cluster # 4964

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Schistosoma mansoni
cluster # 4964 cluster # 4964 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4964#0 length = 478 sequences # 3

consensusID : consensus_4964#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 478
fasta sequence

                              [TTGTCCTGGAGAGATCGAATAGTTGGTACAGGAATAACAACAGATAACAATGGTCAGACGAAGTCTCAATGGGGGCCACTTAGATGTGATTGCCAACATAATACAGAAGGAGCTGATTGTGAACGTTGTTCTCCTGGTTATTTGGATAGACCCTGGGCAAGAGGTACTTCTGAATCAGCTAATGATTGTAAACCTTGTCAATGTGGTAATCACACTAATCAATGTATATTCAGCGTAAAAGCTTTCAAGCGTTCCGGTGGTATAACCGGTGGTATATGCTTGGCATGTCAACATCACACAGAAGGTTCAAACTGTGATCAGTGCATAATTGGATATTATCGTGATCCTAATCTAACCATGGGAAATGAGCATGCATGTCGAGAGTGTCGATGTCAC-CCGATTGGATCAATCGCTAATCAACATTGTGATCGTAAAACTGGTCAATGTCCTTGTAAACCAGGAGTTGTTGGGCAAGCAT]

[+] EMBL CD132985             [TTGTCCTGGAGAGATCGAATAGTTGGTACAGGAATAACAACAGATAACAATGGTCAGACGAAGTCTCAATGGGGGCCACTTAGATGTGATTGCCAACATAATACAGAAGGAGCTGATTGTGAACGTTGTTCTCCTGGTTATTTGGATAGACCCTGGGCAAGAGGTACTTCTGAATCAGCTAATGATTGTAAACCTTGTCAATGTGGTAATCACACTAATCAATGTATATTCAGCGTAAAAGCTTTCAAGCGTTCCGGTGGTATAACCGGTGGTATATGCTTGGCATGTCAACATCACACAGAAGGTTCAAACTGTGATCAGTGCATAATTGGATATTATCGTGATCCTAATCTAACCATGGGAAATGAGCATGCATGTCGAGAGTGTCGATGTCAC CCGATTGGATCAATCGCTAATCAACATTGTGATCGTAAAACTGGTCAATGTCCTTGTAAACCAGGAGTTGTTGGGCAAGCAT]
[+] EMBL CD132725             [                  ATAGTTGGTACAGGAATAACAACAGATAACAATGGTCAGACGAAGTCTCAATGGGGGCCACTTAGATGTGATTGCCAACATAATACAGAAGGAGCTGATTGTGAACGTTGTTCTCCTGGTTATTTGGATAGACCCTGGGCAAGAGGTACTTCTGAATCAGCTAATGATTGTAAACCTTGTCAATGTGGTAATCACACTAATCAATGTATATTCAGCGTAAAAGCTTTCAAGCGTTCCGGTGGTATAACCGGTGGTATATGCTTGGCATGTCAACATCACACAGAAGGTTCGAACTGTGATCAGTGCATAATTGGATATTATCGTGATCCTAATCCAACCATGGGAAATGAGCATGCATGTCGAGAGTGTCGATGTCACGCCGATTGGA                                                                         ]
[+] EMBL CD120875             [                                                                                                                                                                          TGAATCAGCTAATGATTGTAAACCTTGTCAATGTGGTAATCACACTAATCAATGTATATTCAGCGTAAAAGCTTTCAAGCGTTCCGGTGGTATAACCGGTGGTATATACTTGGCATGTCAACATCACACAGAAGGTTCAAACTGTGATCAGTGCATAATTGGATATTATCGTGATCCTAATATAACCATGGGAAATGAGCATGCATGTCGAGAGTGTCGATGTCAC CCGATTGGATCAATCGCTAATCAACATTGTGATCGTAAAACTGGTCAATGTCCTTGTAAACCAGG                 ]




>consensus_4964#0
TTGTCCTGGAGAGATCGAATAGTTGGTACAGGAATAACAACAGATAACAATGGTCAGACG
AAGTCTCAATGGGGGCCACTTAGATGTGATTGCCAACATAATACAGAAGGAGCTGATTGT
GAACGTTGTTCTCCTGGTTATTTGGATAGACCCTGGGCAAGAGGTACTTCTGAATCAGCT
AATGATTGTAAACCTTGTCAATGTGGTAATCACACTAATCAATGTATATTCAGCGTAAAA
GCTTTCAAGCGTTCCGGTGGTATAACCGGTGGTATATGCTTGGCATGTCAACATCACACA
GAAGGTTCAAACTGTGATCAGTGCATAATTGGATATTATCGTGATCCTAATCTAACCATG
GGAAATGAGCATGCATGTCGAGAGTGTCGATGTCACCCGATTGGATCAATCGCTAATCAA
CATTGTGATCGTAAAACTGGTCAATGTCCTTGTAAACCAGGAGTTGTTGGGCAAGCAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case