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Schistosoma mansoni
cluster # 5240 cluster # 5240       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5240#0 length = 747 sequences # 3  

consensusID : consensus_5240#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 747
fasta sequence
                              [AGACGAAGTGATAGAACAGGAGCACGATGTTGTAAAATAAGTTCTCGGGAATAATACAGTTGAAGTTTAG-GTAGAACGCTAGAGTTTAATGTTGTTTTGTCAACAAAAATAGAATATAATTTAACAGTCCCAGCTTTAGTACCAATAAAAAGTGTAGCAACTGGATGCAATGTTGGACGAGCATTCGATGGACTTGATTTAAACAGGGGTGGACCAAATGCAAAACAAGATATAATAGCTACATTGGCAGTATCTTGAACACGATCGCATATTTCTCTTTCAACATTATACTGTGATATTAATAATATATTTTCATCTGGGACACGTCCACTACGTCTTTCTGCTTCATCAAGAGGGGCCACATCAGTTTGATTGGGAGCAGCACGATTAGATTGAGTAACAGTACGTCGAATACCAGCACGACTAACATTAGCAGTAGAAGCTGAGACAACTGGTTGAAAATTTGATTTAGTTGATCGTACTCTTTTAAGACGCCTAAATGAATCACGAAGACTTTTTTTAAGTTCTCGAGTACGTCGCCTTGCCCAGCCTTCACCGGCAGCAGCTTCTTGAAGAGCATCGATATTATCCGGTATTGTTGACACAGCAAGTAATGGCTGAGGTGGTAATGGTTTTTTTGTATTTGAATCATTATTAGGTAATGGTTTCGGTACAAAAACTACACCGAAACCATGTGGTGTACCAAGAGCAAGTAAAATTTGTAAACCACCACCATCGCCACTAATG]

[+] EMBL CD137917             [AGACGAAGTGATAGAACAGGAGCACGATGTTGTAAAATAAGTTCTCGGGAATAATACAGTTGAAGTTTAG GTAGAACGCTAGAGTTTAATGTTGTTTTGTCAACAAAAATAGAATATAATTTAACAGTCCCAGCTTTAGTACCAATAAAAAGTGTAGCAACTGGATGCAATGTTGGACGAGCATTCGATGGACTTGATTTAAACAGGGGTGGACCAAATGCAAAACAAGATATAATAGCTACATTGGCAGTATCTTGAACACGATCGCATATTTCTCTTTCAACATTATACTGTGATATTAATAATATATTTTCATCTGGGACACGTCCACTACGTCTTTCTGCTTCATCAAGAGGGGCCACATCAGTTTGATTGGGAGCAGCACGATTAGATTGAGTAACAGTACGTCGAATACCAGCACGACTAACATTAGCAGTAGAAGCTGAGACAACTGGTTGAAAATTTGATTTAGTTGATCGTACTCTTTTAAGACGCCTAAATGAATCACGAAGACTTTTTTTA                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD177781             [                                                               AGTTTAGAGTAGAACGCTAGAGTTTAATGTTGTTTTGTCAACAAAAATAGAATATAATTTAACAGTCCCAGCTTTAGTACCAATAAAAAGTGTAGCAACTGGATGCAATGTTGGACGAGCATTCGAT GACTTGATTTAAACAGGGGTGGACCAAATGCAAAACAAGATATAATAGCTACATTGGCAGTATCTTGAACACGATCGCATATTTCTCTTTCAACATTATACTGTGATATTAATAATATATTTTCATCTGGGACACGTCCACTACGTCTTTCTGCTTCATCAAGAGGGGCCACATCAGTTTGATTGGGAGCAGCACGATTAGATTGAGTAACAGTACGTCGAATACCAGCACGACTAACATTAGCAGTAGAAGCTGAGACAACTGGTTGAAAATTTGATTTAGTTGATCGTACTCTTTTAAGACGCCTAAATGAATCACGAAGACTTTTTTTAAGTTCTCGAGTACGT                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD089956             [                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTCTCTTTCAACATTATACTGTGATATTAATAATATATTTTCATCTGGGACACGTCCACTACGTCTTTCTGCTTCATCAAGAGGGGCCACATCAGTTTGATTGGGAGCAGCACGATTAGATTGAGTAACAGTACGTCGAATACCAGCACGACTAACATTAGCAGTAGAAGCTGAGACAACTGGTTGAAAATTTGATTTAGTTGATCGTACTCTTTTAAGACGCCTAAATGAATCACGAAGACTTTTTTTAAGTTCTCGAGTACGTCGCCTTGCCCAGCCTTCACCGGCAGCAGCTTCTTGAAGAGCATCGATATTATCCGGTATTGTTGACACAGCAAGTAATGGCTGAGGTGGTAATGGTTTTTTTGTATTTGAATCATTATTAGGTAATGGTTTCGGTACAAAAACTACACCGAAACCATGTGGTGTACCAAGAGCAAGTAAAATTTGTAAACCACCACCATCGCCACTAATG]


>consensus_5240#0 AGACGAAGTGATAGAACAGGAGCACGATGTTGTAAAATAAGTTCTCGGGAATAATACAGT TGAAGTTTAGGTAGAACGCTAGAGTTTAATGTTGTTTTGTCAACAAAAATAGAATATAAT TTAACAGTCCCAGCTTTAGTACCAATAAAAAGTGTAGCAACTGGATGCAATGTTGGACGA GCATTCGATGGACTTGATTTAAACAGGGGTGGACCAAATGCAAAACAAGATATAATAGCT ACATTGGCAGTATCTTGAACACGATCGCATATTTCTCTTTCAACATTATACTGTGATATT AATAATATATTTTCATCTGGGACACGTCCACTACGTCTTTCTGCTTCATCAAGAGGGGCC ACATCAGTTTGATTGGGAGCAGCACGATTAGATTGAGTAACAGTACGTCGAATACCAGCA CGACTAACATTAGCAGTAGAAGCTGAGACAACTGGTTGAAAATTTGATTTAGTTGATCGT ACTCTTTTAAGACGCCTAAATGAATCACGAAGACTTTTTTTAAGTTCTCGAGTACGTCGC CTTGCCCAGCCTTCACCGGCAGCAGCTTCTTGAAGAGCATCGATATTATCCGGTATTGTT GACACAGCAAGTAATGGCTGAGGTGGTAATGGTTTTTTTGTATTTGAATCATTATTAGGT AATGGTTTCGGTACAAAAACTACACCGAAACCATGTGGTGTACCAAGAGCAAGTAAAATT TGTAAACCACCACCATCGCCACTAATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)