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Schistosoma mansoni
cluster # 5121 cluster # 5121       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5121#0 length = 1180 sequences # 3  

consensusID : consensus_5121#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1180
fasta sequence
                              [CGGACTTCTGTTTTCGGCTTTGTTGTTAACATAAATGGCTGTAGATATTATATCGAATTAAGATAGAGAGTTTAGGACATAGAGTTTAAGTTAAGGTTTAGGACTATGCATCAAATTACATATACGTTAACTATAAATCACAGACTATGATCTTAACTGTAACCCTGAATCCTATCTAGAATTTTGATTATAACCTTTATGTATGCATATATCCTAATTCGCAGTCACGATCTCTATCCATATCTATCCATACTTACTGCTTTCTGAATAACTGAATAAAATCTGACAAGGTAGTTTAAAGACGCTCAAGTCCGCTCTTATATTTATGTAACCGGTGCTTGAAGCTGTTTTTCCATTCGTTTAAAACATCACTGAACCAATAGGCTATAGTTAGCTGTCGTAATATTAGAAATTCTGGTGTGGATAAGAAAGATTATTTTATCGTCGCTAGTAAAACTACGATAAGCACCGTGAAAAATCCCGTTGCANAACGAGAGAAGTCTTCGATAAAGAACGAACTTTTATAGAACAGCAAGCTAATCTTACGTGAAAGTTATATCTCGAGTCATTTCAACTGATAGTCTGAATATATATCAGTGACTTAAAAGGTCATAATATAAAAGGTCCAATTGATGGTGAATAGAAATCAGCGAGGAGACAAAAGAAGGAAAAATCGAATTGTTCCTGATACTATTGCGTGAAGCATGGAGGGATCGGGTGACTCGGATCCTGAATCCAGACTTCCACATGCTTCAGATTAAGTTGAGCTGTTTGTCTGTGGCATATTCCCGAACTATTCTTCAGGTGTTCATGTCAAAAACTAATAAGCTTAAGCAAGAGAGCCAATTGTAGTATTGATCCCTCGCCACGTAAACTTCTTAAAGTCTGAGTAACAAAATTTCAAGTTAACTTGTTTCCCGGAGAAAGATAATAACGATACGCGGGTGTAACTGGAAGATAAAATCAAGAGGAAGATGGATCTATCTGAAGGAGTAACCTGGAGATTGTTTAGTGTGACTACGAACTACCACTCGCTGCTTGTTAAAATAAACAAGACCGATATGGTTACTCAAGAAAGCAAATAATACTGCAGAAGGATGCTTTGTTCAGCAATTACTAATTAATACATTCATAATGAAAATGAATATCATTTTAAATCTTCGGTCAATAAATAAATTTG]

[+] EMBL CD078239             [CGGACTTCTGTTTTCGGCTTTGTTGTTAACATAAATGGCTGTAGATATTATATCGAATTAAGATAGAGAGTTTAGGACATAGAGTTTAAGTTAAGGTTTAGGACTATGCATCAAATTACATATACGTTAACTATAAATCACAGACTATGATCTTAACTGTAACCCTGAATCCTATCTAGAATTTTGATTATAACCTTTATGTATGCATATATCCTAATTCGCAGTCACGATCTCTATCCATATCTATCCATACTTACTGCTTTCTGAATAACTGAATAAAATCTGACAAGGTAGTTTAAAGACGCTCAAGTCCGCTCTTATATTTATGTAACCGGTGCTTGAAGCTGTTTTTCCATTCGTTTAAAACATCACTGAACCAATAGGCTATAGTTAGCTGTCGTAATATTAGAAATTCTGGTGTGGATAAGAAAGATTATTTTATCGTCGCTAGTAAAACTACGATAAGCACCGTGAAAAATCCCGTTGCANAACGAGAGAAGTCTTCGATAAAGAACGAACTTTTATAGAACAGCAAGCTAATCTTACGTGAAAGTTATATCTCGAGTCATTTCAACTGATAGTCTGAATATATATCAGTGACTTANNAGGTCATAATATAAAAGGTCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD078317             [CGGACTTCTGTTTTCGGCTTTGTTGTTAACATAAATGGCTGTAGATATTATATCGAATTAAGATAGAGAGTTTAGGACATAGAGTTTAAGTTAAGGTTTAGGACTATGCATCAAATTACATATACGTTAACTATAAATCACAGACTATGATCTTAACTGTAACCCTGAATCCTATCTAGAATTTTGATTATAACCTTTATGTATGCATATATCCTAATTCGCAGTCACGATCTCTATCCATATCTATCCATACTTACTGCTTTCTGAATAACTGAATAAAATCTGACAAGGTAGTTTAAAGACGCTCAAGTCCGCTCTTATATTTATGTAACCGGTGCTTGAAGCTGTTTTTCCATTCGTTTAAAACATCACTGAACCAATAGGCTATAGTTAGCTGTCGTAATATTAGAAATTCTGGTGTGGATAAGAAAGATTATTTTATCGTCGCTAGTAAAACTACGATAAGCACCGTGAAAAATCCCGTTGCAAAACGAGAGAAGTCTTCGATAAAGAACGAACTTTTATAGAACAGCAAGCTAATCTTACGTGAAAGTTATATCTCGAGTCATTTCAACTGATAGTCTGAATATATATCAGTGACTTAAAAGGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD072876             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACTGATAGTCTGAATATATATCAGTGACTTAAAAGGTCATAATATAAAAGGTCCAATTGATGGTGAATAGAAATCAGCGAGGAGACAAAAGAAGGAAAAATCGAATTGTTCCTGATACTATTGCGTGAAGCATGGAGGGATCGGGTGACTCGGATCCTGAATCCAGACTTCCACATGCTTCAGATTAAGTTGAGCTGTTTGTCTGTGGCATATTCCCGAACTATTCTTCAGGTGTTCATGTCAAAAACTAATAAGCTTAAGCAAGAGAGCCAATTGTAGTATTGATCCCTCGCCACGTAAACTTCTTAAAGTCTGAGTAACAAAATTTCAAGTTAACTTGTTTCCCGGAGAAAGATAATAACGATACGCGGGTGTAACTGGAAGATAAAATCAAGAGGAAGATGGATCTATCTGAAGGAGTAACCTGGAGATTGTTTAGTGTGACTACGAACTACCACTCGCTGCTTGTTAAAATAAACAAGACCGATATGGTTACTCAAGAAAGCAAATAATACTGCAGAAGGATGCTTTGTTCAGCAATTACTAATTAATACATTCATAATGAAAATGAATATCATTTTAAATCTTCGGTCAATAAATAAATTTG]


>consensus_5121#0 CGGACTTCTGTTTTCGGCTTTGTTGTTAACATAAATGGCTGTAGATATTATATCGAATTA AGATAGAGAGTTTAGGACATAGAGTTTAAGTTAAGGTTTAGGACTATGCATCAAATTACA TATACGTTAACTATAAATCACAGACTATGATCTTAACTGTAACCCTGAATCCTATCTAGA ATTTTGATTATAACCTTTATGTATGCATATATCCTAATTCGCAGTCACGATCTCTATCCA TATCTATCCATACTTACTGCTTTCTGAATAACTGAATAAAATCTGACAAGGTAGTTTAAA GACGCTCAAGTCCGCTCTTATATTTATGTAACCGGTGCTTGAAGCTGTTTTTCCATTCGT TTAAAACATCACTGAACCAATAGGCTATAGTTAGCTGTCGTAATATTAGAAATTCTGGTG TGGATAAGAAAGATTATTTTATCGTCGCTAGTAAAACTACGATAAGCACCGTGAAAAATC CCGTTGCANAACGAGAGAAGTCTTCGATAAAGAACGAACTTTTATAGAACAGCAAGCTAA TCTTACGTGAAAGTTATATCTCGAGTCATTTCAACTGATAGTCTGAATATATATCAGTGA CTTAAAAGGTCATAATATAAAAGGTCCAATTGATGGTGAATAGAAATCAGCGAGGAGACA AAAGAAGGAAAAATCGAATTGTTCCTGATACTATTGCGTGAAGCATGGAGGGATCGGGTG ACTCGGATCCTGAATCCAGACTTCCACATGCTTCAGATTAAGTTGAGCTGTTTGTCTGTG GCATATTCCCGAACTATTCTTCAGGTGTTCATGTCAAAAACTAATAAGCTTAAGCAAGAG AGCCAATTGTAGTATTGATCCCTCGCCACGTAAACTTCTTAAAGTCTGAGTAACAAAATT TCAAGTTAACTTGTTTCCCGGAGAAAGATAATAACGATACGCGGGTGTAACTGGAAGATA AAATCAAGAGGAAGATGGATCTATCTGAAGGAGTAACCTGGAGATTGTTTAGTGTGACTA CGAACTACCACTCGCTGCTTGTTAAAATAAACAAGACCGATATGGTTACTCAAGAAAGCA AATAATACTGCAGAAGGATGCTTTGTTCAGCAATTACTAATTAATACATTCATAATGAAA ATGAATATCATTTTAAATCTTCGGTCAATAAATAAATTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)