cluster # 4726

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Schistosoma mansoni
cluster # 4726 cluster # 4726 Sequences # 3 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_4726#0 length = 490 sequences # 2

consensus_4726#1 length = 452 sequences # 1

consensusID : consensus_4726#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 490
fasta sequence

                              [GAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGGTGAGTGTCACAATTGTATGTGTGTTTGGGAGTATTTGTGATATGAAGATGTATGTAGTTGTGTAGTGAGGTGTTGGTTTTGTTGAGTGAGTTGTTGTTAAGTGGTTTGTGTGTGAATTATCCTGGATCGACTGTTAGCCACATTGTGTATTATAGTGGTCTAATTCTGAAATCCAGGTAAATAATTGGCACTGGGGTGAATTGTCCACTGACTGGTCTCACAGTTAGTGGTTTTTGTTGTTTTGAGAATCGTGCCTAGATGATGGATTAGTGAGGTGCGATACTACTAGTTGATAGGACGTTGAGCCATATTGTTTGTGATGAACAGACTGTGATGTGGTAGTGGTCTAGTGTGATGTTTCCGTGGTTATTATTATTGTTACTATTCATATTAATATCGATACTATTAGTT]

[+] EMBL CD113304             [GAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGGTGAGTGTCACAATTGTATGTGTGTTTGGGAGTATTTGTGATATGAAGATGTATGTAGTTGTGTAGTGAGGTGTTGGTTTTGTTGAGTGAGTTGTTGTTAAGTGGTTTGTGTGTGAATTATCCTGGATCGACTGTTAGCCACATTGTGTATTATAGTGGTCTAATTCTGAAATCCAGGTAAATAATTGGCACTGGGGTGAATTGTCCACTGACTGGTCTCACAGTTAGTGGTTTTTGTTGTTTTGAGAATCGTGCCTAGATGATGGATTAGTGAGGTGCGATACTACTAGTTGATAGGACGTTGAGCCATATTGTTTGTGATGAACAGACTGTGATGTGGTAGTGGTCTAGTGTGATGTTTCCGTGGTTATTATTATTGTTACTATTCATATTAATA               ]
[+] EMBL CD088638             [                                                                                                                                                                                                                                                            CAGGTAAATAATTGGCACTGGGGTGAATTGTCCACTGACTGGTCTCACAGTTAGTGGTTTTTGTTGTTTTGAGAATCGTGCCTAGATGACGGATTAGTGAGGTGCGATACTACTAGTTGGTAGGACGTTGAGCCATATTGTTTGTGATGAACAGACTGTGATGTGGTAGTGGTCTAGTGTGATGTTTCCGTCGTTATTATTATTGTTATTATTCATATTAATATCGATACTATTAGTT]




>consensus_4726#0
GAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTT
GTTGACGAGTTAGAATCGGTGAGTGTCACAATTGTATGTGTGTTTGGGAGTATTTGTGAT
ATGAAGATGTATGTAGTTGTGTAGTGAGGTGTTGGTTTTGTTGAGTGAGTTGTTGTTAAG
TGGTTTGTGTGTGAATTATCCTGGATCGACTGTTAGCCACATTGTGTATTATAGTGGTCT
AATTCTGAAATCCAGGTAAATAATTGGCACTGGGGTGAATTGTCCACTGACTGGTCTCAC
AGTTAGTGGTTTTTGTTGTTTTGAGAATCGTGCCTAGATGATGGATTAGTGAGGTGCGAT
ACTACTAGTTGATAGGACGTTGAGCCATATTGTTTGTGATGAACAGACTGTGATGTGGTA
GTGGTCTAGTGTGATGTTTCCGTGGTTATTATTATTGTTACTATTCATATTAATATCGAT
ACTATTAGTT

consensusID : consensus_4726#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 452
fasta sequence

                              [TGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGATGTAAATGAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGATGTAAATGAAGAATGAGTAAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGATGTAAATGAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAAAATCGATGTATTGACTTGTTGTTGGTGTATTTGGCGAAGTGGTGTTGTGCGCTATAGTTAAGGATGTAAATGAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAAAATCGATGTAAATGAATCGTTG]

[+] EMBL CD166413             [TGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGATGTAAATGAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGATGTAAATGAAGAATGAGTAAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGATGTAAATGAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAAAATCGATGTATTGACTTGTTGTTGGTGTATTTGGCGAAGTGGTGTTGTGCGCTATAGTTAAGGATGTAAATGAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAAAATCGATGTAAATGAATCGTTG]




>consensus_4726#1
TGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGATGTAAATGAAGAATGAGTGAACCGTC
GATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGA
TGTAAATGAAGAATGAGTAAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTG
GTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGATGTAAATGAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTG
GAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAAAATCGATGTATTGA
CTTGTTGTTGGTGTATTTGGCGAAGTGGTGTTGTGCGCTATAGTTAAGGATGTAAATGAA
GAATGAGTGAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTT
GACGAGTTAAAATCGATGTAAATGAATCGTTG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_4726#0      GAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTT 60
consensus_4726#1      ---------------------------------------------TGGTTTTGGTGATTT 15
                                                                   ***************

consensus_4726#0      GTTGACGAGTTAGAATCGGTGAGTGTCACAATTGTATGTGTGTTTGGGAGTATTTGTGAT 120
consensus_4726#1      GTTGACGAGTTAGAATCGATGTAAATGAAGAATGAGTGAACCGTCG-----ATATGTGGA 70
                      ****************** **    * *  * **  **     * *     ** ****  

consensus_4726#0      ATGAAGATGTATGTAGTTGTGT-AGTGAGGTGTTGGTTTTGTTGAGTGAGTTGTTGTTAA 179
consensus_4726#1      GTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGA-GTTA---GAATCGATGT-AA 125
                       *    **  *** * * ** *  ****  *****     ***    ** * * *** **

consensus_4726#0      GTGGTTTGTGTGTGAATTATCC-TGGATCGACTGTTAGCCACATTGTGTA-TTATAGTGG 237
consensus_4726#1      ATGAAGAATGAGTAAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCG-ATGGAATGGTTTTGGTGA 184
                       **     ** ** **   **  *   * ** *   *  *  ** *  *  ** * *** 

consensus_4726#0      TCTAATTCTGAAATCCAGGTAA-ATAATTGGCACTGGGGTGAATTGTCCACTGACTGGTC 296
consensus_4726#1      TTTGTTGACGAGTTAGAATCGATGTAAATGAAGAATGAGTGAACCGTCGA-TATGTGGAG 243
                      * *  *   **  *  *    *  *** **      * *****  *** * *   ***  

consensus_4726#0      TCACAGTTAGTGGT----TTTTGTTGTTTTGAGAATCGTGCCTAGAT-GATGGATTAGTG 351
consensus_4726#1      TTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGA-CGAGTTAAAATCGATGTATTGACT 302
                      *  ** *   ***     ***** ** ****   * ** *   * ** **** ***    

consensus_4726#0      AGGTGCGATACTACTAGTTGATAGGACGTTGAGCCATATTGTTTGTGATGAACAGACTGT 411
consensus_4726#1      TGTTGTTGGTGTATTTGGCGAAGTGGTGTTGTGCGCTATAGTTAAGGATGTAAATGAAG- 361
                       * **      ** * *  **   *  **** **  *** ***   **** * *    * 

consensus_4726#0      GATGTGGTAGTGGTCTA-GTGTGATGTTTCCGTGGTTATTATTATTGTTACTATTCAT-- 468
consensus_4726#1      AATGAGTGAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTG 421
                       *** *  *   *** *  ****  *** *  * * *   **  ** *    ***  *  

consensus_4726#0      ----ATTAATATCGATACTATTAGTT----- 490
consensus_4726#1      ACGAGTTAAAATCGATGTAAATGAATCGTTG 452
                           **** ******   * *   *