cluster # 4568

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Schistosoma mansoni
cluster # 4568 cluster # 4568 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4568#0 length = 806 sequences # 3

consensusID : consensus_4568#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 806
fasta sequence

                              [TGGAATATCTGGAAATTCTATACCATTATCTATTGCAGAGATTACTGCTTGCACTTGTGAATGTACACCTGGTACACGATAAATTCCTTCAGAACTTAAACCATATTGTTCAATATAATCGATACAATGACGAAAAAATGCTGGCAGAACAATTCCATCATGACTAGGATTTCTGCTACAGGCTACATCTAAAGGCATTCCAAAAATAGTTTTGTTTACAGTTTTTGTTTGTTCTTTTTTTGTCGATTTATTATGTGAATGTAATTTTAAGCCACGTTTCTTTTTAGTTTTAATTGAATTAGAATGTTGTAAATTTGACTGAGAAACTGTGATCATTGAATCAGTAGTGTTAGTAGTAGTAGTAGTAGTATACTTTAATTTTTTCTCCTCTTTTTTCTTAATTTTCTGTTTTGA-TTTATTATTATTGTTATTATGATTGAGAATAGTACTAAAAGTATTTTCATTTGTAGTCGATGAAATAGTTACCCCAGTAATAGAATTGGTAACTATCGGATCATTTATGCCGTTAGTGGTTTGTTGTAAATCCATAGAGTTTATCTCATTCAATGAACAGGAGTTCTTTTCCATTGATTGATCATTTAATGTATCTTGATAGGTGGTTAATGTTTTAGGCGAAGTATTTAAAATATTAAGTTGGTTTACTTTGTCTTTTTCTTCTTGTTCAACTTCTTCTTTATCTTTTCTACCTTTTTTATGTTTTTTTGATCGAGATAATCCTTTAAAACCGGATTTTGATAATTTTGATGATTTTTGATTTGGATTAGAAGACATTTTGATTTGAACAT]

[+] EMBL CD121312             [TGGAATATCTGGAAATTCTATACCATTATCTATTGCAGAGATTACTGCTTGCACTTGTGAATGTACACCTGGTACACGATAAATTCCTTCAGAACTTAAACCATATTGTTCAATATAATCGATACAATGACGAAAAAATGCTGGCAGAACAATTCCATCATGACTAGGATTTCTGCTACAGGCTACATCTAAAGGCATTCCAAAAATAGTTTTGTTTACAGTTTTTGTTTGTTCTTTTTTTGTCGATTTATTATGTGAATGTAATTTTAAGCCACGTTTCTTTTTAGTTTTAATTGAATTAGAATGTTGTAAATTTGACTGAGAAACTGTGATCATTGAATCAGTAGTGTTAGTAGTAGTAGTAGTAGTATACTTTAATTTTTTCTCCTCTTTTTTCTTAATTTTCTGTTTTGA TTTATTATTATTGTTATTATGATTGAGAATAGTACTAAAAGTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD121349             [                                                                                                                                                                                                                         ACAGTTTTTGTTTGTTCTTTTTTTGTCGATTTATTATGTGAATGTAATTTTAAGCCACGTTTCTTTTTAGTTTTAATTGAATTAGAATGTTGTAAATTTGACTGAGAAACTGTGATCATTGAATCAGTAGTGTTAGTAGTAGTAGTAGTGGTATACTTTAATTTTTTCTCCTCTTTTTTCTTAATTTTCTGTTTTGATTTTATTATTATTGTTATTATGATTGAGAATAGTACTAAAAGTATTTTCATTTGTAGTCGATGAAATAGTTACCCCAGTAATAGAATTGGTAACTATCGGATCATTTATGCCGTTAGTGGTTTGTTGTAAATCCATAGAGTTTATCTCATTCAATGAACAGGAGTTCTTTTCCATTGATTGATCATTTAATGTATCTTGATAGGTGGTTAATGTTTTAGGCGAAGTATTTAAAATATTAAGTTGGTTTACTTTGTCTTT                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD140208             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGTAGTAGTATACTTTAATTTTTGCTCCTCTTTTTTCTTAATTTTCTGTTTTGA TTTATTATTATTGTTATTATGATTGAGAATAGTACTAAAAGTATTTTCATTTGTAGTCGATGAAATAGTTACCCCAGTAATAGAATTGGTAACTATCGGATCGTTTATGCCGTTAGTGGTTTGTTGTAAATCCATAGAGTTTATCTCATTCAATGAACAGGAGTTCTTTTCCATTGATTGATCATTTAATGTATCTTGATAGGTGGTTAATGTCTTAGGCGAAGTA TTAAAATATTAAGTTGGTTTACTTTGTCCTTTTCTTCTTGTTCAACTTCTTCTTTATCTTTTCTACCTTTTTTATGTTTTTTTGATCGAGATAATCCTTTAAAACCGGATTTTGATAATTTTGATGATTTTTGATTTGGATTAGAAGACATTTTGATTTGAACAT]




>consensus_4568#0
TGGAATATCTGGAAATTCTATACCATTATCTATTGCAGAGATTACTGCTTGCACTTGTGA
ATGTACACCTGGTACACGATAAATTCCTTCAGAACTTAAACCATATTGTTCAATATAATC
GATACAATGACGAAAAAATGCTGGCAGAACAATTCCATCATGACTAGGATTTCTGCTACA
GGCTACATCTAAAGGCATTCCAAAAATAGTTTTGTTTACAGTTTTTGTTTGTTCTTTTTT
TGTCGATTTATTATGTGAATGTAATTTTAAGCCACGTTTCTTTTTAGTTTTAATTGAATT
AGAATGTTGTAAATTTGACTGAGAAACTGTGATCATTGAATCAGTAGTGTTAGTAGTAGT
AGTAGTAGTATACTTTAATTTTTTCTCCTCTTTTTTCTTAATTTTCTGTTTTGATTTATT
ATTATTGTTATTATGATTGAGAATAGTACTAAAAGTATTTTCATTTGTAGTCGATGAAAT
AGTTACCCCAGTAATAGAATTGGTAACTATCGGATCATTTATGCCGTTAGTGGTTTGTTG
TAAATCCATAGAGTTTATCTCATTCAATGAACAGGAGTTCTTTTCCATTGATTGATCATT
TAATGTATCTTGATAGGTGGTTAATGTTTTAGGCGAAGTATTTAAAATATTAAGTTGGTT
TACTTTGTCTTTTTCTTCTTGTTCAACTTCTTCTTTATCTTTTCTACCTTTTTTATGTTT
TTTTGATCGAGATAATCCTTTAAAACCGGATTTTGATAATTTTGATGATTTTTGATTTGG
ATTAGAAGACATTTTGATTTGAACAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case