Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4706 cluster # 4706       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4706#0 length = 311 sequences # 3  

consensusID : consensus_4706#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 311
fasta sequence
                              [AATTAACTCACTAAAATTTATGCCCGACTAGTTTCAGTTAAATATTATGCGTTATTCAGTATTGATTTTAGTAATCCAATAATTATTTCATTTTGCAAACTCCAAGTTAAATGTGTGCACATACCAGATTAATATTTCTTATCAAACGTCCAATTTAGGTCGAGCCATGTTTTTTGAAGACCGTAATATTTTATGACTGATTCAACCTTGATAAGTCATACAAAACTATAATCCAAAAATTTGAGTCAAGCAGCTAAACTAGTCAGCGATATCCGCACAACCAACTTGTGTTTTGTGGGTGTAAAGCACAT]

[+] EMBL CD092219             [AATTAACTCACTAAAATTTATGCCCGACTAGTTTCAGTTAAATATTATGCGTTATTCAGTATTGATTTTAGTAATCCAATAATTATTTCATTTTGCAAACTCCAAGTTAAATGTGTGCACATACCGGATTAATATTTCTTATCAAACGTCCAATTTAGGTCGAGCCATGTTTTTTGAAGACCGTAATATTTTATGACTGATTCAACCTTGATAAGTCATACAAAACTATAATCCAAAAATTTGAGTCAAGCAGCTAAACTAGTCAGCGATATCCGCACAACCAACTTGTGTTTTGTGGGTGTAAAGCACA ]
[-] EMBL CD092282             [ ATTAACTCACTAAAATTTATGCCCGACTAGTTTCAGTTAAATATTATGCGTTATTCAGTATTGATTTTAGTAATCCAATAATTATTTCATTTTGCAAACTCCAAGTTAAATGTGTGCACATACCAGATTAATATTTCTTATCAAACGTCCAATTTAGGTCGAGCCATGTTTTTTGAAGACCGTAATATTTTATGACTGATTCAACCTTGATAAGTCATACAAAACTATAATCCAAAAATTTGAGTCAAGCAGCTAAACTAGTCAGCGATATCCGCACAACCAACTTGTGTTTTGTGGGTGTAAAGCACAT]
[-] EMBL CD092127             [ ATTAACTCACTAAAATTTATGCTCGACTAGTTTCAGTTAAATATTATGCGTTATTCAGTATTGATTTTAGTAATCCAATAATTATTTCATTTTGCAAACTCCAAGTTAAATGTGTGCACATACCAGATTAATATTTCTTATCAAACGTCCAATTTAGGTCGAGCCATGTTTTTTGAAGACCGTAATATTTTATGACTGATTCAACCTTGATAAGTCATACAAAACTATAATCCAAAAATTTGAGTCAAGCAGCTAAACTAGTCAGCGATATCCGCACAACCAACTTGTGTTTTGTGGGTGTAAAGCACAT]


>consensus_4706#0 AATTAACTCACTAAAATTTATGCCCGACTAGTTTCAGTTAAATATTATGCGTTATTCAGT ATTGATTTTAGTAATCCAATAATTATTTCATTTTGCAAACTCCAAGTTAAATGTGTGCAC ATACCAGATTAATATTTCTTATCAAACGTCCAATTTAGGTCGAGCCATGTTTTTTGAAGA CCGTAATATTTTATGACTGATTCAACCTTGATAAGTCATACAAAACTATAATCCAAAAAT TTGAGTCAAGCAGCTAAACTAGTCAGCGATATCCGCACAACCAACTTGTGTTTTGTGGGT GTAAAGCACAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)