cluster # 5011

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Schistosoma mansoni
cluster # 5011 cluster # 5011 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5011#0 length = 457 sequences # 3

consensusID : consensus_5011#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 457
fasta sequence

                              [ATCCGTTCACTCATTGAACTGGCCTGTTCATGCGTGTATCATAACTGATGATTTGCTTCCTCCTTTCTCTGGGTGGAATTTCTTTCAGTCTTTTAAAAGGATAGTGTCTTGTTTGCGTGCAATGATTCCTCCTAAAGTTTCATCCTGGTTTAAATCTATTTTTAAGTTTGTAACAAACTATGAGATACAAGTATTCAATTGGTTTGGGAAAAAAATACTTCCTGCATGGATTCCTGCTTATTCATGCGAATGTTCATTTAAACATTTTCCATGTTTAACTTCTGACGGATTTGAAGTATCAATGCAATGTAATTATTTAGCTCCTGCCTTATTTTTGGAACGATTGTTAAAAGCAAGATTTGTTGATTCTTCATCTTCTCTTTTAACTACTTCACCAGAAAAAACATTTGACAGCTCAACTATGCGTGTGGTGATAGTTTCATCAGAGATTCCCAAA]

[+] EMBL CD160030             [ATCCGTTCACTCATTGAACTGGCCTGTTCATGCGTGTATCATAACTGATGATTTGCTTCCTCCTTTCTCTGGGTGGAATTTCTTTCAGTCTTTTAAAAGGATAGTGTCTTGTTTGCGTGCAATGATTCCTCCTAAAGTTTCATCCTGGTTTAAATCTATTTTTAAGTTTGTAACAAACTATGAGATACAAGTATTCAATTGGTTTGGGAAAAAAATACTTCCTGCATGGATTCCTGCTTATTCATGCGAATGTTCATTTAAACATTTTCCATGTTTAACTTCTGACGGATTTGAAGTATCAATGCAATGTAATTATTTAGCTCCTGCCTTATTTTTGGAACGATTGTTAAAAGCAAGATTTGTTGATTCTTCATCTTCTCTTTTAACTACTTCACCAGAAAAAACATTTGACAGCTCAACTATGCGTGTGGTGATAGTTTCATCAGAAATTCC    ]
[+] EMBL CD160218             [ATCCGTTCACTCATTGAACTGGCCTGTTCATGCGTGTATCATAACTGATGATTTGCTTCCTCCTTTCTCTGGGTGGAATTTCTTTCAGTCTTTTAAAAGGATAGTGTCTTGTTTGCGTGCAATGATTCCTCCTAAAGTTTCATCCTGGTTTAAATCTATTTTTAAGTTTGTAACAAACTATGAGATACAGGTATTCAATTGGTTTGGGAAAAAAATACTTCCTGCATGGATTCCTGCTTATTCATGCGAATGTTCATTTAAACATTTTCCATGTTTAACTTCTGACGGATTTGAAGTATCAATGCAATGTAATTATTTAGCTCCTGCCTTATTTTTGGAACGATTGTTAAAAGCAAGATTTGTTGATTCTTCATCTTCTCTTTTAACTACTTCACCAGAAAAAACATTTGACAGATCAACTATGCGTGTGGTGATAGTTTCATCAGAGAT       ]
[-] EMBL CD166314             [                                                                                                                                    TAAAGTTTCATCCTGGTTTAAATCTATTTTTAAGTTTGTAACAAACTATGAGATACAAGTATTCAATTGGTTTGGGAAAAAAATACTTCCTGCATGGATTCCTGCTTATTCATGCGAATGTTCATTTAAACATTTTCCATGTTTAACTTCTGACGGATTTGAAGTATCAATGCAATGTAATTATTTAGCTCCTGCCTTATTTTTGGAACGATTGTTAAAAGCAAGATTTGTTGATTCTTCAGCTTCTCTTTTAACTACTTCACCAGAAAAAACATTTGACAGCTCAACTATGCGTGTGGTGATAGTTTCATCAGAGATTCACAAA]




>consensus_5011#0
ATCCGTTCACTCATTGAACTGGCCTGTTCATGCGTGTATCATAACTGATGATTTGCTTCC
TCCTTTCTCTGGGTGGAATTTCTTTCAGTCTTTTAAAAGGATAGTGTCTTGTTTGCGTGC
AATGATTCCTCCTAAAGTTTCATCCTGGTTTAAATCTATTTTTAAGTTTGTAACAAACTA
TGAGATACAAGTATTCAATTGGTTTGGGAAAAAAATACTTCCTGCATGGATTCCTGCTTA
TTCATGCGAATGTTCATTTAAACATTTTCCATGTTTAACTTCTGACGGATTTGAAGTATC
AATGCAATGTAATTATTTAGCTCCTGCCTTATTTTTGGAACGATTGTTAAAAGCAAGATT
TGTTGATTCTTCATCTTCTCTTTTAACTACTTCACCAGAAAAAACATTTGACAGCTCAAC
TATGCGTGTGGTGATAGTTTCATCAGAGATTCCCAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case