cluster # 5240

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5240 cluster # 5240 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5240#0 length = 747 sequences # 3

consensusID : consensus_5240#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 747
fasta sequence

                              [AGACGAAGTGATAGAACAGGAGCACGATGTTGTAAAATAAGTTCTCGGGAATAATACAGTTGAAGTTTAG-GTAGAACGCTAGAGTTTAATGTTGTTTTGTCAACAAAAATAGAATATAATTTAACAGTCCCAGCTTTAGTACCAATAAAAAGTGTAGCAACTGGATGCAATGTTGGACGAGCATTCGATGGACTTGATTTAAACAGGGGTGGACCAAATGCAAAACAAGATATAATAGCTACATTGGCAGTATCTTGAACACGATCGCATATTTCTCTTTCAACATTATACTGTGATATTAATAATATATTTTCATCTGGGACACGTCCACTACGTCTTTCTGCTTCATCAAGAGGGGCCACATCAGTTTGATTGGGAGCAGCACGATTAGATTGAGTAACAGTACGTCGAATACCAGCACGACTAACATTAGCAGTAGAAGCTGAGACAACTGGTTGAAAATTTGATTTAGTTGATCGTACTCTTTTAAGACGCCTAAATGAATCACGAAGACTTTTTTTAAGTTCTCGAGTACGTCGCCTTGCCCAGCCTTCACCGGCAGCAGCTTCTTGAAGAGCATCGATATTATCCGGTATTGTTGACACAGCAAGTAATGGCTGAGGTGGTAATGGTTTTTTTGTATTTGAATCATTATTAGGTAATGGTTTCGGTACAAAAACTACACCGAAACCATGTGGTGTACCAAGAGCAAGTAAAATTTGTAAACCACCACCATCGCCACTAATG]

[+] EMBL CD137917             [AGACGAAGTGATAGAACAGGAGCACGATGTTGTAAAATAAGTTCTCGGGAATAATACAGTTGAAGTTTAG GTAGAACGCTAGAGTTTAATGTTGTTTTGTCAACAAAAATAGAATATAATTTAACAGTCCCAGCTTTAGTACCAATAAAAAGTGTAGCAACTGGATGCAATGTTGGACGAGCATTCGATGGACTTGATTTAAACAGGGGTGGACCAAATGCAAAACAAGATATAATAGCTACATTGGCAGTATCTTGAACACGATCGCATATTTCTCTTTCAACATTATACTGTGATATTAATAATATATTTTCATCTGGGACACGTCCACTACGTCTTTCTGCTTCATCAAGAGGGGCCACATCAGTTTGATTGGGAGCAGCACGATTAGATTGAGTAACAGTACGTCGAATACCAGCACGACTAACATTAGCAGTAGAAGCTGAGACAACTGGTTGAAAATTTGATTTAGTTGATCGTACTCTTTTAAGACGCCTAAATGAATCACGAAGACTTTTTTTA                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD177781             [                                                               AGTTTAGAGTAGAACGCTAGAGTTTAATGTTGTTTTGTCAACAAAAATAGAATATAATTTAACAGTCCCAGCTTTAGTACCAATAAAAAGTGTAGCAACTGGATGCAATGTTGGACGAGCATTCGAT GACTTGATTTAAACAGGGGTGGACCAAATGCAAAACAAGATATAATAGCTACATTGGCAGTATCTTGAACACGATCGCATATTTCTCTTTCAACATTATACTGTGATATTAATAATATATTTTCATCTGGGACACGTCCACTACGTCTTTCTGCTTCATCAAGAGGGGCCACATCAGTTTGATTGGGAGCAGCACGATTAGATTGAGTAACAGTACGTCGAATACCAGCACGACTAACATTAGCAGTAGAAGCTGAGACAACTGGTTGAAAATTTGATTTAGTTGATCGTACTCTTTTAAGACGCCTAAATGAATCACGAAGACTTTTTTTAAGTTCTCGAGTACGT                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD089956             [                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTCTCTTTCAACATTATACTGTGATATTAATAATATATTTTCATCTGGGACACGTCCACTACGTCTTTCTGCTTCATCAAGAGGGGCCACATCAGTTTGATTGGGAGCAGCACGATTAGATTGAGTAACAGTACGTCGAATACCAGCACGACTAACATTAGCAGTAGAAGCTGAGACAACTGGTTGAAAATTTGATTTAGTTGATCGTACTCTTTTAAGACGCCTAAATGAATCACGAAGACTTTTTTTAAGTTCTCGAGTACGTCGCCTTGCCCAGCCTTCACCGGCAGCAGCTTCTTGAAGAGCATCGATATTATCCGGTATTGTTGACACAGCAAGTAATGGCTGAGGTGGTAATGGTTTTTTTGTATTTGAATCATTATTAGGTAATGGTTTCGGTACAAAAACTACACCGAAACCATGTGGTGTACCAAGAGCAAGTAAAATTTGTAAACCACCACCATCGCCACTAATG]




>consensus_5240#0
AGACGAAGTGATAGAACAGGAGCACGATGTTGTAAAATAAGTTCTCGGGAATAATACAGT
TGAAGTTTAGGTAGAACGCTAGAGTTTAATGTTGTTTTGTCAACAAAAATAGAATATAAT
TTAACAGTCCCAGCTTTAGTACCAATAAAAAGTGTAGCAACTGGATGCAATGTTGGACGA
GCATTCGATGGACTTGATTTAAACAGGGGTGGACCAAATGCAAAACAAGATATAATAGCT
ACATTGGCAGTATCTTGAACACGATCGCATATTTCTCTTTCAACATTATACTGTGATATT
AATAATATATTTTCATCTGGGACACGTCCACTACGTCTTTCTGCTTCATCAAGAGGGGCC
ACATCAGTTTGATTGGGAGCAGCACGATTAGATTGAGTAACAGTACGTCGAATACCAGCA
CGACTAACATTAGCAGTAGAAGCTGAGACAACTGGTTGAAAATTTGATTTAGTTGATCGT
ACTCTTTTAAGACGCCTAAATGAATCACGAAGACTTTTTTTAAGTTCTCGAGTACGTCGC
CTTGCCCAGCCTTCACCGGCAGCAGCTTCTTGAAGAGCATCGATATTATCCGGTATTGTT
GACACAGCAAGTAATGGCTGAGGTGGTAATGGTTTTTTTGTATTTGAATCATTATTAGGT
AATGGTTTCGGTACAAAAACTACACCGAAACCATGTGGTGTACCAAGAGCAAGTAAAATT
TGTAAACCACCACCATCGCCACTAATG

clustalw multiple alignements is not computed in this case