These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_4733#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 794 fasta sequence [CTCGAGGTCCGATATATATTATTTTCTCCATATAGCTCAGTTAAATGATATGCATGTTTCATATTAGTTAGTCGAAGCCTAATGAGACATTATAGATTGTTTGACCACGCCCTATGTAAACTGCGGTTATGACCAGATCATGTTTTCATAATTGGTAACACAGCGATATGAAAGATAAATAAGTTTTAAGATTGCAAAACAAAAACCGAAAACCATATGACTTGGTTTCAGCGGCTACCCAAATCTGATTCGGAATATACAACAAATCAAAGCATATAACTCTTTTATAGTTGTGTATTCTAATGTCATGTTCGAAAATTAAAATCGGAATATATAGTACAGAAAACAAACTGTTTGTTTTAATTCATTAAGTTTTCAGAATTTCCGATTTGAAAAAAATTTATCAGGTTGCACAACTTTCTCATTCAGTAATTTTAACCACTTTGAATTATCTTATCCCTATCAGTTTTCTTTGATTTTTAAGTGGTTTAATTGAAAGTTTGACTACACATCTCATTTGTCAAATACTTTTCAATTTGATAAAACTGTAATATCAGTCTACTTACAAAGAAAAGTATAGCAATTAAATTTGTATTGCATTTTCAACCTTTCAATCGTTTCTGGATACAGTTTATTCTCAAACTTATATGTAAATAGACTCAGACATCTGAAATCATATAAACTTCA-CTTATTTTTCCCTATATACCACAGTTTCATTNTGTTNTACATCTCTATTCCTTTTTTG-TTGCCTTCTCAAACAGGATGATTG-ATGTTATTTAA-TAC-ANAATATANTT] [+] EMBL CD082154 [CTCGAGGTCCGATATATATTATTTTCTCCATATAGCTCAGTTAAATGATATGCATGTTTCATATTAGTTAGTCGAAGCCTAATGAGACATTATAGATTGTTTGACCACGCCCTATGTAAACTGCGGTTATGACCAGATCATGTTTTCATAATTGGTAACACAGCGATATGAAAGATAAATAAGTTTTAAGATTGCAAAACAAAAACCGAAAACCATATGACTTGGTTTCAGCGGCTACCCAAATCTGATTCGGAATATACAACAAATCAAAGCATATAACTCTTTTATAGTTGTGTATTCTAATGTCATGTTCGAAAATTAAAATCGGAATATATAGTACAGAAAACAAACTGTTTGTTTTAATTCATTAAGTTTTCAGAATTTCCGATTTGAAAAAAATTTATCAGGTTGCACAACTTTCTCATTCAGTAATTTTAACCACTTTGAATTATCTTATCCCTATCAGTTTTCTTTGATTTTTAAGTGGTTTAATTGAAAGTTTGACTACACATCTCATTTGTCAAATACTTTTCAATTTGATAAAACTGTAATATCAGTCTACTTACAAAGAAAAGTATAGCAATTAAATTTGTATTGCATTTTCAACCTTTCAATCGTTTCTGGATACAGTTTATTCTCAAACTTATATGTAAATAGACTCAGACATCTGAAATCATATAAACTTCA CTTATTTTTCCCTATATACCACAGTTTCATTNTGTTNTACATCTCTATTCCTTTNTTG NTGCCTTCTCAAACAGGATGATTG ATGTTATTTAA TAC ANAATATANT ] [-] EMBL CD075770 [ GAATATACAACAAATCAAAGCATATAACTCTTTTATAGTTGTGTATTCTAATGTCATGTTCGAAAATTAAAATCGGAATATATAGTACAGAAAACAAACTGTTTGTTTTAATTCATTAAGTTTTCAGAATTTCCGATTTGAAAAAAATTTATCAGGTTGCACAACTTTCTCATTCAGTAATTTTAACCACTTTGAATTATCTTATCCCTATCAGTTTTCTTTGATTTTTAAGTGGTTTAATTGAAAGTTTGACTACACATCTCATTTGTCAAATACTTTTCAATTTGATAAAACTGTAATATCAGTCTACTTACAAAGAAAAGTATAGCAATTAAATTTGTATTGCATTTTCAACCTTTCAATCGTTTCTGGATACAGTTTATTCTCAAACTTATATGTAAATAGACTCAGACATCTGAAATCATATAAACTTCA CTTATTTTTCCCTATATACCACAGTTTCATTTTGTTTTACATCTCTATTCCTTTTTTGTTTGCCTTCTCAAACAGGATGATTGAATGTTATTTAATTACAAAAATATATTT] [+] EMBL AW186591 [ TGTGTATTCTAATGTCATGTTCGAAAATTAAAATCGGAATATATAGTACAGAAAACAAACTGTTTGTTTTAATTCATTAAGTTTTCAGAATTTCCGATTTGAAAAAAATTTATCAGGTTGCACAACTTTCTCATTCAGTAATTTTAACCACTTTGAATTATCTTATCCCTATCAGTTTTCTTTGATTTTTAAGTGGTTTAATTGAAAGTTTGACTACACATCTCATTTGTCAAATACTTTTCAATTTGAT AAACTGTAATATCAGTCTACTTAC AAGAAATGTATAGC ATTAAATTTGTATTGCATTTTCCACCTTTCAATCGTTTCTGGATACAGTTTATTCTCAACCTTATATGTAAATAGACTCAGACATCTGATCTCATATAATC TCATCTTA TTTCCCCTATACACCAGTGTCTCATTGTGTT CACATCACAACTCCTTTTGTG TCGCC TCAC AACAGGATGATTG A ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||