cluster # 5048

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Schistosoma mansoni
cluster # 5048 cluster # 5048 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5048#0 length = 789 sequences # 3

consensusID : consensus_5048#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 789
fasta sequence

                              [GGGACACGAACTCGAGAGAAAATTGATTTAGATGGTATTCGATCGGGCAACGGTGAGACAATGACAAACGATATCTCCATTAATAATAGTAATGATAATCAGACAACGTCCGATGTAAGTACTAGTAATATTAACAGCAACGTTGACGATAAGTCACATCCAATTAGTTTAATTCGTACAAATAAAATACTACGCGGCTTCAAACAATGGCTTCAACGTCCTGTTGGTGTAAATAATAATAATAATAATAGTAATCA-TAATAATGCCAGTAGTACCAGTAATAGTACTAGTACTAATTGTCCCTCTGTTGGTTCAATTGATTTCTCAACTGCCAATAATCCGACCAATACAATGAACAACGTTGTCAACTCTACCACTGGTTATTTTAGTGGTAGCTGTGGAGGTACCGCCAACAGCAGTGTAAATTATCATAATGTAAACAGTAATAACAATTGTGATATATCTTCTACTGTGGATGTTTCACATTTGGAATCTCCGAAATATGAACATAAATTCAGCTCACTAATGACAGTTGTTGATCCTNC-AACATGACCGATTTAGATAGTCTTGGTCCTGTATTCGGTGCTCCATTAGAATCTCAATTAGAAAGTCCTGATTATCCATGTGTTCCAGTCATGATTACAAGCCTATTGTTGTAGCCTTAGAGATACATGGACTTAGTTTACCTGGCCTGTATAGAAAACGTGGTCGACATCGTACAATTGCACAATTTATTTCCTCAGTAAACTTGCATCATGAACATATTGACCTGATGTTTAGTTTGGATGC]

[-] EMBL CD116417             [GGGACACGAACTCGAGAGAAAATTGATTTAGATGGTATTCGATCGGGCAACGGTGAGACAATGACAAACGATATCTCCATTAATAATAGTAATGATAATCAGACAACGTCCGATGTAAGTACTAGTAATATTAACAGCAACGTTGACGATAAGTCACATCCAATTAGTTTAATTCGTACAAATAAAATACTACGCGGCTTCAAACAATGGCTTCAACGTCCTGTTGGTGTAAATAATAATAATAATAATAGTAATCA TAATAATGCCAGTAGTACCAGTAATAGTACTAGTACTAATTGTCCCTCTGTTGGTTCAATTGATTTCTCAACTGCCAATAATCCGACCAATACAATGAACAACGTTGTCAACTCTACCGCTGGTTATTTTAGTGGTAGCTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD155082             [     ACGAACTCGAGAGAAAATTGATTTAGATGGTATTCGATCGGACAACACTGAGACAATGACAAACGATATCTCCATTAATAATAGTAATGGTAATCAGACAACGTCCGATGTAACTACTAGTAATATTAACAGCAACGTTGACGATAAGTCACATCCAATTAGTTTAATTCGTACAAATAAAATACTACGTGGCTTCAAACAATGGCTTCAACGTCCTGTTGGTGTAAATAATAATAATAATAATAGTAATCATTAATAATGCCAGTAGTACCAGTAATAGTACTAGTACTAATTGTCCCTCTGTTGGTTCAATTAATTTCTCAACTGCCAATAATCCGACCAATACAATGAACAACGTTGTCAACTCTACCACTGGTTATTTTAGTGGTAGCTGTGGAGGTACCGCCAACAGCAGTGTAAATTATCATAATGTAAACAGTAATAACAATTGTGATATATCTTCTACTGTGGATGTTTCACATTTGGAATCTCCGAAATATGAACATAAATTCAGCTCACTAATGACAGTTGTTGATCCTNC AACATGACCGATTT                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD117202             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACAACGTTGTCAACTCTACCACTGGTTATTTTAGTGGTAGCTGTGGAGGTACCGCCAACAGCAGTGTAAATTATCATAATGTAACCAGTAATAACAATTGTGATATATCTTATACTGTGGATGTTTCACATTTGGAATCTCCGAATAATGAACATAAATTCAGCTCACTAATGACAGTTGTTGATCCTCCAAACATGACCGATTTAGATAGTCTTGGTCCTGTATTCGGTGCTCCATTAGAATCTCAATTAGAAAGTCCTGATTATCCATGTGTTCCAGTCATGATTACAAGCCTATTGTTGTAGCCTTAGAGATACATGGACTTAGTTTACCTGGCCTGTATAGAAAACGTGGTCGACATCGTACAATTGCACAATTTATTTCCTCAGTAAACTTGCATCATGAACATATTGACCTGATGTTTAGTTTGGATGC]




>consensus_5048#0
GGGACACGAACTCGAGAGAAAATTGATTTAGATGGTATTCGATCGGGCAACGGTGAGACA
ATGACAAACGATATCTCCATTAATAATAGTAATGATAATCAGACAACGTCCGATGTAAGT
ACTAGTAATATTAACAGCAACGTTGACGATAAGTCACATCCAATTAGTTTAATTCGTACA
AATAAAATACTACGCGGCTTCAAACAATGGCTTCAACGTCCTGTTGGTGTAAATAATAAT
AATAATAATAGTAATCATAATAATGCCAGTAGTACCAGTAATAGTACTAGTACTAATTGT
CCCTCTGTTGGTTCAATTGATTTCTCAACTGCCAATAATCCGACCAATACAATGAACAAC
GTTGTCAACTCTACCACTGGTTATTTTAGTGGTAGCTGTGGAGGTACCGCCAACAGCAGT
GTAAATTATCATAATGTAAACAGTAATAACAATTGTGATATATCTTCTACTGTGGATGTT
TCACATTTGGAATCTCCGAAATATGAACATAAATTCAGCTCACTAATGACAGTTGTTGAT
CCTNCAACATGACCGATTTAGATAGTCTTGGTCCTGTATTCGGTGCTCCATTAGAATCTC
AATTAGAAAGTCCTGATTATCCATGTGTTCCAGTCATGATTACAAGCCTATTGTTGTAGC
CTTAGAGATACATGGACTTAGTTTACCTGGCCTGTATAGAAAACGTGGTCGACATCGTAC
AATTGCACAATTTATTTCCTCAGTAAACTTGCATCATGAACATATTGACCTGATGTTTAG
TTTGGATGC

clustalw multiple alignements is not computed in this case