cluster # 5056

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Schistosoma mansoni
cluster # 5056 cluster # 5056 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5056#0 length = 856 sequences # 3

consensusID : consensus_5056#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 856
fasta sequence

                              [CCCTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGGAACTCTAATATTGTCCTCTTATTTGACGGATTACAATGACATAGGCTCATCGTCCGCCTTTTTATCTTCCTCTAAATAGAATGATCCCATTTAACTATAAATTTCACAAATGGACATCGACTGAAACTTTTGAACAATAAACAATATTATGCCCAACAACCTCACCTTGCTTTTCAATAATTCTCGTTAGTTTAAGTCTGTGATGGAAAGTTTCTTTAAAACGAGTGAATTTTAAATCATCCATCCAGAAACTGAACATTAATCAATACTTATTTATTCCATGACCATTTATTCCCATCTTCCTCATTCTGATGTTTTCGCTTTTTTTATTTCTAGTCAGAACTACGTTATGTTTCATTTCTGAACAGTATGATGTTTCCTTCTGTTTATTTGTGGATAGTTTTGTGACCTTGATTCACCTTATTGGAGTTTGTCAGTAGGAAACATTTAAATGGGCGAACTTCTGATGCTTTTTTCCATTTTTATTTTCTATAATTTGCTATACTGAGGGTTTTTTCAAAATTTACCTCATGACAAACTGTTTAGTTACATGATATGGTGATTTTAATCACTATCCTGTTATCTTTTAGTTTGACCAAGATCATATCACCGGTTAATTTCATTCGTGACTTCTTTCTTCTATTAATTTATAGAAATTTTCTGAAAGGGAGCTACTAGCGT-AATAATAATGTGCTTTTTTCTATATTA-TCGAAATAAGTCTTCC-AAAAATATTTAAAAATAAATGGATGCTTTCATAATACTTAAAACACTCATCATTTTTCCATCTTACGTAATTTTATTATTTGCTACGCTATTGTAATCTGCGTT]

[+] EMBL CD082712             [CCCTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGGAACTCTAATATTGTCCTCTTATTTGACGGATTACAATGACATAGGCTCATCGTCCGCCTTTTTATCTTCCTCTAAATAGAATGATCCCATTTAACTATAAATTTCACAAATGGACATCGACTGAAACTTTTGAACAATAAACAATATTATGCCCAACAACCTCACCTTGCTTTTCAATAATTCTCGTTAGTTTAAGTCTGTGATGGAAAGTTTCTTTAAAACGAGTGAATTTTAAATCATCCATCCAGAAACTGAACATTAATCAATACTTATTTATTCCATGACCATTTATTCCCATCTTCCTCATTCTGATGTTTTCGCTTTTTTTATTTCTAGTCAGAACTACGTTATGTTTCATTTCTGAACAGTATGATGTTTCCTTCTGTTTATTTGTGGATAGTTTTGTGACCTTGATTCACCTTATTGGAGTTTGTCAGTAGGAAACATTTAAATGGGCGAACTTCTGATGCTTTTTTCCATTTTTATTTTCTATAATTTGCTATACTGAGGGTTTTTTCAAAATTTACCTCATGACAAACTGTTTAGTTACATGATATGGTGATTNTAATCACTATCCTGTTATCTTTTAGTTTGACCAAGATCATATCACCGGTTAATTTCATTCGTGACTTCTTTCTTCTATTAATTTATAGAAATTTTCTGAAAGGGAGCTACTAGCGT AATAATAATGTGCTTTTTTCTATATTATTCGAAATAAGTCTTCC AAAAATATTTAAAAATAAA GGATGCTTT                                                                           ]
[-] EMBL CD076302             [                                                                                                                                                                                                      TTTTCAATAATTCTCGTTAGTTTAAGTCTGTGATGGAAAGTTTCTTTAAAACGAGTGAATTTTAAATCATCCATCCAGAAACTGAACATTAATCAATACTTATTTATTCCATGACCATTTATTCCCATCTTCCTCATTCTGATGTTTTCGCTTTTTTTATTTCTAGTCAGAACTACGTTATGTTTCATTTCTGAACAGTATGATGTTTCCTTCTGTTTATTTGTGGATAGTTTTGTGACCTTGATTCACCTTATTGGAGTTTGTCAGTAGGAAACATTTAAATGGGCGAACTTCTGATGCTTTTTTCCATTTTTATTTTCTATAATTTGCTATACTGAGGGTTTTTTCAAAATTTACCTCATGACAAACTGTTTAGTTACATGATATGGTGATTTTAATCACTATCCTGTTATCTTTTAGTTTGACCAAGATCATATCACCGGTTAATTTCATTCGTGACTTCTTTCTTCTATTAATTTATAGAAATTTTCTGAAAGGGAGCTACTAGCGT AATAATAATGTGCTTTTTTCTATATTA TCGAAATAAGTCTTCCAAAAAATATTTAAAAATAAATGGATGCTTTC                                                                          ]
[+] EMBL AI447066             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATTTCTGAACAGTATGATGTTTCCTTCTGTTTATTTGTGGATAGTTTTGTGACCTTGATTCACCTTATTGGAGTTTGTCAGTAGGAAACATTTAAATGGGCGAACTTCTGATGCTTTTTTCCATTTTTATTTTCTATAATTTGCTATACTGAGGGTTTTTTCAAAATTTACCTCATGACAAACTGTTTAGTTACATGATATGGTGATTTTAATCACTATCCTGTTATCTTTTAGTTTGACCAAGATCATATCACCGGTTAATTTCATTCGTGACTTCTTTCTTCTATTAATTTATAGAAATTTTCTGAAAGGGAGCTACTAGCGTGAATAATAATGTGCGTTTTTCTATATTA TCGAAATAAGTCTTCC AAAAATATTT AAAATAAATGGGTGCTTTCATAATACTTAAAACACTCATCATTTTTCCATCTTACGTAATTTTATTATTTGCTACGCTATTGTAATCTGCGTT]




>consensus_5056#0
CCCTCGAGCCAANAATTCGGCACGAGGGAACTCTAATATTGTCCTCTTATTTGACGGATT
ACAATGACATAGGCTCATCGTCCGCCTTTTTATCTTCCTCTAAATAGAATGATCCCATTT
AACTATAAATTTCACAAATGGACATCGACTGAAACTTTTGAACAATAAACAATATTATGC
CCAACAACCTCACCTTGCTTTTCAATAATTCTCGTTAGTTTAAGTCTGTGATGGAAAGTT
TCTTTAAAACGAGTGAATTTTAAATCATCCATCCAGAAACTGAACATTAATCAATACTTA
TTTATTCCATGACCATTTATTCCCATCTTCCTCATTCTGATGTTTTCGCTTTTTTTATTT
CTAGTCAGAACTACGTTATGTTTCATTTCTGAACAGTATGATGTTTCCTTCTGTTTATTT
GTGGATAGTTTTGTGACCTTGATTCACCTTATTGGAGTTTGTCAGTAGGAAACATTTAAA
TGGGCGAACTTCTGATGCTTTTTTCCATTTTTATTTTCTATAATTTGCTATACTGAGGGT
TTTTTCAAAATTTACCTCATGACAAACTGTTTAGTTACATGATATGGTGATTTTAATCAC
TATCCTGTTATCTTTTAGTTTGACCAAGATCATATCACCGGTTAATTTCATTCGTGACTT
CTTTCTTCTATTAATTTATAGAAATTTTCTGAAAGGGAGCTACTAGCGTAATAATAATGT
GCTTTTTTCTATATTATCGAAATAAGTCTTCCAAAAATATTTAAAAATAAATGGATGCTT
TCATAATACTTAAAACACTCATCATTTTTCCATCTTACGTAATTTTATTATTTGCTACGC
TATTGTAATCTGCGTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case