These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5077#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 548 fasta sequence [TGATTTGATCAAATCTAAAATAGTNTGATTCCATATTGGAGGCTGCCAACCGCCAACACAACGATCACCTGGTATCAAACGATAACCTAATTGATGAATAGTTTGACGCTGTTTTCTTGGTAATGTACAAGGATCTAACGGTGGAATATAGGGGTTTCGAATACAATCCTTTGTTCTTCAGATGGAGAAGGTATATCTGTTACTTTTACTGAAGTTGATTTAATCTTATCCAGAGATTCTTCACTATCATCCAACACATCATCATGATGAGTTTGACTTTTCATTGAATCATCTTCATTATTGTTAACTTGATATCGATTTGATTCGTTAATACTCCATTGTCCAGTACGTAATGGAATAGTATGCCAACATTTACCTTCATCTGTACTAAAACGTAAAACATCTGGCCATAGAGTTTCAGCTGGGACAGCTACAATTAAACCTCCACGATTAGCTATTTGATAATGATGTGGTCCATCAAGTGCTTTAAGCCATGTATATCCACCATCAGAACTGACAAATACATCGGCTGGTGTATTTTTCAAATG] [+] EMBL CD116118 [TGATTTGATCAAATCTAAAATAGTTTGATTCCATATTGGAGGCTGCCAACCGCCAACACAACGATCACCTGGTATCAAACGATAACCTAATTGATGAATAGTTTGACGCTGTTTTCTTGGTAATGTACAAGGATCTAACGGTGGAATATAGGGGTTTCGAATACAATCCTTTGTTCTTCAGATGGAGAAGGTATATCTGTTACTTTTACTGAAGTTGATTTAATCTTATCCAGAGATTCTTCACTATCATCCAACACATCATCATGATGAGTTTGACTTTTCATTGAATCATCTTCATTATTGTTAACTTGATATCGATTTGATTCGTTAATACTCCATTGTCCAGTACGTAATGGAATAGTATGCCAACATTTACCTTCATCTGTACTAAAACGTAAAACATCTGGCCATAGAGTTTCAGCTGGGACAGCTACAATTAAACCTCCACGATTAGCTATTTGATAATGATGTGGTCCATCAAGTGCTTTAAGCCATGTATATCCACCATCAGAACTGACANATACATCGGCTGGTGTATTTTTCAAAT ] [-] EMBL CD116239 [ GATTTGATCAAATCTAAAATAGTNTGATTCCATATTGGAGGCTGCCAACCGCCAACACAACGATCACCTGGTATCAAACGATAACCTAATTGATGAATAGTTTGACGCTGTTNTCTTGGTAATGTACAAGGATCTAACGGTGGAATATAGGGGTTTCGAATACAATCCTTTGTTCTTCAGATGGAGAAGGTATATCTGTTACTTTTACTGAAGTTGATTTAATCTTATCCAGAGATTCTTCACTATCATCCAACACATCATCATGATGAGTTTGACTTTTCATTGAATCATCTTCATTATTGTTAACTTGATATCGATTTGATTCGTTAATACTCCATTGTCCAGTACGTAATGGAATAGTATGCCAACATTTACCTTCATCTGTACTAAAACGTAAAACATCTGGCCATAGAGTTTCAGCTGGGACAGCTACAATTAAACCTCCACGATTAGCTATTTGATAATGATGTGGTCCATCAAGTGCTTTAAGCCATGTATATCCACCATCAGAACTGACAAATACATCGGCTGGTGTATTTTTCAAATG] [-] EMBL CD116098 [ agaTTGATC AATCT AANTAGTNT ATTCCATA TGGAGGCTGCCAACCGCCAACACAACGATCACCTGGTATCAAACGATAACCTAATTGATGAATAGTTTGACGCTGTTTTCTTGGTAATGTACAAGGATCTAACGGTGGAATATAGGGGTTTCGAATACAATCCTTTGTTCTTCAGATGGAGAAGGTATATCTGTTACTTTTACTGAAGTTGATTTAATCTTATCCAGAGATTCTTCACTATCATCCAACACATCATCATGATGAGTTTGACTTTTCATTGAATCATCTTCATTATTGTTAACTTGATATCGATTTGATTCGTTAATACTCCATTGTCCAGTACGTAATGGAATAGTATGCCAACATTTACCTTCATCTGTACTAAAACGTAAAACATCTGGCCATAGAGTTTCAGCTGGGACAGCTACAATTAAACCTCCACGATTAGCTATTTGATAATGATGTGGTCCATCAAGTGCTTTAAGCCATGTATATCCACCATCAGAACTGACAAATACATCGGCTGGTGTATTTTTCAAATG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||