cluster # 4972

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4972 cluster # 4972 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4972#0 length = 344 sequences # 3

consensusID : consensus_4972#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 344
fasta sequence

                              [TTATGTAATACACAAAATATTACAGATCAA-GAAGTTACATTATCATTCAATACATTAAAACTAA-TTAA-TTCTAAATCTAA-ACGTGCATTAATTAATGTTGGTGGTATTAA-ACATGAAATATTATGGAATATTGTTGATCGTTATCCAAATACAAGATTAGGTAAATTACATCATGTTAATAATATTAATGATTTATTAAATTTATGTGATGATTATGATCCAATTAATAATGAATATTATTTTGATCGTAATCCAATTATTTTTTCCAATATATTGAATTTTTATCGATCCAAGAAATTACATTATAATGATATGATATGTGTAATTGATTTTCAAGAAGAATT]

[+] EMBL CD071290             [TTATGTAATACACAAAATATTACAGATCAA GAAGTTACATTATCATTCAATACATTAAAACTAA TTAA TTCTAAATCTAA ACGTGCATTAATTAATGTTGGTGGTATTAA ACATGAAATATTATGGAATATTGTTGATCGTTATCCAAATACAAGATTAGGTAAATTACATCATGTTAATAATATTAATGATTTATTAAATTTATGTGATGATTATGATCCAATTAATAATGAATATTATTTTGATCGTAATCCAATTATTTTTTCCAATATATTGAATTTTTATCGATCCAAGAAATTACATTATAATGATATGATATGTGTAATTGATTTTCAAGAAGAATT]
[+] EMBL CD071251             [TTATGTAATACACAAAATATTACAGATCAA GAAGTTACATTATCATTCAATACATTAAAACTAA TTAA TTCTAAATCTAA ACGTGCATTAATTAATGTTGGTGGTATTAA ACATGAAATATTATGGAATATTGTTGATCGTTATCCAAATACAAGATTAGGTAAATTACGTCATGTTAATAATATTAATGATTCATTAAATTTATGTGATGATTATGATCCAATTAATAATGAATATTATTTTGATCGTAATCCAATTATTTTTTCCAATATATTGAATTTTTATCGATCCAAGAAATTACCTTATTCTGATttta                            ]
[+] EMBL CD071292             [TTATGTAATACACAAAATATTACAGATCAATGAAGTTACATTATCATTCAATACATTAAAACTAACTTAACTTCTAAATCTAACACGTGCATTAATTAATGTTGGTGGTATTAACACATGAAATATTATGGAATATTGTTGATCGTTATCCAAATACAAGATTAGGTAAATTACATCATGTTAATAATATTAATGATTTATTAAATTTATGTGATGATTATGATCCAATTAATAATGAATATTATTTTGATCGTAATC                                                                                           ]




>consensus_4972#0
TTATGTAATACACAAAATATTACAGATCAAGAAGTTACATTATCATTCAATACATTAAAA
CTAATTAATTCTAAATCTAAACGTGCATTAATTAATGTTGGTGGTATTAAACATGAAATA
TTATGGAATATTGTTGATCGTTATCCAAATACAAGATTAGGTAAATTACATCATGTTAAT
AATATTAATGATTTATTAAATTTATGTGATGATTATGATCCAATTAATAATGAATATTAT
TTTGATCGTAATCCAATTATTTTTTCCAATATATTGAATTTTTATCGATCCAAGAAATTA
CATTATAATGATATGATATGTGTAATTGATTTTCAAGAAGAATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case