Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4844 cluster # 4844       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4844#0 length = 509 sequences # 3  

consensusID : consensus_4844#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 509
fasta sequence
                              [CTTTCTGAGGTATACAAGCCAGCGGAACATTGGCTTAATGGGTTTTGACATTCAATCTTCAGTCCTAAGTTCAAACGGCACCCTAGCTACTTCGGTTTAGTCAAGATAGTGCCATTATCCCTGATACATGAAGTGTGGTGGCTCATATTCAATTACTTGGTGAATTAATGAATCTACTATGACTTAATCACCATAAATAAATCGAGTGTATTGAAAATCGGACCTTGATAATTTAAGTTATTGATATTTTTATAAAGAAAAATGTTAAACACATACCAAATTGTTATCACCGAAAAATATCTAAACACATGGAAAATTAAACACGAGTTGAAATTAAAAGTATAACACTAGTAGAGAGAGATATCCATGAAGATTAAATTGTATGTTTCGAATTCAGCTGTACCATACATAGACCAGCATTTAATGAATAAGTGAAATCACATGACTCACAGTTCAACACAATATACACATTTACAGACTCTATGATATTAAATTAGAGCGAATCGAAC]

[+] EMBL CD185800             [CTTTCTGAGGTATACAAGCCAGCGGAACATTGGCTTAATGGGTTTTGACATTCAATCTTCAGTCCTAAGTTCAAACGGCACCCTAGCTACTTCGGTTTAGTCAAGATAGTGCCATTATCCCTGATACATGAAGTGTGGTGGCTCATATTCAATTACTTGGTGAATTAATTAATCTACTTTGACTTAGTCACCATAAATAAATCGAGTGTATTGAAAATCAGACCTTGATAATTTAAGTTATTGATATTTTTATAAAGAAAAATGTTAAACACATACCAAATTGTTATCACCGAAAAATATCTAAACACATGGAAAATTAAACACGAGTTGAAATTAAAAGTATAACACTGGTAGAGAGAGATATCCATGAAGATTAAATTGTATGTTTCGAATTCAGCTGTACCATACATAGACCAGCATTTAATGAATAAGTGAAATCACATGACTCACAGTTCAACACAATATACACATTTACAGACTCTATGATATTAAATTAGAGCGAATCGAAC]
[+] EMBL CD167071             [                                                                                                                                                                 GAATTAATGAATCTACTATGACTTAATCACCATAAATAAATCGAGTGTATTGAAAATCGGACCTTGATAATTTAAGTTATTGATATTTTTATAAAGAAAAATGTTAAACACATACCAAATTGTTATCACCGAAAAATATCTAAACACATGGAAAATTAAACACGAGTTGAAATTAAAAGTATAACACTAGTAGAGAGAGATATCCATGAAGATTAAA                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD167070             [                                                                                                                                                                 GAATTAATGAATCTACTATGACTTAATCACCATAAATAAATCGAGTGTATTGAAAGTCGGACCTTGATAATTTAAGTTATTGATATTTTTATAAAGAAAAATGTTAAACACATACCAAATTGTTATCACCGAAAAATATCTAAACACATGGAAAATTAAACACGAGTTGAAATTAACAGTATAACACTAGTAGAGAGAGATATCCATGAAc                                                                                                                                         ]


>consensus_4844#0 CTTTCTGAGGTATACAAGCCAGCGGAACATTGGCTTAATGGGTTTTGACATTCAATCTTC AGTCCTAAGTTCAAACGGCACCCTAGCTACTTCGGTTTAGTCAAGATAGTGCCATTATCC CTGATACATGAAGTGTGGTGGCTCATATTCAATTACTTGGTGAATTAATGAATCTACTAT GACTTAATCACCATAAATAAATCGAGTGTATTGAAAATCGGACCTTGATAATTTAAGTTA TTGATATTTTTATAAAGAAAAATGTTAAACACATACCAAATTGTTATCACCGAAAAATAT CTAAACACATGGAAAATTAAACACGAGTTGAAATTAAAAGTATAACACTAGTAGAGAGAG ATATCCATGAAGATTAAATTGTATGTTTCGAATTCAGCTGTACCATACATAGACCAGCAT TTAATGAATAAGTGAAATCACATGACTCACAGTTCAACACAATATACACATTTACAGACT CTATGATATTAAATTAGAGCGAATCGAAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)