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Schistosoma mansoni
cluster # 4780 cluster # 4780       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4780#0 length = 714 sequences # 3  

consensusID : consensus_4780#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 714
fasta sequence
                              [TTTTGTGATTTGTCGCATGATGAATGGTACCGGTGTTTTCATTGTTAGCGCATTACGTAGTCCTATCGGTCGAATGTTCGGTTGTTTATCCGGTTTATCAGCTCATCAATTAGGCGGTCAAGTAATTTCATCTGTATTGGATAATGTTGTGGAGAATTCAAATAATCCAAAAGAATTAAAAAATCACATTATGGAACATTTGGAAGAAGTGATTCTTGGTCAAGTGTTAACAACATCTACTGGACAGAATCCTGCTAGACAAGCTGCTATATTAGCTGGAATTCCTTATTGTGTGCCTGCTTGGAGTGTGAATATGATGTGCGGATCAGNGTTGAAGTCTGTTTG-TTAGGTTTTGATCGGTTAAGTCTTCCTTCCTCGGTGGATGGGGGTTGGGTAATAGCTGGTGGACAAGAATCAATGAGTCAAGCACCACATGCGACTCCTCCTAGAGCATGTTTACGTCGTGCAGGGGGTCAAAATACTTCAGAGCTTCCAAATTATGGTAGTTTCACCTTACTAGATACGATTATGAATGATGCTTTAATGGATGCGTTCTGTAATCTCCCTATGGGTGGAACGGCTGAAAATGTTGCAAAAAGATTTGGAATTAGCCGAGAAGAACAAGATTTATTCGCTTTAAGGTCACAAGAAAAATATGCAGCCGCTCTGAAAGCTGGTCATTTTATCAATGAAATAACACCAATTAAAGTCCCA]

[-] EMBL CD199921             [TTTTGTGATTTGTCGCATGATGAATGGTACCGGTGTTTTCATTGTTAGCGCATTACGTAGTCCTATCGGTCGAATGTTCGGTTGTTTATCCGGTTTATCAGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD196287             [                ATGATGAATGGTACCGGTGTTTTCATTGTTAGCGCATTACGTAGTCCTATCGGTCGAATGTCTGGTTGTTTATCCGGTTTATCAGCTCATCAATTAGGCGGTCAAGTAATTTCATCTGTATTGGATAATGTTGTGGAGAATTCAAATAATCCAAAAGAATTAAAAAATCACATTATGGAACATTTGGAAGAAGTGATTCTTGGTCAAGTGTTAACAACATCTACTGGACAGAATCCTGCTAGACAAGCTGCTATATTAGCTGGAATTCCTTATTGTGTGCCTGCTTGGAGTGTGAATATGATGTGCGGATCAGNGTTGAAGTCTGTTTG TTAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD190797             [                                                                                                                                                                                                                                                          CCTGCTAGACAAGCTGCTATATTAGCTGGAATTCCTTATTGTGTGCCTGCTTGGAGTGTGAATATGATGTGCGGATCAGGTTTGAAGTCTGTTTGTTTAGGTTTTGATCGGTTAAGTCTTCCTTCCTCGGTGGATGGGGGTTGGGTAATAGCTGGTGGACAAGAATCAATGAGTCAAGCACCACATGCGACTCCTCCTAGAGCATGTTTACGTCGTGCAGGGGGTCAAAATACTTCAGAGCTTCCAAATTATGGTAGTTTCACCTTACTAGATACGATTATGAATGATGCTTTAATGGATGCGTTCTGTAATCTCCCTATGGGTGGAACGGCTGAAAATGTTGCAAAAAGATTTGGAATTAGCCGAGAAGAACAAGATTTATTCGCTTTAAGGTCACAAGAAAAATATGCAGCCGCTCTGAAAGCTGGTCATTTTATCAATGAAATAACACCAATTAAAGTCCCA]


>consensus_4780#0 TTTTGTGATTTGTCGCATGATGAATGGTACCGGTGTTTTCATTGTTAGCGCATTACGTAG TCCTATCGGTCGAATGTTCGGTTGTTTATCCGGTTTATCAGCTCATCAATTAGGCGGTCA AGTAATTTCATCTGTATTGGATAATGTTGTGGAGAATTCAAATAATCCAAAAGAATTAAA AAATCACATTATGGAACATTTGGAAGAAGTGATTCTTGGTCAAGTGTTAACAACATCTAC TGGACAGAATCCTGCTAGACAAGCTGCTATATTAGCTGGAATTCCTTATTGTGTGCCTGC TTGGAGTGTGAATATGATGTGCGGATCAGNGTTGAAGTCTGTTTGTTAGGTTTTGATCGG TTAAGTCTTCCTTCCTCGGTGGATGGGGGTTGGGTAATAGCTGGTGGACAAGAATCAATG AGTCAAGCACCACATGCGACTCCTCCTAGAGCATGTTTACGTCGTGCAGGGGGTCAAAAT ACTTCAGAGCTTCCAAATTATGGTAGTTTCACCTTACTAGATACGATTATGAATGATGCT TTAATGGATGCGTTCTGTAATCTCCCTATGGGTGGAACGGCTGAAAATGTTGCAAAAAGA TTTGGAATTAGCCGAGAAGAACAAGATTTATTCGCTTTAAGGTCACAAGAAAAATATGCA GCCGCTCTGAAAGCTGGTCATTTTATCAATGAAATAACACCAATTAAAGTCCCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)