cluster # 4630

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Schistosoma mansoni
cluster # 4630 cluster # 4630 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4630#0 length = 715 sequences # 3

consensusID : consensus_4630#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 715
fasta sequence

                              [GAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGTCACGGTTGCTATGGTTTCTATAGATTAGGATTTATTGTTGTTGAGCTCACTGAAAACGTTGTTATAAATTTTAGAACTTATTTCGTCCTAATTATGCATTCTTTCATATGGAATGAGAAGTTTTGGCTTCCACCCAACGTAACATGGGACCTAATGAAAGAAATAAATTCAGCTGGTGTTTCACCATCACTCACAAAATCTATGGATTGCCTTTATGCGGTAGCTGTTCTTACAGCCATTCGTTATTATTTGAAAGAGTCTGTTTTCATTCCTCATGGTCTTTCACTGGGTTTGCGCTTTCCTAAAATATCTCATGTTCCTGACATACCAGTCTTGAAGAGAGTATTTGAAAAAAATCATAAACCGACGTACGCTCAGATAAAGGAACTTTCAAAAACTCTTAATTTAAGTGATCGGTCGATTGAAGCGTGGTTTCGAAAGAGACGTAATTGCGAAAAGTCTCCAACGATTGTAAAGTTCGTGGAATCTGAGTGGAAGC-TATGTTACTATACTACCATGTTTTTTTACGGATTATTTGCGTTGCACGATAAGTCCTACTTCTGGGATATTAGAGATGCCATGCTGAATTATCCATATCATGTCCTGACCCCAGAAATTCATTGGTATTATATGGTACAACTTGGATACTACACAGCTTCTTTACTATGGGTTTTTTATGAAAGTCAACGAT]

[+] EMBL CD079296             [GAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGTCACGGTTGCTATGGTTTCTATAGATTAGGATTTATTGTTGTTGAGCTCACTGAAAACGTTGTTATAAATTTTAGAACTTATTTCGTCCTAATTATGCATTCTTTCATATGGAATGAGAAGTTTTGGCTTCCACCCAACGTAACATGGGACCTAATGAAAGAAATAAATTCAGCTGGTGTTTCACCATCACTCACAAAATCTATGGATTGCCTTTATGCGGTAGCTGTTCTTACAGCCATTCGTTATTATTTGAAAGAGTCTGTTTTCATTCCTCATGGTCTTTCACTGGGTTTGCGCTTTCCTAAAATATCTCATGTTCCTGACATACCAGTCTTGAAGAGAGTATTTGAAAAAAATCATAAACCGACGTACGCTCAGATAAAGGAACTTTCAAAAACTCTTAATTTAAGTGATCGGTCGATTGAAGCGTGGTTTCGAAAGAGACGTAATTGCGAAAAGTCTCCAACGATTGTAAAGTTCGTGGAATCTGAGTGGAAGC TATGTTACTATACTACCATGTTTTTTTACGGATTATTTGCGTTGCACGATAAGTCCTACTTCTGGGATATTAGAGATGCCATGCTGAATTATCCATATCATGTCCTGACCCCAGAAATTCATTGGTATTATATGGTACAACTTGGATACTACACAGCTTCTTTACTATGGGTTTTTTATGAAAGTCAACGAT]
[-] EMBL CD193673             [              gtctatctGTCACGGTTGCTATGGTTTCTATAGATTAGGATTTATTGTTGTTGAGCTCACTGAAAACGTTGTTATAAATTTTAGAACTTATTTCGTCCTAATTATGCATTCTTTCATATGGAATGAGAAGTTTTGGCTTCCACCCAACGTAACATGGGACCTAATGAAAGAAATAAATTCAGCTGGTGTTTCACCATCACTCACAAAATCTATGGATTGCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD128464             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGGAATCTGAGTGGAAGCATATGTTACTATACTACCATGTTTTTTTACGGATTATTTGCGTTGCACGATAAGTCCTACTTCTGGGATATTAGAGATGCCATGCTGAATTATCCATATCATGTCCTGACCCCAGAAATTCATTGGTATTATATGGTACAACTTGGATACTACACAGCTTCTGTACTATGGTTTT                  ]




>consensus_4630#0
GAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGTCACGGTTGCTATGGTTTCTATAGATTAGGATTTATT
GTTGTTGAGCTCACTGAAAACGTTGTTATAAATTTTAGAACTTATTTCGTCCTAATTATG
CATTCTTTCATATGGAATGAGAAGTTTTGGCTTCCACCCAACGTAACATGGGACCTAATG
AAAGAAATAAATTCAGCTGGTGTTTCACCATCACTCACAAAATCTATGGATTGCCTTTAT
GCGGTAGCTGTTCTTACAGCCATTCGTTATTATTTGAAAGAGTCTGTTTTCATTCCTCAT
GGTCTTTCACTGGGTTTGCGCTTTCCTAAAATATCTCATGTTCCTGACATACCAGTCTTG
AAGAGAGTATTTGAAAAAAATCATAAACCGACGTACGCTCAGATAAAGGAACTTTCAAAA
ACTCTTAATTTAAGTGATCGGTCGATTGAAGCGTGGTTTCGAAAGAGACGTAATTGCGAA
AAGTCTCCAACGATTGTAAAGTTCGTGGAATCTGAGTGGAAGCTATGTTACTATACTACC
ATGTTTTTTTACGGATTATTTGCGTTGCACGATAAGTCCTACTTCTGGGATATTAGAGAT
GCCATGCTGAATTATCCATATCATGTCCTGACCCCAGAAATTCATTGGTATTATATGGTA
CAACTTGGATACTACACAGCTTCTTTACTATGGGTTTTTTATGAAAGTCAACGAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case