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Schistosoma mansoni
cluster # 4958 cluster # 4958       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4958#0 length = 610 sequences # 3  

consensusID : consensus_4958#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 610
fasta sequence
                              [GGTGCAAAACCGAATACTGCTACAAAAAAAGGGAATACAGCTTTACATATTGCAAGTTTAGCTGGTCAGTTTGAAGTGGTTAAATTATTACTAGAAGCTGGAGCTGAAGTAAATATTCAAGCTCAGAATGGTTTCACTCCACTTTATATGGCTGCTCAAGAGAATCATTTGGAAGTTGTACGTCTACTATTATCTAATGGTGCCAATCCTGGTTTAACTACAGATGATGGTTTTACACCACTTGCTGTAGCTTTACAACAAGGTCATGATCGTGTAGTTGCTTTATTATTAGAAAGTGATTCTCGTGGTAAAATCTGTTTACCAGCTTTACATATTGCATCTAAAAAGGATGATATTAAAGCTGCCAATTTATTATTAAATAGTGATGTCAATGTAGATCATCAATCAGCTAGTGGATTCACTCCACTTCATATCGCTGCACATTATGGTAATGTGAATATGACTGAATTATTAATATCACGTGGTGCTAATATCAATTTTCAAGCTAAAAACAATATAACTCCATTGCATGCAGCATCGAAATGGGGTAATCAAGGTGTAGCTGAACGTNTAATTACAGCTGGTGCAGAACTTGATTGTCGTACGCGTG]

[+] EMBL CD201380             [GGTGCAAAACCGAATACTGCTACAAAAAAAGGGAATACAGCTTTACATATTGCAAGTTTAGCTGGTCAGTTTGAAGTGGTTAAATTATTACTAGAAGCTGGAGCTGAAGTAAATATTCAAGCTCAGAATGGTTTCACTCCACTTTATATGGCTGCTCAAGAGAATCATTTGGAAGTTGTACGTCTACTATTATCTAATGGTGCCAATCCTGGTTTAACTACAGATGATGGTTTTACACCACTTGCTGTAGCTTTACAACAAGGTCATGATCGTGTAGTTGCTTTATTATTAGAAAGTGATTCTCGTGGTAAAATCTGTTTACCAGCTTTACATATTGCATCTAAAAAGGATGATATTAAAGCTGCCAATTTATTATTAAATAGTGATGTCAATGTAGATCATCAATCAGCTAGTGGATTCACTCCACTTCATATCGCTGCACATTATGGTAATGTGAATATGACTGAATTATTAATATCACGTGGTGCTAATATCAATTTTCAAGCTAAAAACAATATAACTCCATTGCATGCAGCATCGAAATGGGGTAATCAAGGTGTAGCTGAACGTNTAATTACAGCTGGTGCAGAACTTGATTGTCGTACGCGTG]
[-] EMBL CD063029             [                                         TTTACATATTGCAAGTTTAGCTGGTCAGTTTGAAGTGGTTAAATTATTACTAGAAGCTGGAGCTGAAGTAAATATTCAAGCTCAGAATGGTTTCACTCCACTTTATATGGCTGCTCAAGAGAATCATTTGGAAGTTGTACGTCTACTATTATCTAATGGTGCCAATCCTGGTTTAACTACAGATGATGGTTTTACACCACTTGCTGTAGCTgttcgga                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD059872             [                                                                                                                                                                          GGAAGTTGTACGTCTACTATTATCTAATGGTGCCAATCCTGGTTTAACTACAGATGATGGTTTTACACCACTTGCTGTAGCTTTACAACAAGGTCATGATCGTGTAGTTGCTTTATTATTAGAAAGTGATTCTCGTGGTAAAATCTGTTTACCAGCTTTACATATTGCATCTAAAAAGAATGATA                                                                                                                                                                                                                                                               ]


>consensus_4958#0 GGTGCAAAACCGAATACTGCTACAAAAAAAGGGAATACAGCTTTACATATTGCAAGTTTA GCTGGTCAGTTTGAAGTGGTTAAATTATTACTAGAAGCTGGAGCTGAAGTAAATATTCAA GCTCAGAATGGTTTCACTCCACTTTATATGGCTGCTCAAGAGAATCATTTGGAAGTTGTA CGTCTACTATTATCTAATGGTGCCAATCCTGGTTTAACTACAGATGATGGTTTTACACCA CTTGCTGTAGCTTTACAACAAGGTCATGATCGTGTAGTTGCTTTATTATTAGAAAGTGAT TCTCGTGGTAAAATCTGTTTACCAGCTTTACATATTGCATCTAAAAAGGATGATATTAAA GCTGCCAATTTATTATTAAATAGTGATGTCAATGTAGATCATCAATCAGCTAGTGGATTC ACTCCACTTCATATCGCTGCACATTATGGTAATGTGAATATGACTGAATTATTAATATCA CGTGGTGCTAATATCAATTTTCAAGCTAAAAACAATATAACTCCATTGCATGCAGCATCG AAATGGGGTAATCAAGGTGTAGCTGAACGTNTAATTACAGCTGGTGCAGAACTTGATTGT CGTACGCGTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)