Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4733 cluster # 4733       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4733#0 length = 794 sequences # 3  

consensusID : consensus_4733#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 794
fasta sequence
                              [CTCGAGGTCCGATATATATTATTTTCTCCATATAGCTCAGTTAAATGATATGCATGTTTCATATTAGTTAGTCGAAGCCTAATGAGACATTATAGATTGTTTGACCACGCCCTATGTAAACTGCGGTTATGACCAGATCATGTTTTCATAATTGGTAACACAGCGATATGAAAGATAAATAAGTTTTAAGATTGCAAAACAAAAACCGAAAACCATATGACTTGGTTTCAGCGGCTACCCAAATCTGATTCGGAATATACAACAAATCAAAGCATATAACTCTTTTATAGTTGTGTATTCTAATGTCATGTTCGAAAATTAAAATCGGAATATATAGTACAGAAAACAAACTGTTTGTTTTAATTCATTAAGTTTTCAGAATTTCCGATTTGAAAAAAATTTATCAGGTTGCACAACTTTCTCATTCAGTAATTTTAACCACTTTGAATTATCTTATCCCTATCAGTTTTCTTTGATTTTTAAGTGGTTTAATTGAAAGTTTGACTACACATCTCATTTGTCAAATACTTTTCAATTTGATAAAACTGTAATATCAGTCTACTTACAAAGAAAAGTATAGCAATTAAATTTGTATTGCATTTTCAACCTTTCAATCGTTTCTGGATACAGTTTATTCTCAAACTTATATGTAAATAGACTCAGACATCTGAAATCATATAAACTTCA-CTTATTTTTCCCTATATACCACAGTTTCATTNTGTTNTACATCTCTATTCCTTTTTTG-TTGCCTTCTCAAACAGGATGATTG-ATGTTATTTAA-TAC-ANAATATANTT]

[+] EMBL CD082154             [CTCGAGGTCCGATATATATTATTTTCTCCATATAGCTCAGTTAAATGATATGCATGTTTCATATTAGTTAGTCGAAGCCTAATGAGACATTATAGATTGTTTGACCACGCCCTATGTAAACTGCGGTTATGACCAGATCATGTTTTCATAATTGGTAACACAGCGATATGAAAGATAAATAAGTTTTAAGATTGCAAAACAAAAACCGAAAACCATATGACTTGGTTTCAGCGGCTACCCAAATCTGATTCGGAATATACAACAAATCAAAGCATATAACTCTTTTATAGTTGTGTATTCTAATGTCATGTTCGAAAATTAAAATCGGAATATATAGTACAGAAAACAAACTGTTTGTTTTAATTCATTAAGTTTTCAGAATTTCCGATTTGAAAAAAATTTATCAGGTTGCACAACTTTCTCATTCAGTAATTTTAACCACTTTGAATTATCTTATCCCTATCAGTTTTCTTTGATTTTTAAGTGGTTTAATTGAAAGTTTGACTACACATCTCATTTGTCAAATACTTTTCAATTTGATAAAACTGTAATATCAGTCTACTTACAAAGAAAAGTATAGCAATTAAATTTGTATTGCATTTTCAACCTTTCAATCGTTTCTGGATACAGTTTATTCTCAAACTTATATGTAAATAGACTCAGACATCTGAAATCATATAAACTTCA CTTATTTTTCCCTATATACCACAGTTTCATTNTGTTNTACATCTCTATTCCTTTNTTG NTGCCTTCTCAAACAGGATGATTG ATGTTATTTAA TAC ANAATATANT ]
[-] EMBL CD075770             [                                                                                                                                                                                                                                                            GAATATACAACAAATCAAAGCATATAACTCTTTTATAGTTGTGTATTCTAATGTCATGTTCGAAAATTAAAATCGGAATATATAGTACAGAAAACAAACTGTTTGTTTTAATTCATTAAGTTTTCAGAATTTCCGATTTGAAAAAAATTTATCAGGTTGCACAACTTTCTCATTCAGTAATTTTAACCACTTTGAATTATCTTATCCCTATCAGTTTTCTTTGATTTTTAAGTGGTTTAATTGAAAGTTTGACTACACATCTCATTTGTCAAATACTTTTCAATTTGATAAAACTGTAATATCAGTCTACTTACAAAGAAAAGTATAGCAATTAAATTTGTATTGCATTTTCAACCTTTCAATCGTTTCTGGATACAGTTTATTCTCAAACTTATATGTAAATAGACTCAGACATCTGAAATCATATAAACTTCA CTTATTTTTCCCTATATACCACAGTTTCATTTTGTTTTACATCTCTATTCCTTTTTTGTTTGCCTTCTCAAACAGGATGATTGAATGTTATTTAATTACAAAAATATATTT]
[+] EMBL AW186591             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGTGTATTCTAATGTCATGTTCGAAAATTAAAATCGGAATATATAGTACAGAAAACAAACTGTTTGTTTTAATTCATTAAGTTTTCAGAATTTCCGATTTGAAAAAAATTTATCAGGTTGCACAACTTTCTCATTCAGTAATTTTAACCACTTTGAATTATCTTATCCCTATCAGTTTTCTTTGATTTTTAAGTGGTTTAATTGAAAGTTTGACTACACATCTCATTTGTCAAATACTTTTCAATTTGAT AAACTGTAATATCAGTCTACTTAC AAGAAATGTATAGC ATTAAATTTGTATTGCATTTTCCACCTTTCAATCGTTTCTGGATACAGTTTATTCTCAACCTTATATGTAAATAGACTCAGACATCTGATCTCATATAATC TCATCTTA TTTCCCCTATACACCAGTGTCTCATTGTGTT CACATCACAACTCCTTTTGTG TCGCC TCAC AACAGGATGATTG A                          ]


>consensus_4733#0 CTCGAGGTCCGATATATATTATTTTCTCCATATAGCTCAGTTAAATGATATGCATGTTTC ATATTAGTTAGTCGAAGCCTAATGAGACATTATAGATTGTTTGACCACGCCCTATGTAAA CTGCGGTTATGACCAGATCATGTTTTCATAATTGGTAACACAGCGATATGAAAGATAAAT AAGTTTTAAGATTGCAAAACAAAAACCGAAAACCATATGACTTGGTTTCAGCGGCTACCC AAATCTGATTCGGAATATACAACAAATCAAAGCATATAACTCTTTTATAGTTGTGTATTC TAATGTCATGTTCGAAAATTAAAATCGGAATATATAGTACAGAAAACAAACTGTTTGTTT TAATTCATTAAGTTTTCAGAATTTCCGATTTGAAAAAAATTTATCAGGTTGCACAACTTT CTCATTCAGTAATTTTAACCACTTTGAATTATCTTATCCCTATCAGTTTTCTTTGATTTT TAAGTGGTTTAATTGAAAGTTTGACTACACATCTCATTTGTCAAATACTTTTCAATTTGA TAAAACTGTAATATCAGTCTACTTACAAAGAAAAGTATAGCAATTAAATTTGTATTGCAT TTTCAACCTTTCAATCGTTTCTGGATACAGTTTATTCTCAAACTTATATGTAAATAGACT CAGACATCTGAAATCATATAAACTTCACTTATTTTTCCCTATATACCACAGTTTCATTNT GTTNTACATCTCTATTCCTTTTTTGTTGCCTTCTCAAACAGGATGATTGATGTTATTTAA TACANAATATANTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)