cluster # 5127

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Schistosoma mansoni
cluster # 5127 cluster # 5127 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5127#0 length = 850 sequences # 3

consensusID : consensus_5127#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 850
fasta sequence

                              [TCCACTTCCAATGTTTTCCCCTAATTTCCTCTTCAAATGGAACCTGGTTTGCTTTCTCCTACAACAGTCTGTTGCTGATGGTAACCGGTCAACGAACACTGAGTATCGTGTGCAGACAATTGTTTACAAATACTTGTACCTTTTTGATGTGGTAGTAGTCCAGGTTTCAACTCCGTACAGTAGAACTATCTTGACGTTCGTTTTGAAGATTGTGACTTTGATATTGGTTGACAGTTGTTCCATATGTTCTTCAACTGTAGGAATGCAGTCCTTACTCTGGCAATCCTCGCCTTTACATCTGCATCAGATCCTCCCTGTTCATCAATGATGCTACCCAGATACGTGAATGTTTTCCAGAGAAACTCTGGGTTGGTGTACAAAACTCCCAAACTCTAGTTATGTTTGGCTACTCGAAAAAACGCTCTACATGCAAAACATTCATGTAATTTAGATGTTTTGCATTGCATCCCTTTTAACGATATAACTAATATTTTGTATTAAATTCTCATTACAGTTTTGCAAAGATCAACTTATCACTGTAGCATATGTCAATGAAAATAAATATAAAAAGCCAATGGGAAGTGTTTTTGTTGGATCATCTCCAGAATTCGATATTGCTGTTTACACGGTTGCTTTTGCCTTACATCCTACATCTGTGTTTGATGTGAATATCGCTGGATGCAAAGTACGTATAACATGTCATGAATTATTTCCCTCTGAAATGGGTACATGCTATATGGGGTGAACAATATATGTATCTGCATAAACATTTGTTTCCCCTGACCTTAAAATCAATAGCAAACTTAAATTTAATATGTCATTTGACAGATTAGTGTTCTGAAAATATATA]

[+] EMBL CD078250             [TCCACTTCCAATGTTTTCCCCTAATTTCCTCTTCAAATGGAACCTGGTTTGCTTTCTCCTACAACAGTCTGTTGCTGATGGTAACCGGTCAACGAACACTGAGTATCGTGTGCAGACAATTGTTTACAAATACTTGTACCTTTTTGATGTGGTAGTAGTCCAGGTTTCAACTCCGTACAGTAGAACTATCTTGACGTTCGTTTTGAAGATTGTGACTTTGATATTGGTTGACAGTTGTTCCATATGTTCTTCAACTGTAGGAATGCAGTCCTTACTCTGGCAATCCTCGCCTTTACATCTGCATCAGATCCTCCCTGTTCATCAATGATGCTACCCAGATACGTGAATGTTTTCCAGAGAAACTCTGGGTTGGTGTACAAAACTCCCAAACTCTAGTTATGTTTGGCTACTCGAAAAAACGCTCTACATGCAAAACATTCATGTAATTTAGATGTTTTGCATTGCATCCCTTTTAACGATATAACTAATATTTTGTATTAAATTCTCATTACAGTTTTGCANAGATCAACTTATCACTGTAGCATATGTCAATGAAAATAAATATAAAAAGCCAATGGGAAGTGTTTTTGTTGGATCATCTCCAGAATTCGATATTG                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD078330             [TCCACTTCCAATGTTTTCCCCTAATTTCCTCTTCAAATGGAACCTGGTTTGCTTTCTCCTACAACAGTCTGTTGCTGATGGTAACCGGTCAACGAACACTGAGTATCGTGTGCAGACAATTGTTTACAAATACTTGTACCTTTTTGATGTGGTAGTAGTCCAGGTTTCAACTCCGTACAGTAGAACTATCTTGACGTTCGTTTTGAAGATTGTGACTTTGATATTGGTTGACAGTTGTTCCATATGTTCTTCAACTGTAGGAATGCAGTCCTTACTCTGGCAATCCTCGCCTTTACATCTGCATCAGATCCTCCCTGTTCATCAATGATGCTACCCAGATACGTGAATGTTTTCCAGAGAAACTCTGGGTTGGTGTACAAAACTCCCAAACTCTAGTTATGTTTGGCTACTCGAAAAAACGCTCTACATGCAAAACATTCATGTAATTTAGATGTTTTGCATTGCATCCCTTTTAACGATATAACTAATATTTTGTATTAAATTCTCATTACAGTTTTGCAAAGATCAACTTATCACTGTAGCATATGTCAATGAAAATAAATATAAAAAGCCAATGCGAAGT                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD072888             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGAAACTCTGGGTTGGTGTACAAAACTCCCAAACTCTAGTTATGTTTGGCTACTCGAAAAAACGCTCTACATGCAAAACATTCATGTAATTTAGATGTTTTGCATTGCATCCCTTTTAACGATATAACTAATATTTTGTATTAAATTCTCATTACAGTTTTGCAAAGATCAACTTATCACTGTAGCATATGTCAATGAAAATAAATATAAAAAGCCAATGGGAAGTGTTTTTGTTGGATCATCTCCAGAATTCGATATTGCTGTTTACACGGTTGCTTTTGCCTTACATCCTACATCTGTGTTTGATGTGAATATCGCTGGATGCAAAGTACGTATAACATGTCATGAATTATTTCCCTCTGAAATGGGTACATGCTATATGGGGTGAACAATATATGTATCTGCATAAACATTTGTTTCCCCTGACCTTAAAATCAATAGCAAACTTAAATTTAATATGTCATTTGACAGATTAGTGTTCTGAAAATATATA]




>consensus_5127#0
TCCACTTCCAATGTTTTCCCCTAATTTCCTCTTCAAATGGAACCTGGTTTGCTTTCTCCT
ACAACAGTCTGTTGCTGATGGTAACCGGTCAACGAACACTGAGTATCGTGTGCAGACAAT
TGTTTACAAATACTTGTACCTTTTTGATGTGGTAGTAGTCCAGGTTTCAACTCCGTACAG
TAGAACTATCTTGACGTTCGTTTTGAAGATTGTGACTTTGATATTGGTTGACAGTTGTTC
CATATGTTCTTCAACTGTAGGAATGCAGTCCTTACTCTGGCAATCCTCGCCTTTACATCT
GCATCAGATCCTCCCTGTTCATCAATGATGCTACCCAGATACGTGAATGTTTTCCAGAGA
AACTCTGGGTTGGTGTACAAAACTCCCAAACTCTAGTTATGTTTGGCTACTCGAAAAAAC
GCTCTACATGCAAAACATTCATGTAATTTAGATGTTTTGCATTGCATCCCTTTTAACGAT
ATAACTAATATTTTGTATTAAATTCTCATTACAGTTTTGCAAAGATCAACTTATCACTGT
AGCATATGTCAATGAAAATAAATATAAAAAGCCAATGGGAAGTGTTTTTGTTGGATCATC
TCCAGAATTCGATATTGCTGTTTACACGGTTGCTTTTGCCTTACATCCTACATCTGTGTT
TGATGTGAATATCGCTGGATGCAAAGTACGTATAACATGTCATGAATTATTTCCCTCTGA
AATGGGTACATGCTATATGGGGTGAACAATATATGTATCTGCATAAACATTTGTTTCCCC
TGACCTTAAAATCAATAGCAAACTTAAATTTAATATGTCATTTGACAGATTAGTGTTCTG
AAAATATATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case