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Schistosoma mansoni
cluster # 4750 cluster # 4750       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4750#0 length = 589 sequences # 3  

consensusID : consensus_4750#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 589
fasta sequence
                              [AGACCACTGAGCGGCATCCATACATCTTTGGAACTCATTTTATGATACACATAAGATGTACATTTATGTACTTATTTTTCTTGATTTTCGCTGACTTTGAATTGTGACAATTTGAATCGATGTGCTTCCTTGGTTTGTTTGAGACTTTCTAACAGTTCTGATATCCATGAGTCTATTCTCTGACTGGAATTAAAATATCCCAGGCTTGTACTATTTAGTTGCTATTGGTGATGTAAATAATATGTAGAGTTGTTGTCATTTTGTACCCTCCCCCCAAATGTTCTAATTTGTTTCGTGTGAATGAGAATTGAAAAACTAAAACAAACATGTAATGTTTTGTATCTCAATCAGCTATTTTTGATGAGTTCATTATTAGAAATGACTTTTAAAGTCAGCAATAGCATGTAAAATGCTTATAACTGTCATAAGACAATACTTAGCATTCGATAGGTCACAGAAGCTCTTTCAATAAGCGTGAAATAATATGGAACTTCTTATTGTGTAATTTAGTTGTTGAATTCGTGAGTCTATTTAAGCTAGGCCACCATTGAAACCTGNAAGCACTGGACGGCCGTTTCGTTCTAGTATG]

[+] EMBL CD198159             [AGACCACTGAGCGGCATCCATACATCTTTGGAACTCATTTTATGATACACATAAGATGTACATTTATGTACTTATTTTTCTTGATTTTCGCTGACTTTGAATTGTGACAATTTGAATCGATGTGCTTCCTTGGTTTGTTTGAGACTTTCTAACAGTTCTGATATCCATGAGTCTATTCTCTGACTGGAATTAAAATATCCCAGGCTTGTACTATTTAGTTGCTATTGGTGATGTAAATAATATGTAGAGTTGTTGACATTTTGTACCCTCCCCCCAAATGTTCTAATTTGTTTCGTGTGAATGAGAATTGAAAAACTAAAACAAACATGTAATGTTTTGTATCTCAATCAGCTATTTTTGATGAGTTCATTATTAGAAATGACTTTTAAAGTCAGCAATAGCATGTAAAATGCTTATAACTGTCATAAGACAATACTTAGCATTCGATAGGTCACAGAAGCTCTTTCAATAAGCGTGAAATAATATGGAACTTCTTATTGTGTAATTTAGTTGTTGAATTCGTGAGTCTATTTAAGCTAGGCCACCATTGAAACCTGNAAGCACTGGACGGNCGTTTCNGTCTAGTATG]
[+] EMBL CD198191             [AGACCACTGAGCGGCATCCATACATCTTTGGAACTCATTTTATGATACACATAAGATGTACATTTATGTACTTATTTTTCTTGATTTTCGCTGACTTTGAATTGTGACAATTTGAATCGATGTGCTTCCTTGGTTTGTTTGAGACTTTCTAACAGTTCTGATATCCATGAGTCTATTCTCTGACTGGAATTAAAATATCCCAGGCTTGTACTATTTAGTTGCTATTGGTGATGTAAATAATATGTAGAGTTGTTGTCATTTTGTACCCTCCCCCCAAATGTTCTAATTTGTTTCGTGTGAATGAGAATTGAAAAACTAAAACAAACATGTAATGTTTTGTATCTCAATCAGCTATTTTTGATGAGTTCATTATTAGAAATGACTTTTAAAGTCAGCAATAGCATGTAAAATGCTTATAACTGTCATAAGACAATACTTAGCATTCGATAGGTCACAGAAGCTCTTTCAATAAGCGTGAAGTAATATGGAACTTCTTATTGTGTAATTTAGTTGTTGAATTCGTGAGTCTATTTAAGCTAGGCCACCATTGAAACCTGNAAGCACTGGACGGCCGTTNCGTTCTAGTATG]
[+] EMBL CD198109             [AGACCACTGAGCGGCATCCATACATCTTTGGAACTCATTTTATGATACACATAAGATGTACATTTATGTACTTATTTTTCTTGATTTTCGCTGACTTTGAATTGTGACAATTTGAATCGATGTGCTTCCTTGGTTTGTTTGAGACTTTCTAACAGTTCTGATATCCATGAGTCTATTCTCTGACTGGAATTAAAATATCCCAGGCTTGTACTATTTAGTTGCTATTGGTGATGTAAATAATATGTAGAGTTGTTGTCATTTTGTACCCTCCCCCCAAATGTTCTAATTTGTTTCGTGTGAATGAGAATTGAAAAACTAAAACAAACATGTAATGTTTTGTATCTCAATCAGCTATTTTTGATGAGTTCATTATTAGAAATGACTTTTAAAGTCAGCAATAGCATGTAAAATGCTTATAACTGTCATAAGACAATACTTAGCATTCGATAGGTCACAGAAGCTCTTTCAATAAGCGTGAAATAATATGGAACTTCTTATTGTGTAATTTAGTTGTTGAATTCGTGAGTCTATTTAAGCTAGGCCACCATTGAAACCTGNAAGCACTGGACGGCCGTTTCGTTCTAGTATG]


>consensus_4750#0 AGACCACTGAGCGGCATCCATACATCTTTGGAACTCATTTTATGATACACATAAGATGTA CATTTATGTACTTATTTTTCTTGATTTTCGCTGACTTTGAATTGTGACAATTTGAATCGA TGTGCTTCCTTGGTTTGTTTGAGACTTTCTAACAGTTCTGATATCCATGAGTCTATTCTC TGACTGGAATTAAAATATCCCAGGCTTGTACTATTTAGTTGCTATTGGTGATGTAAATAA TATGTAGAGTTGTTGTCATTTTGTACCCTCCCCCCAAATGTTCTAATTTGTTTCGTGTGA ATGAGAATTGAAAAACTAAAACAAACATGTAATGTTTTGTATCTCAATCAGCTATTTTTG ATGAGTTCATTATTAGAAATGACTTTTAAAGTCAGCAATAGCATGTAAAATGCTTATAAC TGTCATAAGACAATACTTAGCATTCGATAGGTCACAGAAGCTCTTTCAATAAGCGTGAAA TAATATGGAACTTCTTATTGTGTAATTTAGTTGTTGAATTCGTGAGTCTATTTAAGCTAG GCCACCATTGAAACCTGNAAGCACTGGACGGCCGTTTCGTTCTAGTATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)