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Schistosoma mansoni
cluster # 5083 cluster # 5083       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5083#0 length = 948 sequences # 3  
consensusID : consensus_5083#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 948
fasta sequence 
                              [TTTTAGCTGATTATTTTCCAATACATTTAGTAATTAGTAAAGAGTTTATTATATATAATGAAATCTATAAACAAATTAAACAACATTCCCATTCTATGAATTCTATTATTAATAAACATACTGTTGATAATGAAGATTATAAAAATGATGATGAAATGAATGAAGAATCTTTGGTTAAAGAAAGTTTATCTACAGATGTCAATTATTTGGTTGGATTTCATCCTCATGGAATACTTGCTACAGGAGCATTCATTAATTTTGCTACAGAGGCTACTGGTTTTTCAAAAGTATTTCCTACCTTCAAACCATATCTAGCTATATTGAAAGCTCATTTTATAGCACCGTTTTATCGGGATTTCTTAATGTTATTTGGAATGATTGCTGCTACTAAGAAAGGATTACATTACCTTTTGGATAAGAATAGTTGCAAACAAACAGGAAATTTTGTTGTTGTTGTTCTTGGTGGAGCTCCTGAAGCCTTAGATTCAAAACCTGGAACATATGTGATGCATATTAATCAACGTTTTGGTTTTTTCAAATTGGCCTTAAAAACTGGATCATATTTGGTACCGTGTATATCATTTGGTGAACAGAGCTTATATCATCAAGTTCCAAATGAAAAAGGATCATGGATACGATGGTTACAGGATAAATTTACGTCGATTTTTACCGTTGCATTGCCTGTTTTCTATGCTCGTGGTCCCTTTCCGTATCGTAAACCAGTCTATACTGTAGTTGGTGCTCCAATTCAATGCGAACAAATAAATGAACCTACAGATGAACAAGTTGCACATATTAAACAAATTTATAAAGAAAAACTCCGAACACTATTTGAAGATTACAAGGCGATTTACGATCCAGAAGCTAATGATATTGAATTTGTATAGATGAAAAAATTATGTATAATTTTGTGGTTAATATTAAGAAATTCCTAAGACTATTTTTGAT]

[+] EMBL BF936138             [TTTTAGCTGATTATTTTCCAATACATTTAGTAATTAGTAAAGAGTTTATTATATATAATGAAATCTATAAACAAATTAAACAACATTCCCATTCTATGAATTCTATTATTAATAAACATACTGTTGATAATGAAGATTATAAAAATGATGATGAAATGAATGAAGAATCTTTGGTTAAAGAAAGTTTATCTACAGATGTCAATTATTTGGTTGGATTTCATCCTCATGGAATACTTGCTACAGGAGCATTCATTAATTTTGCTACAGAGGCTACTGGTTTTTCAAAAGTATTTCCTACCTTCAAACCATATCTAGCTATATTGAAAGCTCATTTTATAGCACCGTTTTATCGGGATTTCTTAATGTTATTTGGAATGATTGCTGCTACTAAGAAAGGATTACATTACCTTTTGGATAAGAATAGTTGCAAACAAACAGGAAATTTTGTTGTTGTTGTTCTTGGTGGAGCTCCTGAAGCCTTAGATTCAAAACCTGGAACATATGTGATGCATATTAATCAACGTTTTGGTTTTTTCAAATTGGCCTTAAAAACTGGATCATATTTGGTACCGTGTATATCATTTGGTGAACAGAGCTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL BG930814             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCTTGAAGCCTTAGATTCAAAACCTGGAACATATGTGATGCATATTAATCAACGTTTTGGTTTTTTCAAATTGGCCTTAAAAACTGGATCATATTTGGTACCGTGTATATCATTTGGTGAACAGAGCTTATATCATCAAGTTCCAAATGAAAAAGGATCATGGATACGATGGTTACAGGATAAATTTACGTCGATTTTTACCGTTGCATTGCCTGTTTTCTATGCTCGTGGTCCCTTTCCGTATCGTAAACCAGTCTATACTGTAGTTGGTGCTCCAATTCAATGCGAACAAATAAATGAACCTACAGATGAACAAGTTGCACATATTAAACAAATTTATAAAGAAAAACTCCGAACACTATTTGAAGATTACAAGGCGATTTACGAT                                                                                           ]
[-] EMBL AI977333             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AACCTGGAACATATGTGATGCATATTAATCAACGTTTTGGTTTTTTCAAATTGGCCTTAAAAACTGGATCATATTTGGTACCGTGTATATCATTTGGTGAACAGAGCTTATATCATCAAGTTCCAAATGAAAAAGGATCATGGATACGATGGTTACAGGATAAATTTACGTCGATTTTTACCGTTGCATTGCCTATTTTCTATGCTCGTGGTCCCTTTCCGTATCGTAAACCAGTCTATACTGTAGTTGGTGCTCCAATTCAATGCGAACAAATAAATGAACCTACAGATGAACAAGTTGCACATATTAAACAAATTTATAAAGAAAAACTCCGAACACTATTTGAAGATTACAAGGCGATTTACGATCCAGAAGCTAATGATATTGAATTTGTATAGATGAAAAAATTATGTATAATTTTGTGGTTAATATTAAGAAATTCCTAAGACTATTTTTGAT]




>consensus_5083#0
TTTTAGCTGATTATTTTCCAATACATTTAGTAATTAGTAAAGAGTTTATTATATATAATG
AAATCTATAAACAAATTAAACAACATTCCCATTCTATGAATTCTATTATTAATAAACATA
CTGTTGATAATGAAGATTATAAAAATGATGATGAAATGAATGAAGAATCTTTGGTTAAAG
AAAGTTTATCTACAGATGTCAATTATTTGGTTGGATTTCATCCTCATGGAATACTTGCTA
CAGGAGCATTCATTAATTTTGCTACAGAGGCTACTGGTTTTTCAAAAGTATTTCCTACCT
TCAAACCATATCTAGCTATATTGAAAGCTCATTTTATAGCACCGTTTTATCGGGATTTCT
TAATGTTATTTGGAATGATTGCTGCTACTAAGAAAGGATTACATTACCTTTTGGATAAGA
ATAGTTGCAAACAAACAGGAAATTTTGTTGTTGTTGTTCTTGGTGGAGCTCCTGAAGCCT
TAGATTCAAAACCTGGAACATATGTGATGCATATTAATCAACGTTTTGGTTTTTTCAAAT
TGGCCTTAAAAACTGGATCATATTTGGTACCGTGTATATCATTTGGTGAACAGAGCTTAT
ATCATCAAGTTCCAAATGAAAAAGGATCATGGATACGATGGTTACAGGATAAATTTACGT
CGATTTTTACCGTTGCATTGCCTGTTTTCTATGCTCGTGGTCCCTTTCCGTATCGTAAAC
CAGTCTATACTGTAGTTGGTGCTCCAATTCAATGCGAACAAATAAATGAACCTACAGATG
AACAAGTTGCACATATTAAACAAATTTATAAAGAAAAACTCCGAACACTATTTGAAGATT
ACAAGGCGATTTACGATCCAGAAGCTAATGATATTGAATTTGTATAGATGAAAAAATTAT
GTATAATTTTGTGGTTAATATTAAGAAATTCCTAAGACTATTTTTGAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)