cluster # 4917

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Schistosoma mansoni
cluster # 4917 cluster # 4917 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4917#0 length = 502 sequences # 3

consensusID : consensus_4917#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 502
fasta sequence

                              [GTTGATTGTTTACTCTATTATCGCACCGATATACCACTCTGGCTTTTATTACTTAAAAATGACTGTACTGAGGCACAATTGATAAACAAATTTTCATTATCATTTAATACAGACGTTGGTGTACCACCAAATGGATGGAAGGCTGCTTCACAGCATGAAGCCAGTCGATCTAA-CCATTTGGATAATTCAGATCGACTACTTGTCCATTCAGTTGATGATGCTAAATAAATTCTGTCAGGTTGTGAATGAAGTGGGGAATCATGTGGACAGGATTGATACAACGCAGAAATGTATGGTGAAATAGAATGACATGTCGTTTTGATTAATTGATCAATTATTTGGTCAGCTAGTGTATACGATAATTTTCTAATTTCTTCAATTTCTGCCAACGTTTCAGGAGCTAACAGTTCACCGAACAAATGATTTAATGATAAATCTGATTTGGAAGTATTCTGATGACGATTTTCTGAACCAGGTGTGGTCGGCTGTGATATTGAAGAGG]

[+] EMBL CD059682             [GTTGATTGTTTACTCTATTATCGCACCGATATACCACTCTGGCTTTTATTACTTAAAAATGACTGTACTGAGGCACAATTGATAAACAAATTTTCATTATCATTTAATACAGACGTTGGTGTACCACCAAATGGATGGAAGGCTGCTTCACAGCATGAAGCCGGCCGATCTAAGCCATTAGGATAATTCAGATCGACTACTTGGCCATTCACCTGATGATGCTAAATAAATTCTGGCAGGTGGTGAATGAAGTGGGGAATCATGTGGACAGGATTGATGCAACGCAGAAATGTATGGCGAAATAGAATGACGTGTCGTTTGGATTAATGGATCAATTATTGGGTCAGCTAGTGTATACGATAATTTTCTAATTTCTTCAATTTCTGCCAACGTTTCAGGACCTAACAGTTCACCGAACAAATGATTTAATGATAAATCTGATTTGGAAGTATTCTGAT                                             ]
[-] EMBL CD178952             [                                                                                                                                                        GCATGAAGCCAGTCGATCTAA CCATTTGGATAATTCAGATCGACTACTTGTCCATTCAGTTGATGATGCTAAATAAATTCTGTCAGGTTGTGAATGAAGTGGGGAATCATGTGGACAGGATTGATACAACGCAGAAATGTATGGTGAAATAGAATGACATGTCGTTTTGATTAATTGATCAATTATTTGGTCAGCTAGTGTATACGATAATTTTCTAATTTCTTCAATTTCTGCCAACGTTTCAGGAGCTAACAGTTCACCGAACAAATGATTTAATGATAAATCTGATTTGGAAGTATTCTGATGACGATTTTCTGAACCAGGTGTGGTCGGCTGTGATATTGAAGAGG]
[+] EMBL CD177789             [                                                                                                                                                         CATGAAGCCAGTCGATCTAA CCATTTGGATAATTCAGATCGACTACTTGTCCATTCAGTTGATGATGCTAAATAAATTCTGTCAGGTTGTGAATGAAGTGGGGAATCATGTGGACAGGATTGATACAACGCAGAAATGTATGGTGAAATAGAATGACATGTCGTTTTGATTAATTGATCAATTATTTGGTCAGCTAGTGTATACGATAATTTTCTAATTTCTTCAATTTCTGCCAACGTTTCAGGAGCTAACAGTTCACCGAACAAATGATTTAATGATAAATCTGATTTGGAAGTATTCTGATGACGATTTTCTGAACCAGGTGTGGTC                   ]




>consensus_4917#0
GTTGATTGTTTACTCTATTATCGCACCGATATACCACTCTGGCTTTTATTACTTAAAAAT
GACTGTACTGAGGCACAATTGATAAACAAATTTTCATTATCATTTAATACAGACGTTGGT
GTACCACCAAATGGATGGAAGGCTGCTTCACAGCATGAAGCCAGTCGATCTAACCATTTG
GATAATTCAGATCGACTACTTGTCCATTCAGTTGATGATGCTAAATAAATTCTGTCAGGT
TGTGAATGAAGTGGGGAATCATGTGGACAGGATTGATACAACGCAGAAATGTATGGTGAA
ATAGAATGACATGTCGTTTTGATTAATTGATCAATTATTTGGTCAGCTAGTGTATACGAT
AATTTTCTAATTTCTTCAATTTCTGCCAACGTTTCAGGAGCTAACAGTTCACCGAACAAA
TGATTTAATGATAAATCTGATTTGGAAGTATTCTGATGACGATTTTCTGAACCAGGTGTG
GTCGGCTGTGATATTGAAGAGG

clustalw multiple alignements is not computed in this case