cluster # 5030

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Schistosoma mansoni
cluster # 5030 cluster # 5030 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5030#0 length = 596 sequences # 3

consensusID : consensus_5030#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 596
fasta sequence

                              [TCGGACAAATTTCTTCGATGACTTCATACTCCACTAACGTGCCACCTATGATCCAATCATTGTGAACAACTATCATATGTGTTATATTACCTTTTTCACATTTGAATGTACCGCTGGTTTTTGATTCCCTAAAACTTTCTTCGTCTTCTATATAAAATTTATCATAATGGATGGTTATCTTTCCATTCGGATATATCAGACAAGTTATCTTGGCTATATCCTCTACATCGCTAACTGTTTTCACAGAAGACCATTTGACGGCGAATAATTCCTTCTCATTCAAAATCTCTATATCAAAATACGGAATTTTTTTCTATACGATTTGAAATTTGTCCCAGATACATTTCTCCATATAAATCTATATCACCAGAAGTGGTAATCACAGTTTCTTTAACGTGAGTACCATAATATTCAAACGACATATCCGGAGTAAATGATTGATTACTAGAGAATCTTTTAAATTCTCCTTTCACAATTGGATGAGGTTGA-CCCAGACTAATTCGCTGTGAATATTTATAAAAACGAGCATCTAGATGTGAATAGTTTTCAAAAGTTACTTTGCTATAGTTCAGTAATCCAGAATATATACAAATATC]

[+] EMBL CD161074             [TCGGACAAATTTCTTCGATGACTTCATACTCCACTAACGTGCCACCTATGATCCAATCATTGTGAACAACTATCATATGTGTTATATTACCTTTTTCACATTTGAATGTACCGCTGGTTTTTGATTCCCTAAAACTTTCTTCGTCTTCTATATAAAATTTATCATAATGGATGGTTATCTTTCCATTCGGATATATCAGACAAGTTATCTTGGCTATATCCTCTACATCGCTAACTGTTTTCACAGAAGACCATTTGACGGCGAATAATTCCTTCTCATTCAAAATCTCTATATCAAAATACGGAATTTTTTTCTATACGATTTGAAATTTGTCCCAGATACATTTCTCCATATAAATCTATATCACCAGAAGTGGTAATCACAGTTTCTTTAACGTGAGTACCATAATATTCAAACGACATATCCGGAGTAAATGATTGATTACTAGAGAATCTTTTAAATTCTCCTTTCACAATTGGATGAGGTTGA CCCAGACTAATTCGCTGTGAATATTTATAAAAACGAGCATCTAGATGTGAATAGTTTTCAAAAGTTACTTTGCTATAGTTCAGTAATCCAGAATATATACAAATATC]
[+] EMBL CD116551             [                                            CCTATGATCCAATCATTGTGAACAACTATCATATGTGTTATATTACCTTTTTCACATTTGAATGTACCGCTGATTTTTGATTCCCTAAAACTTTCTTCGTCTTCTATATAAAATTTATCATAATGGATGGTTATCTTTCCATTCGGATATATCAGACAAGTTATCTTGGCTATATCCTCTACATCGCTAACTGTTTTCACAGAAGACCATTTGACGGCGAATAATTCCTTCTCATTCAAAATCTCTATATCAAAATACGGAA TTTTTTCTATACGATTTGAAATTTGTCCCAGATACATTTCTCCATATAAATCTATATCACCAGAAGTGGTAATCACAGTTTCTTTAACGTGAGTACCATGATATTCAAACGACATATCCGGAGTAAATGATTGATTACTAGAGAATCTTTTAAATTCTCCTTTCACAATTGGATGAGGTTGA CCCAGACTAATT                                                                                               ]
[-] EMBL CD118199             [                                                                                                                                                                                                                                                TCACAGAAGACCATTTGACGGCGAATAATTCCTTCTCATTCAAAATCTCTATATCAAAATACGGAATTTTTTT TATACGATTTGAAATTTGTCCCAGATACATTTCTCCATATAAATCTATATCACCAGAAGTGGTAATCACAGTTTCTTTAACGTGAGTACCATTATATTCCAACGACATATTCGGAGTTAATGATTGATTA TAAAAGATTTTTTTAATTTTCCTTTCACCATTGGAAGAGGTTGACCCCAGACTATTTCCCTGTGAATATTTATAAAAACGAGCGTCTAGATGTGAATA                                                      ]




>consensus_5030#0
TCGGACAAATTTCTTCGATGACTTCATACTCCACTAACGTGCCACCTATGATCCAATCAT
TGTGAACAACTATCATATGTGTTATATTACCTTTTTCACATTTGAATGTACCGCTGGTTT
TTGATTCCCTAAAACTTTCTTCGTCTTCTATATAAAATTTATCATAATGGATGGTTATCT
TTCCATTCGGATATATCAGACAAGTTATCTTGGCTATATCCTCTACATCGCTAACTGTTT
TCACAGAAGACCATTTGACGGCGAATAATTCCTTCTCATTCAAAATCTCTATATCAAAAT
ACGGAATTTTTTTCTATACGATTTGAAATTTGTCCCAGATACATTTCTCCATATAAATCT
ATATCACCAGAAGTGGTAATCACAGTTTCTTTAACGTGAGTACCATAATATTCAAACGAC
ATATCCGGAGTAAATGATTGATTACTAGAGAATCTTTTAAATTCTCCTTTCACAATTGGA
TGAGGTTGACCCAGACTAATTCGCTGTGAATATTTATAAAAACGAGCATCTAGATGTGAA
TAGTTTTCAAAAGTTACTTTGCTATAGTTCAGTAATCCAGAATATATACAAATATC

clustalw multiple alignements is not computed in this case