATTTAACTGAACTAATTTATTTCAAATCCGATTTAGATCATCTGGATAATA
GTAGCAGCTTTGCCGGTTTCACTAGTCGTTATGCTGAAAGTTTTCATGTTACATTGGAAT
TTATGGTTTCACCAACTGAAAGACCAAGACAAAGTGACAATCTTGTTTATCCATGGGAAA
CTCTGCCATCAAATGATCTCCTTAGTCCTAAACTCTGTGTATCAAATCATGATGAACTAA
AAGATATCTTATCTGATTACGGACGTNTTAATCGTAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case