cluster # 4708

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Schistosoma mansoni
cluster # 4708 cluster # 4708 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4708#0 length = 648 sequences # 3

consensusID : consensus_4708#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 648
fasta sequence

                              [TAATTCTTTAGTAGGCCTTATATTTGCCCAGATCTCTTTTCTTCGGTACGTTGGTGAGGTGTCCCTTTTACCAGTACGTCAGCAATTGTCCTTCCTCCCAAACCTCCTGCATAGAACGTAGAGCGTTGTTGCAGTCACTTCCATACCTGACTTCATTGGTTCAGCTTGTACGGTTTTAGGTCCTGCTGCTTTCCTACTCTTCAGTTGTTGATGGAGTGACAGATAATGGGAAGGTCCGTTTGTGCTGCTTCGATGTTCGGTGGATTCAATGGAACTGATCGATTCAAGAGTACTTTGAAGTATTAAACCCATCTGTTCCTCTGTCCTTGAATCTCCGTGATTGTCTTTCCTCCTTTGTCCTTGAGCAGTCTCTCTGACTCACTATATTTCCCAGATAGTTTCTTCATCGTGTCATACAGTTGTTGCATATTCCCTTCTCTTGCAGCATTTTTTTGCTGTCGCTGCTAGATTTTCTACGTACTTTTGCTTGTCATCTCTAATGCTCCTCTTCACTTGCTTCTTTGCTTTCGTTCTGTGCCTTGACTTTCTCTGCTCTTGTTCGACTGTTGTTAATTGCTGTCTACTTGTTCTTTTTTTCTTGAAACTTGTCCAAAGGTTTGATAGAGATATATTCCTTGTGATGATGCT]

[+] EMBL CD086879             [TAATTCTTTAGTAGGCCTTATATTTGCCCAGATCTCTTTTCTTCGGTACGTTGGTGAGGTGTCCCTTTTACCAGTACGTCAGCAATTGTCCTTCCTCCCAAACCTCCTGCATAGAACGTAGAGCGTTGTTGCAGTCACTTCCATACCTGACTTCATTGGTTCAGCTTGTACGGTTTTAGGTCCTGCTGCTTTCCTACTCTTCAGTTGTTGATGGAGTGACAGATAATGGGAAGGTCCGTTTGTGCTGCTTCGATGTTCGGTGGATTCAATGGAACTGATCGATTCAAGAGTACTTTGAAGTATTAAACCCATCTGTTCCTCTGTCCTTGAATCTCCGTGATTGTCTTTCCTCCTTTGTCCTTGAGCAGTCTCTCTGACTCACTATATTTCCCAGATAGTTTCTTCATCGTGTCATACAGTTGTTGCATATTCCCTTCTCTTGCAGCATTTTTTTGCTGTCGCTGCTAGATTTTCTACGTACTTTTGCTTGTCATCTCTAATGCTCCTCTTCACTTGCTTCTTTGCTTTCGTTCTGTGCCTTGACTTTCTCTGCTCTTGTTCGACTGTTGTTAATTGCTGTCTACTTGTTCTTTTTTTCTTGAAACTTGTCCAAAGGTTTGATAGAGATATATTCCTTGTGATGATG  ]
[-] EMBL CD086884             [                                            GGTACGTTGGTGAGGTGTCCCTTTTACCAGTACGTCAGCAATTGTCCTTCCTCCCAAACCTCCTGCATAGAACGTAGAGCGTTGTTGCAGTCACTTCCATACCTGACTTCATTGGTTCAGCTTGTACGGTTTTAGGTCCTGCTGCTTTCCTACTCTTCAGTTGTTGATGGAGTGACAGATAATGGGAAGGTCCGTTTGTGCTGCTTCGATGTTCGGTGGATTCAATGGAACTGATCGATTCAAGAGTACTTTGAAGTATTAAACCCATCTGTTCCTCTGTCCTTGAATCTCCGTGATTGTCTTTCCTCCTTTGTCCTTGAGCAGTCTCTCTGACTCACTATATTTCCCAGATAGTTTCTTCATCGTGTCATACAGTTGTTGCATATTCCCTTCTCTTGCAGCATTTTTTTGCTGTCGCTGCTAGATTTTCTACGTACTTTTGCTTGTCATCTCTAATGCTCCTCTTCACTTGCTTCTTTGCTTTCGTTCTGTGCCTTGACTTTCTCTGCTCTTGTTCGACTGTTGTTAATTGCTGTCTACTTGTTCTTTTTTTCTTGAAACTTGTCCAAAGTTTTGATAGAGATATATTCCTTGTGATGATGCT]
[+] EMBL CD086775             [                                                                                                                                                                                                                                                       ctatGATGTTCGGTGGATTCAATGGAACTGCGCGATTTTACACAACTTTGAAGTATTAAACCCATCTGTTCCTCTGTCCTTGAATCTCCGTGATTGTCTTTCCTCCTTTGTCCTTGAGCAGTCTCTCTGACTCACTATATTTCCCAGATAGTTTCTTCATCGTGTCATACAGTTGTTGCATATTCCCTTCTCTTGCAGCATTTTTTTGCTGTCGCTGCTAGATTTTCTACGTACTTTTGCTTGTCATCTCTAATGCTCCTCTTCACTTGCTTCTTTGCTTTCGTTCTGTGCCTTGACTTTCTCTGCTCTTGTTCGACTGTT                                                                                ]




>consensus_4708#0
TAATTCTTTAGTAGGCCTTATATTTGCCCAGATCTCTTTTCTTCGGTACGTTGGTGAGGT
GTCCCTTTTACCAGTACGTCAGCAATTGTCCTTCCTCCCAAACCTCCTGCATAGAACGTA
GAGCGTTGTTGCAGTCACTTCCATACCTGACTTCATTGGTTCAGCTTGTACGGTTTTAGG
TCCTGCTGCTTTCCTACTCTTCAGTTGTTGATGGAGTGACAGATAATGGGAAGGTCCGTT
TGTGCTGCTTCGATGTTCGGTGGATTCAATGGAACTGATCGATTCAAGAGTACTTTGAAG
TATTAAACCCATCTGTTCCTCTGTCCTTGAATCTCCGTGATTGTCTTTCCTCCTTTGTCC
TTGAGCAGTCTCTCTGACTCACTATATTTCCCAGATAGTTTCTTCATCGTGTCATACAGT
TGTTGCATATTCCCTTCTCTTGCAGCATTTTTTTGCTGTCGCTGCTAGATTTTCTACGTA
CTTTTGCTTGTCATCTCTAATGCTCCTCTTCACTTGCTTCTTTGCTTTCGTTCTGTGCCT
TGACTTTCTCTGCTCTTGTTCGACTGTTGTTAATTGCTGTCTACTTGTTCTTTTTTTCTT
GAAACTTGTCCAAAGGTTTGATAGAGATATATTCCTTGTGATGATGCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case