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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_4994#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 1125 fasta sequence
[CGGAAGAATTGGCTTCTTATGGAATAAAATGTTATGCCTTTGTAAGGATTGGTAGCATAAAATAACTATCGGAGGATGTTAGTTTATTAGTCACCAACTTGATTAATTAGAACATAAATATTGGGACTGATTCTTAAGCATAGTGTCACTTACACGGGGTGATGTCGGATCCTTCTACTGCAACACTAATAAGCAGGATGGCCGTCTGTAAGTGAGCTAGACGAATGCTACCTTTACCACCAAACGAAACGTCCGTATTTCAGTTTCGGAATCACAAGTACAGTTAAGAATCGGTATGTTTGTGTCCTAGAATGCTATCAGGTGAAGTTATTATCTTTACACCGACCCTATTGTCCGAAACTTTTCGGACTTTTTGTTTATGAGCTCCAGTTGAACGTCGTTTGATTATGAAGGTTAATTTCTTTCTGGTTGTCACGAATAGATTTTATTCTCATGTGCTGGGAAAGCCGCGATCAAGACCAATCAATTGTGACTGCTTCTAGCTCCTGGACTGTATTCAAAAATTAGTAATTTTTAATCATATCAAACTAATATCTACAAAATCTTTTGTAGTCAACCTTATTATTTACACTACCTCTTCGCTCTCCCCTGACTCAAGTTCGTTGCGTTTTTTCCAATCTTGATAGGAGTCGAGGGATTAAGTTAATTTCCTTTCAAGATTGTTATACTATGGGCGGTCGAACTGTCTCTCATAACATCCTGCCCGCCATCCCAATCATCCGCTCTAAAATTA---CATGATATCATCTTCTGTCAGCCACTCACTTTTCAACCAGCAAGTTACAAGTTCAAACTATCATCAAGTTTGGTTTGGACAACCGAGCAATAGCCCCACACTAACAGTGTGATTTAAACCGTACATAGCGAATGAATTACATTTGACACTTGTAACATTTTGTAACAGTTTCACTATGGATATGTTGATATCTGTCTTTTTGATGTGTAAACATATCTAACACTACCTATCACCGATTCTTTTCTCATTACCTTTCTTGCTTATGTTTCCTAATTACTGTAAAAATACTGTATAAATCTTCACTCAATTATGCTTGAGCCAGCTTCGCTGCCAGTGATGCTCAGATCACATCGACATTCATCATTTTAGTA]
[-] EMBL CD089978 [CGGAAGAATTGGCTTCTTATGGAATAAAATGTTATGCCTTTGTAAGGATTGGTAGCATAAAATAACTATCGGAGGATGTTAGTTTATTAGTCACCAACTTGATTAATTAGAACATAAATATTGGGACTGATTCTTAAGCATAGTGTCACTTACACGGGGTGATGTCGGATCCTTCTACTGCAACACTAATAAGCAGGATGGCCGTCTGTAAGTGAGCTAGACGAATGCTACCTTTACCACCAAACGAAACGTCCGTATTTCAGTTTCGGAATCACAAGTACAGTTAAGAATCGGTATGTTTGTGTCCTAGAATGCTATCAGGTGAAGTTATTATCTTTACACCGACCCTATTGTCCGAAACTTTTCGGACTTTTTGTTTATGAGCTCCAGTTGAACGTCGTTTGATTATGAAGGTTAATTTCTTTCTGGTTGTCACGAATAGATTTTATTCTCATGTGCT ]
[+] EMBL CD158853 [ GTATGTTTGTGTCCTAGAATGCTATCAGGTGAAGTTATTATCTTTACACCGACCCTATTGTCCGAAACTTTTCGGACTTTTTGTTTATGAGCTCCAGTTGAACGTCGTTTGATTATGAAGGTTAATTTCTTTCTGGTTGTCACGAATAGATTTTATTCTCATGTACTGGGAAAGCCGCGATCAAGACCAATCAATTGTGACTGCTTCTAGCTCCTGGACTGTATTCAAAAATTAGTAATTTTTAATCATATCAAACTAATATCTACAAAATCTTTTGTAGTCAACCTTATTATTTACACTACCTCTTCGCTCTCCCCTGACTCAAGTTCGTTGCGTTTTTTCCAATCTTGATAGGAGTCGAGGGATTAAGTTAATTTCCTTTCAAGATTGTTATACTATGGGCGGTCGAACTGTCTCTCATAACATCCTGCCCGCCATCCCAATCATCCGCTCTAAAATTA CATGATATC ]
[+] EMBL CD084197 [ ggcacgaggGATAGGAGTCGAGGGATTAAGTTAATTTCCTTTCAAGATTGTTATACTATGGGCGGTCGAACTGTCTCTCATAACATCCTGCCCGCCATCCCAATCATCCGCTTTAGAATTAAATCATGATATCATCTTCTGTCAGCCACTCACTTTTCAACCAGCAAGTTACAAGTTCAAACTATCATCAAGTTTGGTTTGGACAACCGAGCAATAGCCCCACACTAACAGTGTGATTTAAACCGTACATAGCGAATGAATTACATTTGACACTTGTAACATTTTGTAACAGTTTCACTATGGATATGTTGATATCTGTCTTTTTGATGTGTAAACATATCTAACACTACCTATCACCGATTCTTTTCTCATTACCTTTCTTGCTTATGTTTCCTAATTACTGTAAAAATACTGTATAAATCTTCACTCAATTATGCTTGAGCCAGCTTCGCTGCCAGTGATGCTCAGATCACATCGACATTCATCATTTTAGTA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||