cluster # 5184

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Schistosoma mansoni
cluster # 5184 cluster # 5184 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5184#0 length = 693 sequences # 3

consensusID : consensus_5184#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 693
fasta sequence

                              [TTGTTGTCTTCGCCGTCGTCATTGTGGATAACTAACGGAAGAGAATAAATATGCGAGTACCGTCAACAATTGTAAAGAAACCAAGAAATCAATATGCTTTGTCTGTGATTAATCGATTTCTAGATGATTCCACTTTTGTCACTAATCATCTAAAAATTGGTACCGATGACAGCAATGATCCTATCACTGATGATAAAGATTTAATATTTCTGCGTAAATACTTGAAACGTTCATCCTTACGTCATTGCTTCAATCTAATTGACTGCATTGGTGATAATGACTCAAAGTCAATTATTGAGCGATTACGACCTCCTCAGCAGTTATTAAGAAATAGTTTAAAAGTCTTATCAGAGTTATGGTCTGATTTAGAAGAGTTTGTTATGCGTACTCGAGAAAAAGATGAACCACATGCTCATGAACTTTACGACCTACTGGCTGATGTTCATATTAGAGAGCTGTTGGTAGCTTACGATGATATTGCTAATTATCGATATGTTAATGAAGATTTCAATTTGATTATTATTCCTTTTGAGGATAATGATCAATTATTATGTAAGAATTCTAATAGTAATCTCAATGTACAGACCTCTTCAAAATTAGGGACAGGGGCAGAAGAAAATGAAGAACATTATAAATTATCCAAACGACATGACGAAACTCACTCCATGAATGTTCATCTAAAAAATCATCACC]

[+] EMBL CD188419             [TTGTTGTCTTCGCCGTCGTCATTGTGGATAACTAACGGAAGAGAATAAATATGCGAGTACCGTCAACAATTGTAAAGAAACCAAGAAATCAATATGCTTTGTCTGTGATTAATCGATTTCTAGATGATTCCACTTTTGTCACTAATCATCTAAAAATTGGTACCGATGACAGCAATGATCCTATCACTGATGATAAAGATTTAATATTTCTGCGTAAATACTTGAAACGTTCATCCTTACGTCATTGCTTCAATCTAATTGACTGCATTGGTGATAATGACTCAAAGTCAATTATTGAGCGATTACGACCTCCTCAGCAGTTATTAAGAAATAGTTTAAAAGTCTTATCAGAGTTATGGTCTGATTTAGAAGAATTTGTTATGCGTACTCGAGAAAAAGATGAACCACATGCTCATGAACTTTACGAGCT                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD115123             [                                                                                                                                                                                                                                                               TAATTGACTGCATTGGTGATAATGACTCAAAGTCAATTATTGAGCGATTACGACCTCCTCAGCAGTTATTAAGAAATAGTTTAAAAGTCTTATCAGAGTTATGGTCTGATTTAGAAGAGTTTGTTATGCGTACTCGAGAAAAAGATGAACCACATGCTCATGAACTTTACGACCTACTGGCTGATGTTCATATTAGAGAGCTGTTGGTAGCTTACGATGATATTGCTAATTATCGATATGTTAATGAAGATTTCAATTTGATTATTATTCCTTTTGAGGATAATGATCAATTATTATGTAAGAATTCTAATAGTAATCTCAATGTACAGACCTCTTCAAAATTAGGGACAGGGGCAGAAGAAAATGAAGAACATTATAAATTATCCAAACGACATGACGAAACTCACTCCATGAATGTTCATCTAAAAAATCATCACC]
[+] EMBL CD115104             [                                                                                                                                                                                                                                                               TAATTGACTGCATTGGTGATAATGACTCAAAGTCAATTATTGAGCGATTACGACCTCCTCAGCAGTTATTAAGAAATAGTTTAAAAGTCTTATCAGAGTTATGGTCTGATTTAGAAGAGTTTGTTATGCGTACTCGAGAAAAAGATGAACCACATGCTCATGAACTTTACGACCTACTGGCTGATGTTCATATTAGAGAGCTGTTGGTAGCTTACGATGATATTGCTAATTATCGATATGTTAATGAAGATTTCAATTTGATTATTATTCCTTTTGAGGATAATGATCAATTATTATGTAAGAATTCTAATAGTAATCTCAATGTACAGACCTCTTCAAAATTAGGGA                                                                                          ]




>consensus_5184#0
TTGTTGTCTTCGCCGTCGTCATTGTGGATAACTAACGGAAGAGAATAAATATGCGAGTAC
CGTCAACAATTGTAAAGAAACCAAGAAATCAATATGCTTTGTCTGTGATTAATCGATTTC
TAGATGATTCCACTTTTGTCACTAATCATCTAAAAATTGGTACCGATGACAGCAATGATC
CTATCACTGATGATAAAGATTTAATATTTCTGCGTAAATACTTGAAACGTTCATCCTTAC
GTCATTGCTTCAATCTAATTGACTGCATTGGTGATAATGACTCAAAGTCAATTATTGAGC
GATTACGACCTCCTCAGCAGTTATTAAGAAATAGTTTAAAAGTCTTATCAGAGTTATGGT
CTGATTTAGAAGAGTTTGTTATGCGTACTCGAGAAAAAGATGAACCACATGCTCATGAAC
TTTACGACCTACTGGCTGATGTTCATATTAGAGAGCTGTTGGTAGCTTACGATGATATTG
CTAATTATCGATATGTTAATGAAGATTTCAATTTGATTATTATTCCTTTTGAGGATAATG
ATCAATTATTATGTAAGAATTCTAATAGTAATCTCAATGTACAGACCTCTTCAAAATTAG
GGACAGGGGCAGAAGAAAATGAAGAACATTATAAATTATCCAAACGACATGACGAAACTC
ACTCCATGAATGTTCATCTAAAAAATCATCACC

clustalw multiple alignements is not computed in this case