Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5177 cluster # 5177       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5177#0 length = 935 sequences # 3  
consensusID : consensus_5177#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 935
fasta sequence 
                              [TGAGCTGCATGGAGTTTTCATGTTCAAGTCAGTCGCGAAAAAATAAACCACCGGTCGAAAAGATGGTATGCTCTGTGTGCAACCTTGGTAATGATGACAAATACCTCCTCTTGTGCGATGGTTGTGAAACCTATGGAGCATGTCACACGTACTGCCTTGATCCACCTTTGTCTGATGTTCCTAAGGGAAACTGGTACTGTCGTTCTTGCATAATAAGAAGATATAAGCGGTTAAATCGATATGAAGTTTTTGGATTTAAAAGCTCAAATGTAAAATATACTCTTCATACATTTGGGATTCGGGCTGATGATTTCAAGGCAAAGCACTTCGGAAAACCAACGCATATGGTTTCACTTGAAGAGGCTGAAGCGGAGTTTTGGCGCCTTGTTGGCTCCGAAGATACTGGAGTAAGTGTGGAGTATGGGGCCGACCTGAATGCTCGTGAACATGGGTCAGGCTTCCCAACTTCCCGACAAGGAAGGACCAGTCAGAAGTCGAAAAACTATGCTACTTCACCTTGGAATTTGAACAACACTCCTCTGCTAGATAATTCTGCTCTTAGATTTTTACCACGGAATATATCGGGAATGATAATTCCTTGGTGCCTATGTTGGTAATGGCGTTTTCTTGTTTTTGTTGGCACACAGAAGATCATTGGAGTTACTCCATTAACTATCTGCATATGGGTGAGCCGAAGACATGGTATGGAGTCCCAACGAACTACGCTGATGCTTTCGAATTGGCTATGGGTTCTGAGGTCCCTGAATTGTTTGTCAATTCTCCAGATTTATTGCATCATATGACTACGATGGTCTCACCATCTAGACTCCAAGCACATGGTGTCCCTGTTTATCGTACTGACCAAATGGTCGGTGAATTCGTAGTAACGTTTCCTCGTGCTTTCCATGCTGGTTTCAACCAAGGATTTAACTTTG]

[+] EMBL BF936741             [TGAGCTGCATGGAGTTTTCATGTTCAAGTCAGTCGCGAAAAAATAAACCACCGGTCGAAAAGATGGTATGCTCTGTGTGCAACCTTGGTAATGATGACAAATACCTCCTCTTGTGCGATGGTTGTGAAACCTATGGAGCATGTCACACGTACTGCCTTGATCCACCTTTGTCTGATGTTCCTAAGGGAAACTGGTACTGTCGTTCTTGCATAATAAGAAGATATAAGCGGTTAAATCGATATGAAGTTTTTGGATTTAAAAGCTCAAATGTAAAATATACTCTTCATACATTTGGGATTCGGGCTGATGATTTCAAGGCAAAGCACTTCGGAAAACCAACGCATATGGTTTCACTTGAAGAGGCTGAAGCGGAGTTTTGGCGCCTTGTTGGCTCCGAAGATACTGGAGTAAGTGTGGAGTATGGGGCCGACCTGAATGCTCGTGAACATGGGTCAGGCTTCCCAACTTCCCGACAAGGAAGGACCAGTCAGAAGTCGAAAAACTATGCTACTTCACCTTGGAATTTGAACAACACTCCTCTGCTAGATAATTCTGCTCTTAGATTTTTACCACGGAATATATCGGGAATGATAATTCCTTGGTGCCTATGTTGGTAATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD130114             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAACTATGCTACTTCACCTTGGAATGTGATCAACACTCCTCTGCTAGATAATTCTGCTCTTAGATTTTTACCACGGAATATATCGGGAATGATAATTCCTTGGTG CTATGTTGGT ATGGCGTTTTCTTGTTTTTGTTGGCACACAGAAGATCATTGGAGTTACTCCATTAACTATCTGCATATGGGTGAGCCGAAGACATGGTATGGAGTCCCAACGAACTACGCTGATGCTTTCGAATTGGCTATGGGTTCTGAGGTCCCTGAATTGTTTGTCAATTCTCCAGATTTA                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD162378             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CGAACTACGCTGATGCTTTCGAATTGGCTATGCGTTCTGAGGTCCCTGAATTGCTTGTCAATTCTCCAGATTTATTGCATCATATGACTACGATGGTCTCACCATCTAGACTCCAAGCACATGGTGTCCCTGTTTATCGTACTGACCAAATGGTCGGTGAATTCGTAGTAACGTTTCCTCGTGCTTTCCATGCTGGTTTCAACCAAGGATTTAACTTTG]




>consensus_5177#0
TGAGCTGCATGGAGTTTTCATGTTCAAGTCAGTCGCGAAAAAATAAACCACCGGTCGAAA
AGATGGTATGCTCTGTGTGCAACCTTGGTAATGATGACAAATACCTCCTCTTGTGCGATG
GTTGTGAAACCTATGGAGCATGTCACACGTACTGCCTTGATCCACCTTTGTCTGATGTTC
CTAAGGGAAACTGGTACTGTCGTTCTTGCATAATAAGAAGATATAAGCGGTTAAATCGAT
ATGAAGTTTTTGGATTTAAAAGCTCAAATGTAAAATATACTCTTCATACATTTGGGATTC
GGGCTGATGATTTCAAGGCAAAGCACTTCGGAAAACCAACGCATATGGTTTCACTTGAAG
AGGCTGAAGCGGAGTTTTGGCGCCTTGTTGGCTCCGAAGATACTGGAGTAAGTGTGGAGT
ATGGGGCCGACCTGAATGCTCGTGAACATGGGTCAGGCTTCCCAACTTCCCGACAAGGAA
GGACCAGTCAGAAGTCGAAAAACTATGCTACTTCACCTTGGAATTTGAACAACACTCCTC
TGCTAGATAATTCTGCTCTTAGATTTTTACCACGGAATATATCGGGAATGATAATTCCTT
GGTGCCTATGTTGGTAATGGCGTTTTCTTGTTTTTGTTGGCACACAGAAGATCATTGGAG
TTACTCCATTAACTATCTGCATATGGGTGAGCCGAAGACATGGTATGGAGTCCCAACGAA
CTACGCTGATGCTTTCGAATTGGCTATGGGTTCTGAGGTCCCTGAATTGTTTGTCAATTC
TCCAGATTTATTGCATCATATGACTACGATGGTCTCACCATCTAGACTCCAAGCACATGG
TGTCCCTGTTTATCGTACTGACCAAATGGTCGGTGAATTCGTAGTAACGTTTCCTCGTGC
TTTCCATGCTGGTTTCAACCAAGGATTTAACTTTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)