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Schistosoma mansoni
cluster # 4942 cluster # 4942       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4942#0 length = 668 sequences # 3  

consensusID : consensus_4942#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 668
fasta sequence
                              [CGCTTTCAGTTCGTTTCGATTTTTAATAAAGATTTGTGTGACATTTTCAGTATACAATTTACTTTGAGGTTTTATCTAAATTTTTCAAGGGCTAATAATTTTGTTTTTTATTTATCTTTCTTCATTTACATCCAATTCATTGATACCATACAGTTGTAGCAACACCCTTGTAATGTTATTAGACTTCGGTGGCACTCTTCCCAAATACTACTTGTTCAAAAGTTTTGGTCAAGTCGGACATTTTGTTGACTATTTTAGATTTGTTTTCTGGAAAAACTAAGCTTATCCTTATTGATGATAGATATACCGGATTCAATCCTAGAGCAAATTTTTATTTATTTGAATTGGAATGAACGTTCGCGAGCTGCTCGTGTGTGTAGAAAGTGGTATAGTGTATTTCAATCTCCCGTTTTGTGGAGAAAAATCGTCTTTAAGCCACCGTGTCGTCGGCTAACAAAACTTCAGTATGATATTAAAGGCTATCGTTTGTCTTGTTGTTTAAAGGCGATTGGTTGGCATATTCGCAACTACAAGTTTTTGAAAACTGATGACTTGTTCCTACTTAATCGAACGTTGAATCTTGTTGCAAAGTTTCTTGAATACAGTTTCAAATTAGATGTGCAGAAGAATGAACCTAATAATGCGTGCGATTCAGATGGCAATGAACA]

[+] EMBL CD116996             [CGCTTTCAGTTCGTTTCGATTTTTAATAAAGATTTGTGTGACATTTTCAGTATACAATTTACTTTGAGGTTTTATCTAAATTTTTCAAGGGCTAATAATTTTGTTTTTTATTTATCTTTCTTCATTTACATCCAATTCATTGATACCATACAGTTGTAGCAACACCCTTGTAATGTTATTAGACTTCGGTGGCACTCTTCCCAAATACTACTTGTTCAAAAGTTTTGGTCAAGTCGGACATTTTGTTGACTATTTTAGATTTGTTTTCTGGAAAAACTAAGCTTATCCTTATTGATGATAGATATACCGGATTCAATCCTAGAGCAAATTTTTATTTATTTGAATTGGAATGAACGTTCGCGAGCTGCTCGTGTGTGTAGAAAGTGGTATAGTGTATTTCAATCTCCCGTTTTGTGGAGAAAAATCGTCTTTAAGCCACCGTGTCGTCGGCTAACAAAACTTCAGTATGATATTAAAGGCTATCGTTTGTCTTGTTGTTTAAAGGCGATTGGTTGGCATATTCGCAACTACAAGTTTTTGAAAACTGATGACT                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD116987             [CGTTTTCAGTTCGTTTCGATTTTTAATAAAGATTTGTGTGACATTTTCAGTATACAATTTACTTTGAGGTTTTATCTAAATTTTTCAAGGGCTAATAATTTTGTTTTTTATTTATCTTTCTTCATTTACATCCAATTCATTGATACCATACAGTTGCAGCAACACCCTTGTAGTGTTATTAGACTTCGGTGGCACTCTTCCCAAATACTACTTGTTCAAAAGTTTTGGTCAAGTCGGACATTTTGTTGACTATTTTAGATTTGTTTTCTGGAAAAACTAAGCTTATCCTTATTGATGATAGATATACCGGATTCAATCCTAGAGCAAATTTTTATTTATTTGAATTGGAATGAACGTTCGCGAGCTGCTCGTGTGTGTAGAAAGTGGTATAGTGTATTTCAATCTCCCGTTTTGTGGAGAAAAATCGTCTTTAAGCCACCGTGTCGTCGGCTAACAAAACTTCAGTATGATATTAAAGGCTATCGTTTGTCTTGT                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD117235             [                                                                                                                                       TTCATTGATACCATACAGTTGTAGCAACACCCTTGTAATGTTATTAGACTTCGGTGGCACTCTTCCCAAATACTACTTGTTCAAAAGTTTTGGTCAAGTCGGACATTTTGTTGACTATTTTAGATTTGTTTTCTGGAAAAACTAAGCTTATCCTTATTGATGATAGATATACCGGATTCAATCCTAGAGCAAATTTTTATTTATTTGAATTGGAATGAACGTTCGCGAGCTGCTCGTGTGTGTAGAAAGTGGTATAGTGTATTTCAATCTCCCGTTTTGTGGAGAAAAATCGTCGTTAAGCCACCGTGTCGTCGGCTAACAAAACTTCAGTATGATATTAAAGGCTATCGTTTGTCTTGTTGTTTAAAGGCGATTGGTTGGCATATTCGCAACTACAAGTTTTTGAAAACTGATGACTTGTTCCTACTTAATCGAACGTTGAATCTTGTTGCAAAGTTTCTTGAATACAGTTTCAAATTAGATGTGCAGAAGAATGAACCTAATAATGCGTGCGATTCAGATGGCAATGAACA]


>consensus_4942#0 CGCTTTCAGTTCGTTTCGATTTTTAATAAAGATTTGTGTGACATTTTCAGTATACAATTT ACTTTGAGGTTTTATCTAAATTTTTCAAGGGCTAATAATTTTGTTTTTTATTTATCTTTC TTCATTTACATCCAATTCATTGATACCATACAGTTGTAGCAACACCCTTGTAATGTTATT AGACTTCGGTGGCACTCTTCCCAAATACTACTTGTTCAAAAGTTTTGGTCAAGTCGGACA TTTTGTTGACTATTTTAGATTTGTTTTCTGGAAAAACTAAGCTTATCCTTATTGATGATA GATATACCGGATTCAATCCTAGAGCAAATTTTTATTTATTTGAATTGGAATGAACGTTCG CGAGCTGCTCGTGTGTGTAGAAAGTGGTATAGTGTATTTCAATCTCCCGTTTTGTGGAGA AAAATCGTCTTTAAGCCACCGTGTCGTCGGCTAACAAAACTTCAGTATGATATTAAAGGC TATCGTTTGTCTTGTTGTTTAAAGGCGATTGGTTGGCATATTCGCAACTACAAGTTTTTG AAAACTGATGACTTGTTCCTACTTAATCGAACGTTGAATCTTGTTGCAAAGTTTCTTGAA TACAGTTTCAAATTAGATGTGCAGAAGAATGAACCTAATAATGCGTGCGATTCAGATGGC AATGAACA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)