cluster # 5218

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5218 cluster # 5218 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5218#0 length = 794 sequences # 3

consensusID : consensus_5218#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 794
fasta sequence

                              [TAAAAGTGTTTAAAAGTTCGAGTTCTATTTGAACAGATTCAAGCTCACTCCAAAGGTTCGTAAACAATAATGCTTGTTTCGCACTGCCGTTGAATACACACATTTGAGGCCATGCCGTTAACGCTAATAGACGGGAAATTGCTCCTGGAGTACTAGGACAGTTGCCTATGGTCAGATACGCTTCATATGGACTTGGAGGAGTAACTAGTTT-ACA-GAATGTTTTGAAGCAAACCAAGCACTTATGGGATCATTATGAGTGAGAGGATCGTAGAGGACATTCAATGTTGACAAGTCGCTTGACCCATGGTTCACCTTTGTCAGCAGTAATTCCAACAGTTTCAAAATGAGGCTGAATCTTGAAAAAACGTACTTAATCCAATTAATTTCATCTTGACTGGCTTTCTGTACATCAATGAACTGTACAAGACCAGTGAATTTTTTGAACAAAGCGACGGCAAGGTCACACTTTTGAACAGATAAGTACATACTAGAAAACAGTTTGGATTCTATGGGGATGTTTTTAAAAAACTGAACCATGATACTTTTATCTTCCGATCTTGATGTCTGCCTGCTATGTAAGAGCGAGAGCCACAAGCGTAAAACACTTTTATTAAATTTTTCGACTAAAACAGCCTGCTGGTGGGTCTGATAGTGGTAGCAGTTACATATAGAAGCTGGATAGCATAATAATTTTCTGTTACAATTAGGTTTATATAATAACCTACATATCTTCAAAAAAATTCAATTGTGTGTGGTTTTCCTGTTTGATACTGGTTTTGTTGACCTTCTTTAAG]

[-] EMBL CD117350             [TAAAAGTGTTTAAAAGTTCGAGTTCTATTTGAACAGATTCAAGCTCACTCCAAAGGTTCGTAAACAATAATGCTTGTTTCGCACTGCCGTTGAATACACACATTTGAGGCCATGCCGTTAACGCTAATAGACGGGAAATTGCTCCTGGAGTACTAGGACAGTTGCCTATGGTCAGATACGCTTCATATGGACTTGGAGGAGTAACTAGTTTAACA GAATGTTTTGAAGCAAACCAAGCACTTATGGGATCATTATGAGTGAGAGGATCGTAGAGGACATTCAATGTTGACAAGTCGCTTGACCCATGGTTCACCTTTGTCAGCAGTAATTCCAACAGTTTCAAAATGAGGCTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD077704             [                                                                                                                                                                                                       AGTAACTAGTTT ACANGAATGTTNTGAAGCAAACCAAGCACTTATGGGATCATTATGAGTGAGAGGATCGTAGAGGACATTCAATGTTGACAAGTCGCTTGACCCATGGTTCACCTTTGTCAGCAGTAATTCCAACAGTTTCAAAATGAGGCTGAATCTTGAAAAAACGTACTTAATCCAATTAATTTCATCTTGACTGGCTTTCTGTACATCAATGAACTGTACAAGACCAGTGAATTTTTTGAACAAAGCGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD146740             [                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTGACAAGTCGCTTGACCCATGGTTCACCTTTGTCAGCAGTAATTCCGACAGTTTCAAAATGAGGCTGAATCTTGAAAAAACGTACTTAATCCAATTAATTTCATCTTGACTGGCTTTCTGTACATCAATGAACTGTACAAGACCAGTGAATTTTTTGAACAAAGCGACGGCAAGGTCACACTTTTGAACAGATAAGTACATACTAGAAAACAGTTTGGATTCTATGGGGATGTTTTTAAAAAACTGAACCATGATACTTTTATCTTCCGATCTTGATGTCTGCCTGCTATGTAAGAGCGAGAGCCACAAGCGTAAAACACTTTTATTAAATTTTTCGACTAAAACAGCCTGCTGGTGGGTCTGATAGTGGTAGCAGTTACATATAGAAGCTGGATAGCATAATAATTTTCTGTTACAATTAGGTTTATATAATAACCTACATATCTTCAAAAAAATTCAATTGTGTGTGGTTTTCCTGTTTGATACTGGTTTTGTTGACCTTCTTTAAG]




>consensus_5218#0
TAAAAGTGTTTAAAAGTTCGAGTTCTATTTGAACAGATTCAAGCTCACTCCAAAGGTTCG
TAAACAATAATGCTTGTTTCGCACTGCCGTTGAATACACACATTTGAGGCCATGCCGTTA
ACGCTAATAGACGGGAAATTGCTCCTGGAGTACTAGGACAGTTGCCTATGGTCAGATACG
CTTCATATGGACTTGGAGGAGTAACTAGTTTACAGAATGTTTTGAAGCAAACCAAGCACT
TATGGGATCATTATGAGTGAGAGGATCGTAGAGGACATTCAATGTTGACAAGTCGCTTGA
CCCATGGTTCACCTTTGTCAGCAGTAATTCCAACAGTTTCAAAATGAGGCTGAATCTTGA
AAAAACGTACTTAATCCAATTAATTTCATCTTGACTGGCTTTCTGTACATCAATGAACTG
TACAAGACCAGTGAATTTTTTGAACAAAGCGACGGCAAGGTCACACTTTTGAACAGATAA
GTACATACTAGAAAACAGTTTGGATTCTATGGGGATGTTTTTAAAAAACTGAACCATGAT
ACTTTTATCTTCCGATCTTGATGTCTGCCTGCTATGTAAGAGCGAGAGCCACAAGCGTAA
AACACTTTTATTAAATTTTTCGACTAAAACAGCCTGCTGGTGGGTCTGATAGTGGTAGCA
GTTACATATAGAAGCTGGATAGCATAATAATTTTCTGTTACAATTAGGTTTATATAATAA
CCTACATATCTTCAAAAAAATTCAATTGTGTGTGGTTTTCCTGTTTGATACTGGTTTTGT
TGACCTTCTTTAAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case