cluster # 4916

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Schistosoma mansoni
cluster # 4916 cluster # 4916 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4916#0 length = 605 sequences # 3

consensusID : consensus_4916#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 605
fasta sequence

                              [ATGGTCATATTAGTGCTGTTCTTTCAGTCTATGGTGATTTAGTATATGAAGCTGACTTGAAAGTTCATCGTACAAACACATCAACATCATATCATTCTATTATAAAAGACAATCACGGATCACCGTATAAACTACAACAGATACAAGATTGTTTAAATTATACTACAAAATCCCTTGAAAAAATAAAATCTGCTAAAATTTCCACAAGTGTAAATGATCTAATTGAATGTCCATCGTTTTTATTCGAATTATTCTCCTACATTCGAGATGCTAGAGATTGTTTAACTCAACCGCCGCGTAAAACTATTGAAGAGCATCTGACCAATCCTAGTCGAAGATGTTTTTATCCACCTATACCGAAAGATATTGTTTTAAGCATGTTCATACGTGGTTGTTCATTAGTATTTGCAGCGTATAATTTAGTTTACAATAGTTTAGATAAACGATGGGAAGTTTTAAATCGATCAAGTATTGAATGTGTGATACCAAGACTACAGGAGACTTTATCCTATTTAGATGCAGCTATGAACACCTTAATGTATCTAATGAATAAACGTAACATTTTATAATTCATGGATTGAATTTAATTTTGTTAATGTTATGTC]

[+] EMBL CD140768             [ATGGTCATATTAGTGCTGTTCTTTCAGTCTATGGTGATTTAGTATATGAAGCTGACTTGAAAGTTCATCGTACAAACACATCAACATCATATCATTCTATTATAAAAGACAATCACGGATTACCGTATAAACTACAACAGATACAAGATTGTTTAAATTATACTACAAAATCCCTTGAAAAAATAAAATCTGCTAAAATTTCCACAAGTGTAAATGATCTAATTGAATGTCCATCGTTTTTATTCGAATTATTCTCCTACATTCGAGATGCTAGAGATTGTTTAACTCAACCGCCGCGTAAAACTATTGAAGAGCATCTGACCAATCCTAGTCGAAGATGTTTTTATCCACCTATACCGAAAGATATTGTTTTAAGCATGTTCATACGTGGTTGTTCATTAGTATTTGCAGCGTATAATTTAGTTTACAATAGTTT                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD078479             [                           TCTATGGAGATTTAGTATATGAAGCTGACTTGAAAGTTCATCGTACAAACACATCAACATCATATCATTCTATTATAAAAGACAATCACGGATCACCGTATAAACTACAACAGATACAAGATTGTTTAAACTATACTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD084339             [                                                                  ATCGTACAAACACATCAACATCATATCATTCTATTATAAAAGACAATCACGGATCACCGTATAAACTACAACAGATACAAGATTGTTTAAATTATACTACAAAATCCCTTGAAAAAATAAAATCTGCTAAAATTTCCACAAGTGTAAATGATCTAATTGAATGTCCATCGTTTTTATTCGAATTATTCTCCTACATTCGAGATGCTAGAGATTGTTTAACTCAACCGCCGCGTAAAACTATTGAAGAGCATCTGACCAATCCTAGTCGAAGATGTTTTTATCCACCTATACCGAAAGATATTGTTTTAAGCATGTTCATACGTGGTTGTTCATTAGTATTTGCAGCGTATAATTTAGTTTACAATAGTTTAGATAAACGATGGGAAGTTTTAAATCGATCAAGTATTGAATGTGTGATACCAAGACTACAGGAGACTTTATCCTATTTAGATGCAGCTATGAACACCTTAATGTATCTAATGAATAAACGTAACATTTTATAATTCATGGATTGAATTTAATTTTGTTAATGTTATGTC]




>consensus_4916#0
ATGGTCATATTAGTGCTGTTCTTTCAGTCTATGGTGATTTAGTATATGAAGCTGACTTGA
AAGTTCATCGTACAAACACATCAACATCATATCATTCTATTATAAAAGACAATCACGGAT
CACCGTATAAACTACAACAGATACAAGATTGTTTAAATTATACTACAAAATCCCTTGAAA
AAATAAAATCTGCTAAAATTTCCACAAGTGTAAATGATCTAATTGAATGTCCATCGTTTT
TATTCGAATTATTCTCCTACATTCGAGATGCTAGAGATTGTTTAACTCAACCGCCGCGTA
AAACTATTGAAGAGCATCTGACCAATCCTAGTCGAAGATGTTTTTATCCACCTATACCGA
AAGATATTGTTTTAAGCATGTTCATACGTGGTTGTTCATTAGTATTTGCAGCGTATAATT
TAGTTTACAATAGTTTAGATAAACGATGGGAAGTTTTAAATCGATCAAGTATTGAATGTG
TGATACCAAGACTACAGGAGACTTTATCCTATTTAGATGCAGCTATGAACACCTTAATGT
ATCTAATGAATAAACGTAACATTTTATAATTCATGGATTGAATTTAATTTTGTTAATGTT
ATGTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case