cluster # 4733

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Schistosoma mansoni
cluster # 4733 cluster # 4733 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4733#0 length = 794 sequences # 3

consensusID : consensus_4733#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 794
fasta sequence

                              [CTCGAGGTCCGATATATATTATTTTCTCCATATAGCTCAGTTAAATGATATGCATGTTTCATATTAGTTAGTCGAAGCCTAATGAGACATTATAGATTGTTTGACCACGCCCTATGTAAACTGCGGTTATGACCAGATCATGTTTTCATAATTGGTAACACAGCGATATGAAAGATAAATAAGTTTTAAGATTGCAAAACAAAAACCGAAAACCATATGACTTGGTTTCAGCGGCTACCCAAATCTGATTCGGAATATACAACAAATCAAAGCATATAACTCTTTTATAGTTGTGTATTCTAATGTCATGTTCGAAAATTAAAATCGGAATATATAGTACAGAAAACAAACTGTTTGTTTTAATTCATTAAGTTTTCAGAATTTCCGATTTGAAAAAAATTTATCAGGTTGCACAACTTTCTCATTCAGTAATTTTAACCACTTTGAATTATCTTATCCCTATCAGTTTTCTTTGATTTTTAAGTGGTTTAATTGAAAGTTTGACTACACATCTCATTTGTCAAATACTTTTCAATTTGATAAAACTGTAATATCAGTCTACTTACAAAGAAAAGTATAGCAATTAAATTTGTATTGCATTTTCAACCTTTCAATCGTTTCTGGATACAGTTTATTCTCAAACTTATATGTAAATAGACTCAGACATCTGAAATCATATAAACTTCA-CTTATTTTTCCCTATATACCACAGTTTCATTNTGTTNTACATCTCTATTCCTTTTTTG-TTGCCTTCTCAAACAGGATGATTG-ATGTTATTTAA-TAC-ANAATATANTT]

[+] EMBL CD082154             [CTCGAGGTCCGATATATATTATTTTCTCCATATAGCTCAGTTAAATGATATGCATGTTTCATATTAGTTAGTCGAAGCCTAATGAGACATTATAGATTGTTTGACCACGCCCTATGTAAACTGCGGTTATGACCAGATCATGTTTTCATAATTGGTAACACAGCGATATGAAAGATAAATAAGTTTTAAGATTGCAAAACAAAAACCGAAAACCATATGACTTGGTTTCAGCGGCTACCCAAATCTGATTCGGAATATACAACAAATCAAAGCATATAACTCTTTTATAGTTGTGTATTCTAATGTCATGTTCGAAAATTAAAATCGGAATATATAGTACAGAAAACAAACTGTTTGTTTTAATTCATTAAGTTTTCAGAATTTCCGATTTGAAAAAAATTTATCAGGTTGCACAACTTTCTCATTCAGTAATTTTAACCACTTTGAATTATCTTATCCCTATCAGTTTTCTTTGATTTTTAAGTGGTTTAATTGAAAGTTTGACTACACATCTCATTTGTCAAATACTTTTCAATTTGATAAAACTGTAATATCAGTCTACTTACAAAGAAAAGTATAGCAATTAAATTTGTATTGCATTTTCAACCTTTCAATCGTTTCTGGATACAGTTTATTCTCAAACTTATATGTAAATAGACTCAGACATCTGAAATCATATAAACTTCA CTTATTTTTCCCTATATACCACAGTTTCATTNTGTTNTACATCTCTATTCCTTTNTTG NTGCCTTCTCAAACAGGATGATTG ATGTTATTTAA TAC ANAATATANT ]
[-] EMBL CD075770             [                                                                                                                                                                                                                                                            GAATATACAACAAATCAAAGCATATAACTCTTTTATAGTTGTGTATTCTAATGTCATGTTCGAAAATTAAAATCGGAATATATAGTACAGAAAACAAACTGTTTGTTTTAATTCATTAAGTTTTCAGAATTTCCGATTTGAAAAAAATTTATCAGGTTGCACAACTTTCTCATTCAGTAATTTTAACCACTTTGAATTATCTTATCCCTATCAGTTTTCTTTGATTTTTAAGTGGTTTAATTGAAAGTTTGACTACACATCTCATTTGTCAAATACTTTTCAATTTGATAAAACTGTAATATCAGTCTACTTACAAAGAAAAGTATAGCAATTAAATTTGTATTGCATTTTCAACCTTTCAATCGTTTCTGGATACAGTTTATTCTCAAACTTATATGTAAATAGACTCAGACATCTGAAATCATATAAACTTCA CTTATTTTTCCCTATATACCACAGTTTCATTTTGTTTTACATCTCTATTCCTTTTTTGTTTGCCTTCTCAAACAGGATGATTGAATGTTATTTAATTACAAAAATATATTT]
[+] EMBL AW186591             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGTGTATTCTAATGTCATGTTCGAAAATTAAAATCGGAATATATAGTACAGAAAACAAACTGTTTGTTTTAATTCATTAAGTTTTCAGAATTTCCGATTTGAAAAAAATTTATCAGGTTGCACAACTTTCTCATTCAGTAATTTTAACCACTTTGAATTATCTTATCCCTATCAGTTTTCTTTGATTTTTAAGTGGTTTAATTGAAAGTTTGACTACACATCTCATTTGTCAAATACTTTTCAATTTGAT AAACTGTAATATCAGTCTACTTAC AAGAAATGTATAGC ATTAAATTTGTATTGCATTTTCCACCTTTCAATCGTTTCTGGATACAGTTTATTCTCAACCTTATATGTAAATAGACTCAGACATCTGATCTCATATAATC TCATCTTA TTTCCCCTATACACCAGTGTCTCATTGTGTT CACATCACAACTCCTTTTGTG TCGCC TCAC AACAGGATGATTG A                          ]




>consensus_4733#0
CTCGAGGTCCGATATATATTATTTTCTCCATATAGCTCAGTTAAATGATATGCATGTTTC
ATATTAGTTAGTCGAAGCCTAATGAGACATTATAGATTGTTTGACCACGCCCTATGTAAA
CTGCGGTTATGACCAGATCATGTTTTCATAATTGGTAACACAGCGATATGAAAGATAAAT
AAGTTTTAAGATTGCAAAACAAAAACCGAAAACCATATGACTTGGTTTCAGCGGCTACCC
AAATCTGATTCGGAATATACAACAAATCAAAGCATATAACTCTTTTATAGTTGTGTATTC
TAATGTCATGTTCGAAAATTAAAATCGGAATATATAGTACAGAAAACAAACTGTTTGTTT
TAATTCATTAAGTTTTCAGAATTTCCGATTTGAAAAAAATTTATCAGGTTGCACAACTTT
CTCATTCAGTAATTTTAACCACTTTGAATTATCTTATCCCTATCAGTTTTCTTTGATTTT
TAAGTGGTTTAATTGAAAGTTTGACTACACATCTCATTTGTCAAATACTTTTCAATTTGA
TAAAACTGTAATATCAGTCTACTTACAAAGAAAAGTATAGCAATTAAATTTGTATTGCAT
TTTCAACCTTTCAATCGTTTCTGGATACAGTTTATTCTCAAACTTATATGTAAATAGACT
CAGACATCTGAAATCATATAAACTTCACTTATTTTTCCCTATATACCACAGTTTCATTNT
GTTNTACATCTCTATTCCTTTTTTGTTGCCTTCTCAAACAGGATGATTGATGTTATTTAA
TACANAATATANTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case