cluster # 5122

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Schistosoma mansoni
cluster # 5122 cluster # 5122 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5122#0 length = 680 sequences # 3

consensusID : consensus_5122#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 680
fasta sequence

                              [CGGCGTCAGCAGCAACCTCAGCACGTAACAGTTCTTCTACACATTTTTCCACCACAACTGCTGGAGATATCTTTGTCACAGAATTTCGTCAGCTAACTACATTGTAATCATCAGAACACATTTCAACTGGACGTAGACAAACACACCATACAAATAGTTCTACCACTACTACTAGTAATAATAGTAATATATCCACTTCTGGACAGAATGGATTTATTATATCGAAATCACCCTACATACCTTATTTACTAATTAAAGGAAACTTCTTAGAATATGTAAGAATTTTAATGCGAAAATTACTCCTCCAAATAACTCGTATTGAATCGGTACCTGTCGGATATTGGAACGAATTAATGGCTGCTACCTTGAGTCCGATTAGTGGTTCTGGTTCATGTAATGGAGGTGCTCCTGGTTATGCAATCGCTTTAGTCGCAGATTTATTAAGCGTACTTAAACCACTCAAACAATTGACAAGATCACAACAAAATCAGTTGCTACATGTTTTATTACCGGCTTGTGCTCAATTAAGATATTTGGTATTTCAACGTGCCGATTGTACTGTTAAAGCTCAAACTGTATTTGACTCTATGCTTGCTGAATTGACTGGTGTTTCTGGTATACAAATTAAAGAATTTCTGTCTACTGTATTAGATGTCTTAGCTGAATATCCGATTGATGAT]

[+] EMBL CD115731             [CGGCGTCAGCAGCAACCTCAGCACGTAACAGTTCTTCTACACATTTTTCCACCACAACTGCTGGAGATATCTTTGTCACAGAATTTCGTCAGCTAACTACATTGTAATCATCAGAACACATTTCAACTGGACGTAGACAAACACACCATACAAATAGTTCTACCACTACTACTAGTAATAATAGTAATATATCCACTTCTGGACAGAATGGATTTATTATATCGAAATCACCCTACATACCTTATTTACTAATTAAAGGAAACTTCTTAGAATATGTAAGAATTTTAATGCGAAAATTACTCCTCCAAATAACTCGTATTGAATCGGTACCTGTCGGATATTGGAACGAATTAATGGCTGCTACCTTGAGTCCGATTAGTGGTTCTGGTTCATGTAATGGAGGTGCTCCTGGTTATGCAATCGCTTTAGTCGCAGATTTATTAAGCGTACTTAAACCACTCAAACAGTTGACAGGATCACAACAAAATCAGTTGCTACATGTTTTATTACCGGCTTGGGCTCAATTAAGATTTTT                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD153763             [                                                                                                                                                                                                                                AAATCACCTTACATACCTTATTTATTAATTAAAGGAAACTTCTTAGATTATGTAAGAATTTTAATGCGAAAATTACTCCTCCAAATAACTCGTATTGAATCGGTACCTGTCGGATATTGGAACGAATTAATGGCTGCTACCTTGAGTCCGATTAGTGGTTCTGGTTCATGTAATGGAGGTGCTCCTGGTTATGCAATCGCTTTAGTCGCAGATTTATTAAGCGTACTTAAACCACTCAAACAATTGACAAGATCACAACAAAATCAGTTGCTACATGTTTTATTACCGGCTTGTGCTCAATTAAGATATT                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD131975             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATGGCTGCTACCTTGAGTCCGATTAGTGGTTCTGGTTCATGTAATGGAGGTGCTCCTGGTTATGCAATCGCTTTAGTCGCAGATTTATTAAGCGTACTTAAACCACTCAAACAATTGACAAGATCACAACAAAATCAGTTGCTACATGTTTTATTACCGGCTTGTGCTCAATTAAGATATTTGGTATTTCAACGTGCCGATTGTACTGTTAAAGCTCAAACTGTATTTGACTCTATGCTTGCTGAATTGACTGGTGTTTCTGGTATACAAATTAAAGAATTTCTGTCTACTGTATTAGATGTCTTAGCTGAATATCCGATTGATGAT]




>consensus_5122#0
CGGCGTCAGCAGCAACCTCAGCACGTAACAGTTCTTCTACACATTTTTCCACCACAACTG
CTGGAGATATCTTTGTCACAGAATTTCGTCAGCTAACTACATTGTAATCATCAGAACACA
TTTCAACTGGACGTAGACAAACACACCATACAAATAGTTCTACCACTACTACTAGTAATA
ATAGTAATATATCCACTTCTGGACAGAATGGATTTATTATATCGAAATCACCCTACATAC
CTTATTTACTAATTAAAGGAAACTTCTTAGAATATGTAAGAATTTTAATGCGAAAATTAC
TCCTCCAAATAACTCGTATTGAATCGGTACCTGTCGGATATTGGAACGAATTAATGGCTG
CTACCTTGAGTCCGATTAGTGGTTCTGGTTCATGTAATGGAGGTGCTCCTGGTTATGCAA
TCGCTTTAGTCGCAGATTTATTAAGCGTACTTAAACCACTCAAACAATTGACAAGATCAC
AACAAAATCAGTTGCTACATGTTTTATTACCGGCTTGTGCTCAATTAAGATATTTGGTAT
TTCAACGTGCCGATTGTACTGTTAAAGCTCAAACTGTATTTGACTCTATGCTTGCTGAAT
TGACTGGTGTTTCTGGTATACAAATTAAAGAATTTCTGTCTACTGTATTAGATGTCTTAG
CTGAATATCCGATTGATGAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case