cluster # 5169

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Schistosoma mansoni
cluster # 5169 cluster # 5169 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5169#0 length = 1275 sequences # 3
consensusID : consensus_5169#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1275
fasta sequence
                              [CTATTATTTTTTACTATATATTCTATTCCGATTAAAATAATTCATGGAAGTTGTGAACCAGCTCAATCTGTAATTATATGTACCAATGAATTCCCATCAAGTTCGTTTCTAAATAATTTAACTGGTAAATATGAATTGATTATAAGAAGTGTAAAAACTAAACTAGACATTAAATCATTTGAAAAATATCAAGGTGCACAAATTAAACGTTTACAAATCGAGAAATCCACTTTTATTCAATTGAACCGAAATTTTTTAATATATTTAGTCGTAATAGTCTAGAACGCTTATCATTGAGTAATGTCGATGGTCCGTATCGTTTAGATGCTCAATCTCTAGCTGGTCTTAGTGAAAAATTAAATACATTGCGTATTAATGATCATGTATTAGATAACATTGATGATTTTGTTATATTAAATAAATTAACACGATTATATCTTGTTCGAACACATTTAACACAATTACCAAATAATTCTAAACAATTACTAACACATTTGGAAGATATTAACTTATCTG-AAACTTATTAACTTATATACCATGGAAAGAACTAGCTGAACGTATACAAAATGATCAATTTTTAAAAATCCAACTAAGTGAAAATTTATGGAATTGCGATTGTAGTGTAAAACCATTAATTGAATTGAAACCGGAAGCGAAAGCTAAAATTTATGAGTTTCGTTGTCATACCCCGGAAAACTTGAAATCTCGCGAACTGATTGAATTAACAGTTGATGATGTATGTAAAGAAGAATTAAGTCAATCAGTGATACCATCGAAAGATTTATCATCAAATTATAATATCGGTGTATTCGATCAGTATCAACCAACTGGACAAGACAATAGTAATCAACAACAAAATGGTGATTTCGGTGGAATATCAGGTCGCCATGATTTGAAACCAGTCAATGCAGATGGTAATGAACAACAATTGGCTACTGCTGGTAGTAGTGGTATTTCCATTGAAATGATCATTGTAATTTGTGTTGTCATAGCATGTATTATTGGTATCATCATAAGTTTAATTGTTTACTCGTCACGTAAACGTGCACAACGTAGAAAACAACAAGAGAGAAATCTTGGTGTTTCACATAAAACGAATTCACATTGTGCTGTCATTGAACGTAATCCATCAAGTCGTACACCAAGTGAAAAAACAAGCCACTTCTCAATCACCATATAATTATTCTCGTGGTATTTCACAGCCGGAAAAAGAACCTTTAGCTCAATGGTTATGGTAATTATCGAGATGGACGTTTGTAAAAGGATGAAAAACAA]

[+] EMBL CD115238             [CTATTATTTTTTACTATATATTCTATTCCGATTAAAATAATTCATGGAAGTTGTGAACCAGCTCAATCTGTAATTATATGTACCAATGAATTCCCATCAAGTTCGTTTCTAAATAATTTAACTGGTAAATATGAATTGATTATAAGAAGTGTAAAAACTAAACTAGACATTAAATCATTTGAAAAATATCAAGGTGCACAAATTAAACGTTTACAAATCGAGAAATCCACTTTTATTCAATTGAACCGAAATTTTTTAATATATTTAGTCGTAATAGTCTAGAACGCTTATCATTGAGTAATGTCGATGGTCCGTATCGTTTAGATGCTCAATCTCTAGCTGGTCTTAGTGAAAAATTAAATACATTGCGTATTAATGATCATGTATTAGATAACATTGATGATTTTGTTATATTAAATAAATTAACACGATTATATCTTGTTCGAACACATTTAACACAATTACCAAATAATTCTAAACAATTACTAACACATTTGGAAGATATTAACTTATCTG AAACTTATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AW017449             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gcacgagttTAAACAATTACTAACACATTTGGAAGATATTAACTTATCTGAAAACTTATTAACTTATATACCATGGAAAGAACTAGCTGAACGTATACAAAATGATCAATTTTTAAAAATCCAACTAAGTGAAAATTTATGGAATTGCGATTGTAGTGTAAAACCATTAATTGAATTGAAACCGGAAGCGAAAGCTAAAATTTATGAGTTTCGTTGTCATACCCCGGAAAACTTGAAATCTCGCGAACTGATTGAATTAACAGTTGATGATGTATGTAAAGAAGAATTAAGTCAATCAGTGATACCATCGAAAGATTTATCATCAAATTATAATATCGGTGTATTCGATCAGTATCAACCAACTGGACAAGACAATAGTAATCAACAACAAAATGGTGATTTCGGTGGAATATCAGGTCGCCATGATTTGAAACCAGTCAATGCAGATGGTAATGAACAACAATTGGCTACTGCTGGTAGTAGTGGTATTTCCATTGAAATGATCATTGTAATTTGTGTTGTCATAGCATGTATTATTGGTATCATCATAAGTTTAATTGTTTACTCGTCACGTAAACGTGCACAACGTAGAAAACAACAAGAGAGAAATCTTGGTGTTTCACATAAAACG                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD177689             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAAGCTTAATTGTTTATTCGTCACGTAAACGTGCACAACGTAGAAAACAACAAGAGAGAAATCTTGGTGTTTCACATAAAACGAATTCACATTGTGCTGTCATTGAACGTAATCCATCAAGTCGTACACCAAGTGAAAAAACAAGCCACTTCTCAATCACCATATAATTATTCTCGTGGTATTTCACAGCCGGAAAAAGAACCTTTAGCTCAATGGTTATGGTAATTATCGAGATGGACGTTTGTAAAAGGATGAAAAACAA]




>consensus_5169#0
CTATTATTTTTTACTATATATTCTATTCCGATTAAAATAATTCATGGAAGTTGTGAACCA
GCTCAATCTGTAATTATATGTACCAATGAATTCCCATCAAGTTCGTTTCTAAATAATTTA
ACTGGTAAATATGAATTGATTATAAGAAGTGTAAAAACTAAACTAGACATTAAATCATTT
GAAAAATATCAAGGTGCACAAATTAAACGTTTACAAATCGAGAAATCCACTTTTATTCAA
TTGAACCGAAATTTTTTAATATATTTAGTCGTAATAGTCTAGAACGCTTATCATTGAGTA
ATGTCGATGGTCCGTATCGTTTAGATGCTCAATCTCTAGCTGGTCTTAGTGAAAAATTAA
ATACATTGCGTATTAATGATCATGTATTAGATAACATTGATGATTTTGTTATATTAAATA
AATTAACACGATTATATCTTGTTCGAACACATTTAACACAATTACCAAATAATTCTAAAC
AATTACTAACACATTTGGAAGATATTAACTTATCTGAAACTTATTAACTTATATACCATG
GAAAGAACTAGCTGAACGTATACAAAATGATCAATTTTTAAAAATCCAACTAAGTGAAAA
TTTATGGAATTGCGATTGTAGTGTAAAACCATTAATTGAATTGAAACCGGAAGCGAAAGC
TAAAATTTATGAGTTTCGTTGTCATACCCCGGAAAACTTGAAATCTCGCGAACTGATTGA
ATTAACAGTTGATGATGTATGTAAAGAAGAATTAAGTCAATCAGTGATACCATCGAAAGA
TTTATCATCAAATTATAATATCGGTGTATTCGATCAGTATCAACCAACTGGACAAGACAA
TAGTAATCAACAACAAAATGGTGATTTCGGTGGAATATCAGGTCGCCATGATTTGAAACC
AGTCAATGCAGATGGTAATGAACAACAATTGGCTACTGCTGGTAGTAGTGGTATTTCCAT
TGAAATGATCATTGTAATTTGTGTTGTCATAGCATGTATTATTGGTATCATCATAAGTTT
AATTGTTTACTCGTCACGTAAACGTGCACAACGTAGAAAACAACAAGAGAGAAATCTTGG
TGTTTCACATAAAACGAATTCACATTGTGCTGTCATTGAACGTAATCCATCAAGTCGTAC
ACCAAGTGAAAAAACAAGCCACTTCTCAATCACCATATAATTATTCTCGTGGTATTTCAC
AGCCGGAAAAAGAACCTTTAGCTCAATGGTTATGGTAATTATCGAGATGGACGTTTGTAA
AAGGATGAAAAACAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case