Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4820 cluster # 4820       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4820#0 length = 527 sequences # 3  

consensusID : consensus_4820#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 527
fasta sequence
                              [TCTTCAGAGCCTCCTGATAATTCATCAACTTCATTAGTATCAAATTCAGTTAGTAATCAGACAGTTGCTTGCAAACTGGAACCTGATGCTCCGGAGGATCCTAATCCTGGTATCTCTGCTGCTGCTGCAGCTAGTGTTTCTGATTCAGAAATGGATGAAATCAAGCCTAAACTTTCACCACCATCTCATGATTTATCTCAGTCAGCTATCATAGATAACTGTCACAATGATATCAATGGTAATATTGAATTATCTAGTCAAACAGACCTTGTTGGTAATCGTATTGATTCGCCGTGTACACCTTCACAATATATTAATAATACTATTATGGACAATAACAACAATGATTTAAATTTTGACAATAACAATGAAATACCAGAATTATTAGTGAATAATTCAATTAATTTTGTAAAAAATGTTTTAAATACTCAACCAATTGTAGCATTGTCAGCATTAACAAAAATCTATCAGCAACAGTTAGGTAATTTTGATGCAAATTTCTATTCTACACTTTGGAAGAATAGTCC]

[+] EMBL CD132928             [TCTTCAGAGCCTCCTGATAATTCATCAACTTCATTAGTATCAAATTCAGTTAGTAATCAGACAGTTGCTTGCAAACTGGAACCTGATGCTCCGGAGGATCCTAATCCTGGTATCTCTGCTGCTGCTGCAGCTAGTGTTTCTGATTCAGAAATGGATGAAATCAAGCCTAAACTTTCACCACCATCTCATGATTTATCTCAGTCAGCTATCATAGATAACTGTCACAATGATATCAACGGTAATATTGAATTATCTAGTCAAACAGACCTTGTTGGTAATCGTATTGATTCGCCGTGTACACCTTCACAATATATTAATAATACTATTATGGACAATAACAACAATGATTTAAATTTTGACAATAACAATGAAATACCAGAATTATTAATGAATAATTCAATTAATTTTGTAAAAAATGTTTTAAATACTCAACCAATTGTAGCATTGTCAGCATTAACAAAAATCTATCAGCAACAGTTAGGTAATTTTGATGCANATTTCTATTCTACACTTTGGAAGAATAGTCC]
[+] EMBL CD086244             [                                                                                                           TGGTATCTCTGCTGCTGCTGCAGCTAGTGTTTCTGATTCAGAAATGGATGAAATCAAGCCTAAACTTTCACCACCATCTCATGATTTATCTCAGTCAGCTATCATAGATAACTGTCACAATGATATCAATGGTAATATTGAATTATCTAGTCAAACAGACCTTGTTGGTAATCGTATTGATTCGCCGTGTACACCTTCACAATATATTAATAATACTATTATGGACAATAACAACAATGATTTAAATTTTGACAATAACAATGAAATACCAGAATTATTAGTGAATAATTCAATTAATTTTGTAAAAAATGTTTTAAATACTCAACCAATCGTAGCATTGTCAGCATTAACAAAAATCTATCAGCAACAGTTAGGTAATTTTGATGCAAATTTCTATTCTACACTTT             ]
[-] EMBL CD095607             [                                                                                                            gaTATCTCTGCTGCTGCTGCAGCTAGTGTTTCTGATTCAGAAATGGATGAAATCAAGCTTAATCTTTCACCACCATCTCATGATTTATCTCAGTCAGCTATCATAGATAGCTGTCACAATGATATCAGTGGTAATATTGAATTATCTAGTCAAACAGCCCTTGTTGGTAATCGTATTGATTCGCCGTGTACCCCTTCACAATATATTAATAATACTATTATGCACAATAACAACAATGATTTAAATTTTGACAATAACAATGAAATCCCAGAATTATTAGTGAATAATTCAATTAATTGTGTAAAAAATGTTTTAAATACTCACCCAATTGTAGCATTGTCAGCATTAACAAAAATCTATCAGCAACAGTTAGGTAATTTTGATGCAAATTTCTATTCTACACTTTG            ]


>consensus_4820#0 TCTTCAGAGCCTCCTGATAATTCATCAACTTCATTAGTATCAAATTCAGTTAGTAATCAG ACAGTTGCTTGCAAACTGGAACCTGATGCTCCGGAGGATCCTAATCCTGGTATCTCTGCT GCTGCTGCAGCTAGTGTTTCTGATTCAGAAATGGATGAAATCAAGCCTAAACTTTCACCA CCATCTCATGATTTATCTCAGTCAGCTATCATAGATAACTGTCACAATGATATCAATGGT AATATTGAATTATCTAGTCAAACAGACCTTGTTGGTAATCGTATTGATTCGCCGTGTACA CCTTCACAATATATTAATAATACTATTATGGACAATAACAACAATGATTTAAATTTTGAC AATAACAATGAAATACCAGAATTATTAGTGAATAATTCAATTAATTTTGTAAAAAATGTT TTAAATACTCAACCAATTGTAGCATTGTCAGCATTAACAAAAATCTATCAGCAACAGTTA GGTAATTTTGATGCAAATTTCTATTCTACACTTTGGAAGAATAGTCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)