cluster # 4829

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Schistosoma mansoni
cluster # 4829 cluster # 4829 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4829#0 length = 537 sequences # 3

consensusID : consensus_4829#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 537
fasta sequence

                              [AAANTATNGCCTCGGGGAGATTCGTAATTATGTTGAACAAAGTAAGGACATTTATCCATACAGTTGACATTTTAGATACAGAAAATATGGAATCAGTATGCATTCAAAAATCCTGTTAACGAGTGCTCAGTAGCTAAGACTTGTTCACTGAACAATATTAGGAGATAGTAACTAAAATGTTATGGTAATTGATACAAGTCGACGCAACTGGTAATTAATCTAATCGTGTCCAATGATGAATTGTCGGACCTGAATACTCATATATTACGGAACCTTAAAAACACCCCCCGTTAGTGTTAGTTTAAATGTTTCCTATACATTGACAACGAATGTAGCTTTTGGTTAAAATTGTAAGCTGGTCTGTAAATAAGCTGTTTTATCGGTGATCCCTAGGCTTATATTGATTAGAGCATCTGTTCTCATTTTAGCTACATGGAATAACTAGAAAAGTCTTAGTGTTGTAAAATCTATGACTACTATTCTTAGCAGTTTATCTCACCTGTGATATTCAATCACTTCAGAAGTTTGAATTTGATT]

[+] EMBL CD091638             [AAANTATNGCCTCGGGGAGATTCGTAATTATGTAGAACAAAGTAAGGACATTTATCCATACAGTTGACATTTTAGATACAGAAAATATGGAATCAGTTTGCtggtata                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD091669             [                            TATGTTGAACAAAGTAAGGACATTTATCCATACAGTTGACATTTTAGATACAGAAAATATGGAATCAGTATGCATTCAAAAATCCTGTTAACGAGTGCTCAGTAGCTAAGACTTGTTCACTGAACAATATTAGGAGATAGTAACTAAAATGTTATGGTAATTGATACAAGTCGACGCAACTGGTAATTAATCTAATCGTGTCCAATGATGAATTGTCGGACCTGAATACTCATATATTACGGAACCTTAAAAACACCCCCCGTTAGTGTTAGTTTAAATGTTTCCTATACATTGACAACGAATGTAGCTTTTGGTTAAAATTGTAAGCTGGTCTGTAAATAAGCTGTTTTATCGGTGATCCCTAGGCTTATATTGATTAGAGCATCTGTTCTCATTTTAGCTACATGGAATAACTAGAAAAGTCTTAGTGTTGTAAAATCTATGACTACTATTCTTAGCAGTTTATCTCACCTGTGATATTCAATCACTTCAGAAGTTTGAATTTGATT]
[+] EMBL CD091650             [                            TATGTTGAACAAAGTAAGGACATTTATCCATACAGTTGACATTTTAGATACAGAAAATATGGAATCAGTATGCATTCAAAAATCCTGTTAACGAGTGCTCAGTAGCTAAGACTTGTTCACTGAACAATATTAGGAGATAGTAACTAAAATGTTATGGTAATTGATACAAGTTGACGCAACTGGTAATTAATCTAATCGTGTCCAATGATGAATTGTCGGACCTGAATACTCATATATTACGGAACCTTAAAAACACCCCCCGTTAGTGTTAGTTTAAATGTTTCCTATACATTGACAACGAATGTAGCTTTTGGTTAAAATTGTAAGCTGGTCTGTAAATAAGCTGTTTTATCGGTGATCCCTAGGCTTATATTGATTAGAGCATCTGTTCTCATTTTAGCTACATGGAATAACTAGAAAAGTCT                                                                                    ]




>consensus_4829#0
AAANTATNGCCTCGGGGAGATTCGTAATTATGTTGAACAAAGTAAGGACATTTATCCATA
CAGTTGACATTTTAGATACAGAAAATATGGAATCAGTATGCATTCAAAAATCCTGTTAAC
GAGTGCTCAGTAGCTAAGACTTGTTCACTGAACAATATTAGGAGATAGTAACTAAAATGT
TATGGTAATTGATACAAGTCGACGCAACTGGTAATTAATCTAATCGTGTCCAATGATGAA
TTGTCGGACCTGAATACTCATATATTACGGAACCTTAAAAACACCCCCCGTTAGTGTTAG
TTTAAATGTTTCCTATACATTGACAACGAATGTAGCTTTTGGTTAAAATTGTAAGCTGGT
CTGTAAATAAGCTGTTTTATCGGTGATCCCTAGGCTTATATTGATTAGAGCATCTGTTCT
CATTTTAGCTACATGGAATAACTAGAAAAGTCTTAGTGTTGTAAAATCTATGACTACTAT
TCTTAGCAGTTTATCTCACCTGTGATATTCAATCACTTCAGAAGTTTGAATTTGATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case