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Schistosoma mansoni
cluster # 4751 cluster # 4751       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4751#0 length = 916 sequences # 3  

consensusID : consensus_4751#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 916
fasta sequence
                              [CTGTATCATCGTGTATACATATCCGTCTACATGCAATGATGATAATCATAATGATAATAATAGCTGTCATGTTAATCACATGGAAAATAATACATTATCAACAAATACTATTCATAAGATAGTTAATAATGAAGAAAATGCTGATAACTGTCATCATCATCATGAATATCATAAACATAAAAATCGTCAATATCAACGTCAAGATAATGGATTAATGTCATTGACATCATGCAATTCTATTCCACTTCCATTTATGCTTATTCCTACAAGTGAATTAGCTTCAGGTGGTTCACTTACATGTACAGTTGTTAATATCTTGCGTTGTTTAGGTTTATTGGACCGTTGTGGGGTGGAAGATTTATGCGCAATATTATATGATTTCTGGAATAATAATTGTCATGCTCCATTTTATCCAGCTCATTCTTTTTTTAACTCATATGTTATATATCCAACATGTTGGGAATTATCACGTATGGAAGAATCTGTGGTAACACGATCATCCTCTTTTACATCATGCACTTTAGTTGATTCAAGGCGATCAACAGTACCTGGTGAGGATTATGAAAGAAATTATCAAATGTTAATAAATTGTCGTGAAAGTAAACCGTTAAATGGAAGCTGTTTAGTTAGTTATTTATTATCTTGCAGTTATATGGGTACAAGTTTCCTTGCTTCACACCCAATATATAATTTGAATAATTTGTCTTCACCTTGTTGTCTACGTCCATCGACAAGTTGCTGTTATTTTGTAATGGACAGAACTAATCAAATTTCGCCTTATAATACACCGGCAATTTATCATCCTAATTTAATTCAACCAATTTCTAATTCAAATATGAATTGGCGTAGAGGTTGTGCTGATAATCTTGTTCTTATGCTTACTCATCATAGTTCTGGTTCTAAAATACGTCTTCAG]

[+] EMBL CD111227             [CTGTATCATCGTGTATACATATCCGTCTACATGCAATGATGATAATCATAATGATAATAATAGCTGTCATGTTAATCACATGGAAAATAATACATTATCAACAAATACTATTCATAAGATAGTTAATAATGAAGAAAATGCTGATAACTGTCATCATCATCATGAATATCATAAACATAAAAATCGTCAATATCAACGTCAAGATAATGGATTAATGTCATTGACATCATGCAATTCTATTCCACTTCCATTTATGCTTATTCCTACAAGTGAATTAGCTTCAGGTGGTTCACTTACATGTACAGTTGTTAATATCTTGCGTTGTTTAGGTTTATTGGACCGTTGTGGGGTGGAAGATTTATGCGCAATATTATATGATTTCTGGAATAATAATTGTCATGCTCCATTTTATCCAGCTCATTCTTTTTTTAACTCATATGTTATATATCCCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD078853             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTTGCGTTGTTTAGGTTTATTGGACCGTTGTGGGGTTGAAGATTTATGTGCAATATTATATGATTTCTGGAATAATAATTGTCATGCTCCATTTCTTCCAGATCATCCTTTTTTTAAATCACATGTTATATATCCAACATGTTGGGAATTATCACGTATGGAAGAATCTGTGGTAACACGATCATCCTCTTTTACATCATGCACTTTAGTTGATTCAAGGCGATCAACAGTACCTGGTGAGGATTATGAAAGAAATTATCAAATGTTAATAAATTGTCGTGAAAGTAAACCGTTAAATGGAAGCTGTTTAGTTAGTTATTTATTATCTTGCAGTTATATGGGTACAAGTTTCCTTGCTTCACACCCAATATATAATTTGAATAATTTGTCTTCACCTTGTTGTCTACGTCCATCGACAAGTTGCTGTTATTTTGTAATGGACAGAACTAATCAAATTTCGCCTTATAATACACCGGCAATTTATCATCCTAATTTAATTCAACCAATTTCTAATTCAAATATGAATTGGCGTAGAGGTTGTGCTGATAATCTTGTTCTTATGCTTACTCATCATAGTTCTGGTTCTAAAATACGTCTTCAG]
[-] EMBL CD098440             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTGCG TGTTTAGGTTTATTAGACCGTTGTGGGGTGGAAGATTTATGCGCAATATTATATGATTTCTGGAATAATAATTGTCATGCTCCATTTTATCCAGCTCATTCTTTTTTTAACTCATATGTTATATATCCAACATGTTGGGAATTATCACGTATGGAAGAATCAGTGGTAACACGATCATCCTCTTTTACTTCATGCACTTTAGTTGATTCAAGGCGATCAACAGTACCTGGGGAGGATTATGAAAGGAATTATCAAATGTTAATAAATTGTCGTGAAAGTAAACCGTTAAATGGAAGTTGTTTAGTTAGTTATTTATTATCTTGCAGTTATATGGGTACAAGTTTTCTTGCTTCACACCCAATATATAATTTGAATAAT                                                                                                                                                                                                                        ]


>consensus_4751#0 CTGTATCATCGTGTATACATATCCGTCTACATGCAATGATGATAATCATAATGATAATAA TAGCTGTCATGTTAATCACATGGAAAATAATACATTATCAACAAATACTATTCATAAGAT AGTTAATAATGAAGAAAATGCTGATAACTGTCATCATCATCATGAATATCATAAACATAA AAATCGTCAATATCAACGTCAAGATAATGGATTAATGTCATTGACATCATGCAATTCTAT TCCACTTCCATTTATGCTTATTCCTACAAGTGAATTAGCTTCAGGTGGTTCACTTACATG TACAGTTGTTAATATCTTGCGTTGTTTAGGTTTATTGGACCGTTGTGGGGTGGAAGATTT ATGCGCAATATTATATGATTTCTGGAATAATAATTGTCATGCTCCATTTTATCCAGCTCA TTCTTTTTTTAACTCATATGTTATATATCCAACATGTTGGGAATTATCACGTATGGAAGA ATCTGTGGTAACACGATCATCCTCTTTTACATCATGCACTTTAGTTGATTCAAGGCGATC AACAGTACCTGGTGAGGATTATGAAAGAAATTATCAAATGTTAATAAATTGTCGTGAAAG TAAACCGTTAAATGGAAGCTGTTTAGTTAGTTATTTATTATCTTGCAGTTATATGGGTAC AAGTTTCCTTGCTTCACACCCAATATATAATTTGAATAATTTGTCTTCACCTTGTTGTCT ACGTCCATCGACAAGTTGCTGTTATTTTGTAATGGACAGAACTAATCAAATTTCGCCTTA TAATACACCGGCAATTTATCATCCTAATTTAATTCAACCAATTTCTAATTCAAATATGAA TTGGCGTAGAGGTTGTGCTGATAATCTTGTTCTTATGCTTACTCATCATAGTTCTGGTTC TAAAATACGTCTTCAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)