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Schistosoma mansoni
cluster # 4994 cluster # 4994       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4994#0 length = 1125 sequences # 3  

consensusID : consensus_4994#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1125
fasta sequence
                              [CGGAAGAATTGGCTTCTTATGGAATAAAATGTTATGCCTTTGTAAGGATTGGTAGCATAAAATAACTATCGGAGGATGTTAGTTTATTAGTCACCAACTTGATTAATTAGAACATAAATATTGGGACTGATTCTTAAGCATAGTGTCACTTACACGGGGTGATGTCGGATCCTTCTACTGCAACACTAATAAGCAGGATGGCCGTCTGTAAGTGAGCTAGACGAATGCTACCTTTACCACCAAACGAAACGTCCGTATTTCAGTTTCGGAATCACAAGTACAGTTAAGAATCGGTATGTTTGTGTCCTAGAATGCTATCAGGTGAAGTTATTATCTTTACACCGACCCTATTGTCCGAAACTTTTCGGACTTTTTGTTTATGAGCTCCAGTTGAACGTCGTTTGATTATGAAGGTTAATTTCTTTCTGGTTGTCACGAATAGATTTTATTCTCATGTGCTGGGAAAGCCGCGATCAAGACCAATCAATTGTGACTGCTTCTAGCTCCTGGACTGTATTCAAAAATTAGTAATTTTTAATCATATCAAACTAATATCTACAAAATCTTTTGTAGTCAACCTTATTATTTACACTACCTCTTCGCTCTCCCCTGACTCAAGTTCGTTGCGTTTTTTCCAATCTTGATAGGAGTCGAGGGATTAAGTTAATTTCCTTTCAAGATTGTTATACTATGGGCGGTCGAACTGTCTCTCATAACATCCTGCCCGCCATCCCAATCATCCGCTCTAAAATTA---CATGATATCATCTTCTGTCAGCCACTCACTTTTCAACCAGCAAGTTACAAGTTCAAACTATCATCAAGTTTGGTTTGGACAACCGAGCAATAGCCCCACACTAACAGTGTGATTTAAACCGTACATAGCGAATGAATTACATTTGACACTTGTAACATTTTGTAACAGTTTCACTATGGATATGTTGATATCTGTCTTTTTGATGTGTAAACATATCTAACACTACCTATCACCGATTCTTTTCTCATTACCTTTCTTGCTTATGTTTCCTAATTACTGTAAAAATACTGTATAAATCTTCACTCAATTATGCTTGAGCCAGCTTCGCTGCCAGTGATGCTCAGATCACATCGACATTCATCATTTTAGTA]

[-] EMBL CD089978             [CGGAAGAATTGGCTTCTTATGGAATAAAATGTTATGCCTTTGTAAGGATTGGTAGCATAAAATAACTATCGGAGGATGTTAGTTTATTAGTCACCAACTTGATTAATTAGAACATAAATATTGGGACTGATTCTTAAGCATAGTGTCACTTACACGGGGTGATGTCGGATCCTTCTACTGCAACACTAATAAGCAGGATGGCCGTCTGTAAGTGAGCTAGACGAATGCTACCTTTACCACCAAACGAAACGTCCGTATTTCAGTTTCGGAATCACAAGTACAGTTAAGAATCGGTATGTTTGTGTCCTAGAATGCTATCAGGTGAAGTTATTATCTTTACACCGACCCTATTGTCCGAAACTTTTCGGACTTTTTGTTTATGAGCTCCAGTTGAACGTCGTTTGATTATGAAGGTTAATTTCTTTCTGGTTGTCACGAATAGATTTTATTCTCATGTGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD158853             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTATGTTTGTGTCCTAGAATGCTATCAGGTGAAGTTATTATCTTTACACCGACCCTATTGTCCGAAACTTTTCGGACTTTTTGTTTATGAGCTCCAGTTGAACGTCGTTTGATTATGAAGGTTAATTTCTTTCTGGTTGTCACGAATAGATTTTATTCTCATGTACTGGGAAAGCCGCGATCAAGACCAATCAATTGTGACTGCTTCTAGCTCCTGGACTGTATTCAAAAATTAGTAATTTTTAATCATATCAAACTAATATCTACAAAATCTTTTGTAGTCAACCTTATTATTTACACTACCTCTTCGCTCTCCCCTGACTCAAGTTCGTTGCGTTTTTTCCAATCTTGATAGGAGTCGAGGGATTAAGTTAATTTCCTTTCAAGATTGTTATACTATGGGCGGTCGAACTGTCTCTCATAACATCCTGCCCGCCATCCCAATCATCCGCTCTAAAATTA   CATGATATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD084197             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ggcacgaggGATAGGAGTCGAGGGATTAAGTTAATTTCCTTTCAAGATTGTTATACTATGGGCGGTCGAACTGTCTCTCATAACATCCTGCCCGCCATCCCAATCATCCGCTTTAGAATTAAATCATGATATCATCTTCTGTCAGCCACTCACTTTTCAACCAGCAAGTTACAAGTTCAAACTATCATCAAGTTTGGTTTGGACAACCGAGCAATAGCCCCACACTAACAGTGTGATTTAAACCGTACATAGCGAATGAATTACATTTGACACTTGTAACATTTTGTAACAGTTTCACTATGGATATGTTGATATCTGTCTTTTTGATGTGTAAACATATCTAACACTACCTATCACCGATTCTTTTCTCATTACCTTTCTTGCTTATGTTTCCTAATTACTGTAAAAATACTGTATAAATCTTCACTCAATTATGCTTGAGCCAGCTTCGCTGCCAGTGATGCTCAGATCACATCGACATTCATCATTTTAGTA]


>consensus_4994#0 CGGAAGAATTGGCTTCTTATGGAATAAAATGTTATGCCTTTGTAAGGATTGGTAGCATAA AATAACTATCGGAGGATGTTAGTTTATTAGTCACCAACTTGATTAATTAGAACATAAATA TTGGGACTGATTCTTAAGCATAGTGTCACTTACACGGGGTGATGTCGGATCCTTCTACTG CAACACTAATAAGCAGGATGGCCGTCTGTAAGTGAGCTAGACGAATGCTACCTTTACCAC CAAACGAAACGTCCGTATTTCAGTTTCGGAATCACAAGTACAGTTAAGAATCGGTATGTT TGTGTCCTAGAATGCTATCAGGTGAAGTTATTATCTTTACACCGACCCTATTGTCCGAAA CTTTTCGGACTTTTTGTTTATGAGCTCCAGTTGAACGTCGTTTGATTATGAAGGTTAATT TCTTTCTGGTTGTCACGAATAGATTTTATTCTCATGTGCTGGGAAAGCCGCGATCAAGAC CAATCAATTGTGACTGCTTCTAGCTCCTGGACTGTATTCAAAAATTAGTAATTTTTAATC ATATCAAACTAATATCTACAAAATCTTTTGTAGTCAACCTTATTATTTACACTACCTCTT CGCTCTCCCCTGACTCAAGTTCGTTGCGTTTTTTCCAATCTTGATAGGAGTCGAGGGATT AAGTTAATTTCCTTTCAAGATTGTTATACTATGGGCGGTCGAACTGTCTCTCATAACATC CTGCCCGCCATCCCAATCATCCGCTCTAAAATTACATGATATCATCTTCTGTCAGCCACT CACTTTTCAACCAGCAAGTTACAAGTTCAAACTATCATCAAGTTTGGTTTGGACAACCGA GCAATAGCCCCACACTAACAGTGTGATTTAAACCGTACATAGCGAATGAATTACATTTGA CACTTGTAACATTTTGTAACAGTTTCACTATGGATATGTTGATATCTGTCTTTTTGATGT GTAAACATATCTAACACTACCTATCACCGATTCTTTTCTCATTACCTTTCTTGCTTATGT TTCCTAATTACTGTAAAAATACTGTATAAATCTTCACTCAATTATGCTTGAGCCAGCTTC GCTGCCAGTGATGCTCAGATCACATCGACATTCATCATTTTAGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)