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Schistosoma mansoni
cluster # 4662 cluster # 4662       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4662#0 length = 974 sequences # 3  

consensusID : consensus_4662#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 974
fasta sequence
                              [GGAAATATGTAATATCCATGTGATTATCATTGTAAGTAAAACAACTGTTATACCTAACCATAATGTCCAACTTGTACTCTCTAGATTATTAGCTGTTACATAATCCGATAATTTTTGATTATTAATAATAAGAATTGGGTTCATTACATAACCATCATTTATACTACTGTAGTTATTATAAGTTTCTTTTTCAATAAAGATCATTTCATATTACAAATTATAAAATGAAATACAAAGATACGAAAAATATCAAATTCGACTAAATTAATTCATGATCATGTTGTTTACATTTCACAAGAGTTTGCATAATTTACTGATTCGTAGTAAAGCAATAATAGCCTCGATATTACATTCAAACAAAGGAACTAAGTATTTTGTATTGAGTAATAATCAACTGAAAATTACATTTATTTTTATGGATGGAAAAACTTGAGGTAGACCAATAGAAAACTGGCTTCAAGGTCATTCGTTAAACCCAATAGGAAATTTCTGTTTGCTTTTGTGAGGAAGTAAATCATTTGACTTCAGCGTCGTTCGTACCCACATGACACATAATGTAATATTTCCTAAACAAAATGCATTTACCAACCAGTATCATGTGCATAAATATCCTTGGACAATCTGTATAATGCTATCTAAGAATTTAAACTACGTAATGTAATGTAATGTCGAAATTATTTTGATGCAAATTATGCCCAGTTTACGTATCACGTATTTGTGTATGACTCCAAATTTTTTTTCCCCCACCAAACTATAGCCATTAATTTTCATGGAAAATATTTACCCTCCAAAGAAATGGTTGCAGCCCTGAAATACTGAATCCTATTGGTGAATTGTTATGGTATGACTGACTAAATGATGCCTGTAAATGTTTTATTTGAAATTTATTCCCTCATTATCAAAGTATTAATGTAATCCCATTTATCGATTGTTTCGGTTATTTAGGAAAACAAAAGTCATTCAAATTAATGATA]

[-] EMBL AI067110             [GGAAATATGTAATATCCATGTGATTATCATTGTAAGTAAAACAACTGTTATACCTAACCATAATGTCCAACTTGTACTCTCTAGATTATTAGCTGTTACATAATCCGATAATTTTTGATTATTAATAATAAGAATTGGGTTCATTACATAACCATCATTTATACTACTGTAGTTATTATAAGTTTCTTTTTCAATAAAGATCATTTCATATTACAAATTATAAAATGAAATACAAAGATACGAAAAATATCAAATTCGACTAAATTAATTCATGATCATGTTGTTTACATTTCACAAGAGTTTGCATAATTTACTGATTCGTAGTAAAGCAATAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD082773             [                   GTGATTATCATTGTAAGTAAAACAACTGTTATACCTAACCATAATGTCCAACTTGTACTTTCTAGATTATTAGCTGTTACATAATCCGATAATTTTTGATTATTAATAATAAGAATTGGGTTCATTACATAACCATCATTTATACTACTGTAGTTATTATAAGTTTCTTTTTCAATAAAGATCATTTCATATTACAAATTATAAAATGAAATACAAAGATACGAAAAATATCAAATTCGACTAAATTAATTCATGATCATGTTGTTTACATTTCACAAGAGTTTGCATAATTTACTGATTCGTAGTAAAGCAATAATAGCCTCGATATTACATTCAAACAAAGGAACTAAGTATTTTGTATTGAGTAATAATCAACTGAAAATTACATTTATTTTTATGGATGGAAAAACTTGAGGTAGACCAATAGAAAACTGGCTTCAAGGTCATTCGTTAAACCCAATAGGAAATTTCTGTTTGCTTTTGTGAGGAAGTAAATCATTTGACTTCAGCGTCGTTCGTACCCACATGACACATAATGTAATATTTCCTAAACAAAATGCATTTACCAACCAGTATCATGTGCATAAATATCCTTGGACAATCTGTATAATGCTATCTAAGAATTTAAACTACGTAATGTAATGTAATGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD076365             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCCCCATGACACATAATGTAATATTTCCTAAACAAAATGCATTTCCCACCCAGTATCATGTGCATAAATATCCTTGGCCAATCTGTATAATGCTATTTAAGAATTTAAACTACGTAATGTAATGTAATGTCGAAATTATTTTGATGCAAATTATGCCCAGTTTACGTATCACGTATTTGTGTATGACTCCAAATTTTTTTTCCCCCACCAAACTATAGCCATTAATTTTCATGGAAAATATTTACCCTCCAAAGAAATGGTTGCAGCCCTGAAATACTGAATCCTATTGGTGAATTGTTATGGTATGACTGACTAAATGATGCCTGTAAATGTTTTATTTGAAATTTATTCCCTCATTATCAAAGTATTAATGTAATCCCATTTATCGATTGTTTCGGTTATTTAGGAAAACAAAAGTCATTCAAATTAATGATA]


>consensus_4662#0 GGAAATATGTAATATCCATGTGATTATCATTGTAAGTAAAACAACTGTTATACCTAACCA TAATGTCCAACTTGTACTCTCTAGATTATTAGCTGTTACATAATCCGATAATTTTTGATT ATTAATAATAAGAATTGGGTTCATTACATAACCATCATTTATACTACTGTAGTTATTATA AGTTTCTTTTTCAATAAAGATCATTTCATATTACAAATTATAAAATGAAATACAAAGATA CGAAAAATATCAAATTCGACTAAATTAATTCATGATCATGTTGTTTACATTTCACAAGAG TTTGCATAATTTACTGATTCGTAGTAAAGCAATAATAGCCTCGATATTACATTCAAACAA AGGAACTAAGTATTTTGTATTGAGTAATAATCAACTGAAAATTACATTTATTTTTATGGA TGGAAAAACTTGAGGTAGACCAATAGAAAACTGGCTTCAAGGTCATTCGTTAAACCCAAT AGGAAATTTCTGTTTGCTTTTGTGAGGAAGTAAATCATTTGACTTCAGCGTCGTTCGTAC CCACATGACACATAATGTAATATTTCCTAAACAAAATGCATTTACCAACCAGTATCATGT GCATAAATATCCTTGGACAATCTGTATAATGCTATCTAAGAATTTAAACTACGTAATGTA ATGTAATGTCGAAATTATTTTGATGCAAATTATGCCCAGTTTACGTATCACGTATTTGTG TATGACTCCAAATTTTTTTTCCCCCACCAAACTATAGCCATTAATTTTCATGGAAAATAT TTACCCTCCAAAGAAATGGTTGCAGCCCTGAAATACTGAATCCTATTGGTGAATTGTTAT GGTATGACTGACTAAATGATGCCTGTAAATGTTTTATTTGAAATTTATTCCCTCATTATC AAAGTATTAATGTAATCCCATTTATCGATTGTTTCGGTTATTTAGGAAAACAAAAGTCAT TCAAATTAATGATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)