cluster # 5216

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Schistosoma mansoni
cluster # 5216 cluster # 5216 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5216#0 length = 714 sequences # 3

consensusID : consensus_5216#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 714
fasta sequence

                              [TGGAAGATTATTAGCTGGTCTCTCTGATCGTTTATGTGTTTGGCCGTTTGAATCTATCCAACAATTTGATCTACCAAACGATGATTCTAATGATTCTTCAGATAATACAAGCAGTCCTGCTACTTTTATAAGACATGTTAGTGTTCAAGATAAAGTGCCCGCTTTAAATACACCGAAGTTCGAAATACAACAATGTCGTGTATTAAGAGTTCTTTCTTCTGGTGCATGCAATTTAACTGGGACATCACCACCTTTAATGGTTAGTTCAAGTCGTTTATTGGAGATTAATTCTAATGATAAAAATTATGGTCCATTTTCATCAATTGATCTTCCGCCTACTATTGTAACAGTCGATTCTAATACAGGCACATTATACATATTTGATCCAATTGGTTCTTTGTTTTAGTCTATTTTCATAAAACACTGTTGATTTATTTTGTTTCATTTTCTTGGATCAATCTATGATGATCATATTTAAATAGTCTGGTTACTGTATGTTTTAAGTATTATTTTGTTTATGTGTGTATACAAAATTGTGATTGATATAATTTTGTTTTATCATAATTATTTTTCGGCTTTTC-AATGTCGTAAATATTAGNTATTGGCTCTGNTTACTCGTTTATTCATTTGNTTGAAGATTTTTGTACATATAGATTTGCTTCACTCTGTATATATGTATGCATTATTTCTTC-ACCTTTGNTAAAT-AAATAGAGT]

[+] EMBL CD078590             [TGGAAGATTATTAGCTGGTCTCTCTGATCGTTTATGTGTTTGGCCGTTTGAATCTATCCAACAATTTGATCTACCAAACGATGATTCTAATGATTCTTCAGATAATACAAGCAGTCCTGCTACTTTTATAAGACATGTTAGTGTTCAAGATAAAGTGCCCGCTTTAAATACACCGAAGTTCGAAATACAACAATGTCGTGTATTAAGAGTTCTTTCTTCTGGTGCATGCAATTTAACTGGGACATCACCACCTTTAATGGTTAGTTCAAGTCGTTTATTGGAGATTAATTCTAATGATAAAAATTATGGTCCATTTTCATCAATTGATCTTCCGCCTACTATTGTAACAGTCGATTCTAATACAGGCACATTATACATATTTGATCCAATTGGTTCTTTGTTTTAGTCTATTTTCATAAAACACTGTTGATTTATTTTGTTTCATTTTCTTGGATCAATCTATGATGATCATATTTAAATAGTCTGGTTACTGTATGTTTTAAGTATTATTTTGTTTATGTGTGTATACAAAATTGTGATTGATATAATTTTGTTTTATCATAATTATTTTTCGGCTTTTC AATGTCGTAAATATTAGNTATTGGCTCTGNTTACTCGTTTATTCATTTGNTTGAAGATTTTTGTACATATAGATTTGCTTCACTCTGTATATATGTATGCATTATTTCTTC ACCTTTGNTAAAT AAATAGAG ]
[-] EMBL CD073055             [                                                                                                    GATAATACAAGCAGTCCTGNTACTTTTATAAGACATGTTAGTGTTCAAGATAAAGTGCCCGCTTTAAATACACCGAAGTTCGAAATACAACAATGTCGTGTATTAAGAGTTCTTTCTTCTGGTGCATGCAATTTAACTGGGACATCACCACCTTTAATGGTTAGTTCAAGTCGTTTATTGGAGATTAATTCTAATGATAAAAATTATGGTCCATTTTCATCAATTGATCTTCCGCCTACTATTGTAACAGTCGATTCTAATACAGGCACATTATACATATTTGATCCAATTGGTTCTTTGTTTTAGTCTATTTTCATAAAACACTGTTGATTTATTTTGTTTCATTTTCTTGGATCAATCTATGATGATCATATTTAAATAGTCTGGTTACTGTATGTTTTAAGTATTATTTTGTTTATGTGTGTATACAAAATTGTGATTGATATAATTTTGTTTTATCATAATTATTTTTCGGCTTTTCAAATGTCGTAAATATTAGTTATTGTCTCTGTTTACTCGTTTATTCATTTGTTTGAAGATTTTTGTACATATAGATTTGCTTCACTCTGTATATATGTATGCATTA TTCTTCAACCTTTGTTAAATAAAATAGAGT]
[+] EMBL SM3631               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTCTATTTTCATAAAACACTGTTGATTTATTTTGTTTCATTTTCTTGGATCAATCTATGATGATCATATTTAAATAGTCTGGTTACTGTATGTT                                                                                                                                                                                                                          ]




>consensus_5216#0
TGGAAGATTATTAGCTGGTCTCTCTGATCGTTTATGTGTTTGGCCGTTTGAATCTATCCA
ACAATTTGATCTACCAAACGATGATTCTAATGATTCTTCAGATAATACAAGCAGTCCTGC
TACTTTTATAAGACATGTTAGTGTTCAAGATAAAGTGCCCGCTTTAAATACACCGAAGTT
CGAAATACAACAATGTCGTGTATTAAGAGTTCTTTCTTCTGGTGCATGCAATTTAACTGG
GACATCACCACCTTTAATGGTTAGTTCAAGTCGTTTATTGGAGATTAATTCTAATGATAA
AAATTATGGTCCATTTTCATCAATTGATCTTCCGCCTACTATTGTAACAGTCGATTCTAA
TACAGGCACATTATACATATTTGATCCAATTGGTTCTTTGTTTTAGTCTATTTTCATAAA
ACACTGTTGATTTATTTTGTTTCATTTTCTTGGATCAATCTATGATGATCATATTTAAAT
AGTCTGGTTACTGTATGTTTTAAGTATTATTTTGTTTATGTGTGTATACAAAATTGTGAT
TGATATAATTTTGTTTTATCATAATTATTTTTCGGCTTTTCAATGTCGTAAATATTAGNT
ATTGGCTCTGNTTACTCGTTTATTCATTTGNTTGAAGATTTTTGTACATATAGATTTGCT
TCACTCTGTATATATGTATGCATTATTTCTTCACCTTTGNTAAATAAATAGAGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case