cluster # 4949

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Schistosoma mansoni
cluster # 4949 cluster # 4949 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4949#0 length = 710 sequences # 3

consensusID : consensus_4949#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 710
fasta sequence

                              [CGTCCTAGTTTAAATTATCAACTTGGTTTCAGTGTACAAGATGGTGTAATTTGTAGTTTACTTCGTGGAGGTATTGCTGAACGTGGTGGTATTCGTGTATATCATACAATTATTGAAATTAATGGTGAAAGTGTAGTTGCTGTATCACATGAAAAAATTGTACAACTTTTAGCTACTTCAGTTGGTGAAATACATATTCGAACAATGCCTACCTCAGTCTTCCGTCTATTGACAGGACAAATTATTCCTCGGTATATCTGATAAAAAGAAAGAAATTTACTTGGTTGTGTATATTATAAATTTAATCTCATTTTTGTTGTATCTGGAGCATTTATTTCTGTGAGCATTGACAACGTTGTCAATCGACAAAATGATCTGATTCACAATATATACAATAATGATCTCATAGGAATTTACAACTTGTATACTGTTATATACGTACGTATATTGTGAGAAGTCCCGATGGTTTCATTTCTCTTTTTGAACTAGGTTTTATTTACATATATAATCAAAAGTCTTCATATATGTGGTCC--TCAAAACGCCTCCTTTATA-AATAAACTAATGATGATGGTCATTTAATAATTTATCTCGGGTTTTTTTGTGGTCTAAATTATTTTTCTTTAAAACTTTGGGGTANTATTGGTTACATGTTACCAGGATTGAATACTCGCACAAATAGTCTATTGTACTCATATTTATATATACATATA]

[+] EMBL CD188751             [CGTCCTAGTTTAAATTATCAACTTGGTTTCAGTGTACAAGATGGTGTAATTTGTAGTTTACTTCGTGGAGGTATTGCTGAACGTGGTGGTATTCGTGTATATCATACAATTATTGAAATTAATGGTGAAAGTGTAGTTGCTGTATCACATGAAAAAATTGTACAACTTTTAGCTACTTCAGTTGGCGAAATACATATTCGAACAATGCCTACCTCAGTCTTCCGTCTATTGACAGGACAAATTATTCCTCGGTATATCTGATAAAAAGAAAGAAATTTACTTGGTTGTGTATATTATAAATGTAATCTCATTTTTGTTGCATCTGGAGCATTTATTTCTGTGAGCATTGACAACGTTGTCAATCGA AAAATGATCTGATTC TAATATATACAATAATACTCTCATAGGAATGTACAACTTGTATACTGTTATATACGTACGTATATTGTGAGAAGTCCCGATGGTTTCATTTCTCTTTTTGAACTAGGCTNTATCTACATATATAATCAAAAGTCTTCATATATGTGGGCCCNTCAAAACGCCTCCTTTTTATAATAAACTAATGATGATGGNCATTTAATAANTTATCTCGGGTTTTTTTGTGGTCTAAATTATTTTTCTTTAAAACTTTGGGGTANTATTGG                                                                   ]
[+] EMBL AW016973             [                                                                                                                                                                   AACTTTTAGCTACTTCAGTTGGTGAAATACATATTCGAACAATGCCTACCTCAGTCTTCCGTCTATTGACAGGACAAATTATTCCTCGGTATATCTGATAAAAAGAAAGAAATTTACTTGGTTGTGTATATTATAAATTTAATCTCATTTTTGTTGTATCTGGAGCATTTATTTCTGTGAGCATTGACAACGTTGTCAATCGACAAAATGATCTGATTCACAATATATACAATAATGATCTCATAGGAATTTACAACTTGTATACTGTTATATACGTACGTATATTGTGAGAAGTCCCGATGGTTTCATTTCTCTTTTTGAACTAGGTTTTATTTACATATATAATCAAAAGTCTTCATATATGTGGTCC  TCAAAACGCCTCCTTTATA AATAAACTAATGATGATGGTCATTTAATAATTTATCTCGTGTTTTTTTGTGTTCT AATTATTTTTCTTTAAAACTTTGGGTTAATATTAGTTACATGTTACCAGGATTGAATACTCGCACAAATAGTCTATTGTACTCATATTTATATATACATATA]
[+] EMBL AI975073             [                                                                                                                                                                   AACTTTTAGCTACTTCAGTTGGTGAAATACATATTCGAACAATGCCTACCTCAGTCTTCCGTCTATTGACAGGACAAATTATTCCTCGGTATATCTGATAAAAAGAAAGAAATTTACTTGGTTGTGTATATTATAAATTTAATCTCATTTTTGTTGTATCTGGAGCATTTATTTCTGTGAGCATTGACAACGTTGTCAATCGACAAAATGATCTGATTCACAATATATACAATAATGATCTCATAGGAATTTACAACTTGTATACTGTTATATACGTACGTATATTGTGAGAAGTCCCGATGGTTTCATTTCTCTTTTTGAACTAGGTTTTATTTACATATATAATCAAAAGTCTTCATATATGTGGTCC  TCAAAACGCCTCCTTTATA AATAAACTAATGATGATGGTCATTTAATAAT                                                                                                                               ]




>consensus_4949#0
CGTCCTAGTTTAAATTATCAACTTGGTTTCAGTGTACAAGATGGTGTAATTTGTAGTTTA
CTTCGTGGAGGTATTGCTGAACGTGGTGGTATTCGTGTATATCATACAATTATTGAAATT
AATGGTGAAAGTGTAGTTGCTGTATCACATGAAAAAATTGTACAACTTTTAGCTACTTCA
GTTGGTGAAATACATATTCGAACAATGCCTACCTCAGTCTTCCGTCTATTGACAGGACAA
ATTATTCCTCGGTATATCTGATAAAAAGAAAGAAATTTACTTGGTTGTGTATATTATAAA
TTTAATCTCATTTTTGTTGTATCTGGAGCATTTATTTCTGTGAGCATTGACAACGTTGTC
AATCGACAAAATGATCTGATTCACAATATATACAATAATGATCTCATAGGAATTTACAAC
TTGTATACTGTTATATACGTACGTATATTGTGAGAAGTCCCGATGGTTTCATTTCTCTTT
TTGAACTAGGTTTTATTTACATATATAATCAAAAGTCTTCATATATGTGGTCCTCAAAAC
GCCTCCTTTATAAATAAACTAATGATGATGGTCATTTAATAATTTATCTCGGGTTTTTTT
GTGGTCTAAATTATTTTTCTTTAAAACTTTGGGGTANTATTGGTTACATGTTACCAGGAT
TGAATACTCGCACAAATAGTCTATTGTACTCATATTTATATATACATATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case