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Schistosoma mansoni
cluster # 4761 cluster # 4761       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4761#0 length = 1161 sequences # 3  

consensusID : consensus_4761#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1161
fasta sequence
                              [CANAAATTATTAAAACGTAAAGAAGAATTAGATTTAGGTTGTCAAGCAATTACAAGATTTAATGAATGCATTAGATCATCAAAAATATGAAGCTATTCAATTAACATTTAAACAGGTATCTAAAAATTTCCAAGATATTTTCAAACGACTTGTACCTGAAGGTCGTGCAGAATTGGTAATGAAAAAAGGTGTCCGCCAAGAAGGTGAAGGTAGTAGTGATGAAGATGGTGGTGCTGATAGTAGTGTTATTCCCGATGTTGAACGATTTATTGGAGTTGGTATACGTGTTAGTTTTACTGGTGATTCAGCTGATATGCGTGATATGAATCAATTATCCGGTGGACAAAAATCACTAGTTGCTTTAACTTTAATTTTTGCCATTCAAAAGTGTGATCCAGCACCATTTTATTTGTTTGATGAAATTGATGCCGCATTAGATGCACAATATCGTAAAGCTGTTGCTGATATGATTAAAGATTTAAAATCGGAAGCACAATTTATTACTACAACATTTCGACCTGAATTATTAGAATCAGCTGAAAAATTCTATGGTGTAAAATTCCGTAATAAAGTTAGTCATATTGAATGCGTAACTAAAGGTGAAGCACTTGATTTTGTTGAAGATGATCAAACACATGGATAATTTTTATATGATCATCTTTGTGTTTCATGTATACACTACCTGTTTCATTCTCTGTCCTCTTCAATCATATGGAAAGGATATTTATCTACTTGTCTTGTATATATCGTCGTCATCATCAAAAACAAATAAGTAAAACACCTTAATACTCATAATAATGAACAAACTGACAATTACGATGTTGTTATTATTGTTTGTTTGTTATCTAATAATAGTTATAAATCAATTTGGCATTTAACGGAACTTCTCCGTAAAAAGAAACAACAACAACAACAACCGATTACAGTTGAATGTATATTACCCATTTGATTGTTTTTTGTAATATTTCCACGTAATAAATACACAAAACATCCTATAAACTGATTAATTATTCCCATCTCTTTAATGTCTGCCCTATTCAATATTCATCTTTATCTGTACTCTACACTTTGCATTTACTTTTTGTTAAAGATTGTTCTGATATTTGTTGGTTTGTTTTTTACTCATATAAAATATTTTGTATACCCTATATATAATAATAT]

[+] EMBL CD082265             [CANAAATTATTAAAACGTAAAGAAGAATTAGATTTAGGTTGTCAAGCAATTACAAGATTTAATGAATGCATTAGATCATCAAAAATATGAAGCTATTCAATTAACATTTAAACAGGTATCTAAAAATTTCCAAGATATTTTCAAACGACTTGTACCTGAAGGTCGTGCAGAATTGGTAATGAAAAAAGGTGTCCGCCAAGAAGGTGAAGGTAGTAGTGATGAAGATGGTGGTGCTGATAGTAGTGTTATTCCCGATGTTGAACGATTTATTGGAGTTGGTATACGTGTTAGTTTTACTGGTGATTCAGCTGATATGCGTGATATGAATCAATTATCCGGTGGACAAAAATCACTAGTTGCTTTAACTTTAATTTTTGCCATTCAAAAGTGTGATCCAGCACCATTTTATTTGTTTGATGAAATTGATGCCGCATTAGATGCACAATATCGTAAAGCTGTTGCTGATATGATTAAAGATTTAAAATCGGAAGCACAATTTATTACTACAACATTTCGACCTGAATTATTAGAATCAGCTGAAAAATTCTATGGTGTAAAATTCCGTAATAAAGTTAGTCATATTGAATGCGTAACTAAAGGTGAAGCACTTGATTNTGTTGAAGATGATCAAACAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD160960             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAGTTTTACTGGTGATTCAGCTGATATGCGTGATATGAATCAATTATCCGGTGGACAANAATCACTAGTTGCTTTAACTTTAATTTTTGCCATTCAAAAGTGTGATCCAGCACCATTTTATTTGTTTGATGAAATTGATGTCGCATTAGATGCACAATATCGTAAAGCTGTTGCTGATATGATTAAAGATTTAAAATCGGAAGCACAATTTATTACTACAACATTTCGACCTGAATTATTAGAATCAGCTGAAAAATTCTATGGTGTAAAATTCCGTAATAAAGTTAGTCATATTGAATGCGTAACTAAAGGTGAAGCACTTGATTTTGTTGAAGATGATCAAACACATGGATAATTTTTATATGATCATCTTTGTGTTTCATGTATACACTACCTGTTTCATTCTCTGTCCTCTTCAATCATATGGAAAGGATATTTATCTACTTGTCTTGTATATATCGTCGTCATCATCAAAAACAAATAAGTAAAACACCTTAATACTCATAATAATGAACAAACTGACAATTACGATGTTGTTATTATTGTTTGTTTGTTATCTAATAATAGTTATAAATCAATTTGGCATTTAACGGAACTTCTCCGTAAAAAGAAACAA                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD075872             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATAAAGTTAGTCATATTGAATGCGTAACTAAAGGTGAAGCACTTGATTTTGTTGAAGATGATCAAACACATGGATAATTTTTATATGATCATCTTTGTGTTTCATGTATACACTACCTGTTTCATTCTCTGTCCTCTTCAATCATATGGAAAGGATATTTATCTACTTGTCTTGTATATATCGTCGTCATCATCAAAAACAAATAAGTAAAACACCTTAATACTCATAATAATGAACAAACTGACAATTACGATGTTGTTATTATTGTTTGTTTGTTATCTAATAATAGTTATAAATCAATTTGGCATTTAACGGAACTTCTCCGTAAAAAGAAACAACAACAACAACAACCGATTACAGTTGAATGTATATTACCCATTTGATTGTTTTTTGTAATATTTCCACGTAATAAATACACAAAACATCCTATAAACTGATTAATTATTCCCATCTCTTTAATGTCTGCCCTATTCAATATTCATCTTTATCTGTACTCTACACTTTGCATTTACTTTTTGTTAAAGATTGTTCTGATATTTGTTGGTTTGTTTTTTACTCATATAAAATATTTTGTATACCCTATATATAATAATAT]


>consensus_4761#0 CANAAATTATTAAAACGTAAAGAAGAATTAGATTTAGGTTGTCAAGCAATTACAAGATTT AATGAATGCATTAGATCATCAAAAATATGAAGCTATTCAATTAACATTTAAACAGGTATC TAAAAATTTCCAAGATATTTTCAAACGACTTGTACCTGAAGGTCGTGCAGAATTGGTAAT GAAAAAAGGTGTCCGCCAAGAAGGTGAAGGTAGTAGTGATGAAGATGGTGGTGCTGATAG TAGTGTTATTCCCGATGTTGAACGATTTATTGGAGTTGGTATACGTGTTAGTTTTACTGG TGATTCAGCTGATATGCGTGATATGAATCAATTATCCGGTGGACAAAAATCACTAGTTGC TTTAACTTTAATTTTTGCCATTCAAAAGTGTGATCCAGCACCATTTTATTTGTTTGATGA AATTGATGCCGCATTAGATGCACAATATCGTAAAGCTGTTGCTGATATGATTAAAGATTT AAAATCGGAAGCACAATTTATTACTACAACATTTCGACCTGAATTATTAGAATCAGCTGA AAAATTCTATGGTGTAAAATTCCGTAATAAAGTTAGTCATATTGAATGCGTAACTAAAGG TGAAGCACTTGATTTTGTTGAAGATGATCAAACACATGGATAATTTTTATATGATCATCT TTGTGTTTCATGTATACACTACCTGTTTCATTCTCTGTCCTCTTCAATCATATGGAAAGG ATATTTATCTACTTGTCTTGTATATATCGTCGTCATCATCAAAAACAAATAAGTAAAACA CCTTAATACTCATAATAATGAACAAACTGACAATTACGATGTTGTTATTATTGTTTGTTT GTTATCTAATAATAGTTATAAATCAATTTGGCATTTAACGGAACTTCTCCGTAAAAAGAA ACAACAACAACAACAACCGATTACAGTTGAATGTATATTACCCATTTGATTGTTTTTTGT AATATTTCCACGTAATAAATACACAAAACATCCTATAAACTGATTAATTATTCCCATCTC TTTAATGTCTGCCCTATTCAATATTCATCTTTATCTGTACTCTACACTTTGCATTTACTT TTTGTTAAAGATTGTTCTGATATTTGTTGGTTTGTTTTTTACTCATATAAAATATTTTGT ATACCCTATATATAATAATAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)