cluster # 5245

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Schistosoma mansoni
cluster # 5245 cluster # 5245 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5245#0 length = 835 sequences # 3

consensusID : consensus_5245#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 835
fasta sequence

                              [ATTATTAAAAAGAAGATCATATTTAATTGAAAAAGCTAAAGATGCACAATATATTGGAATACTTGTTTGTACATTATCGATCAAACATTATCAACATATTATTGATCGTTTAAAATCATTATTACACTATGCAAAACGTTCATGTATCACATTAATTGTTGGTCGATTAAATCCAGAAAAATTAGCTAATTTACCTGAATTACAATTATTAATATTAATAGCATGTCCTGAGACAAGTTTATTAGATTCAAATGATTTTCATATACCAGTAATAACACCATTTGAAATGGAATGTGCTATACGTTCATGTTATATGAATGAATACTTATCAATTGATGAACGTACATGGACAGCAGAGAAACTTTGGGTAGATTTTCATGATTTATTACCAGGTGGTCGAGCTTATATACCTCTGGAGAATGTTATTCCACAAGTAACTGAATCATTCGCTATTGTTTCATTAATTAATGGACATAGCCATTTGATTCCAGAAAATAAGCCTCATTCTGATTCAGATCATGGCAAAGATAATTCTCAATCTTTAATAGTTCGATCATCAGGTGAATTAATTGATTTCAGCCAATGGAATTTAAACTCTCGTCGAACATGGTATGGTTTAGATCCGAAAATTGGTCAAACACCTATAGCACAAATAAAAGATGGTCGTACTGGTTTACCAATACAGTATACAGATGAAAAGAACGTACTATCATCCGATTAATGATTATTATTATACGCTTT-GATCCTCTGATCCGTGGACAG-TTTGACTTTGTACATAAATTTTCGTGATATTGGAATGTTTGCCATGTTGAGATGATTTACTAAAATATTTATT]

[+] EMBL CD078658             [ATTATTAAAAAGAAGATCATATTTAATTGAAAAAGCTAAAGATGCACAATATATTGGAATACTTGTTTGTACATTATCGATCAAACATTATCAACATATTATTGATCGTTTAAAATCATTATTACACTATGCAAAACGTTCATGTATCACATTAATTGTTGGTCGATTAAATCCAGAAAAATTAGCTAATTTACCTGAATTACAATTATTAATATTAATAGCATGTCCTGAGACAAGTTTATTAGATTCAAATGATTTTCATATACCAGTAATAACACCATTTGAAATGGAATGTGCTATACGTTCATGTTATATGAATGAATACTTATCAATTGATGAACGTACATGGACAGCAGAGAAACTTTGGGTAGATTTTCATGATTTATTACCAGGTGGTCGAGCTTATATACCTCTGGAGAATGTTATTCCACAAGTAACTGAATCATTCGCTATTGTTTCATTAATTAATGGACATAGCCATTTGATTCCAGAAAATAAGCCTCATTCTGATTCAGATCATGGCANAGATAATTCTCAATCTTTAATAGTTCGATCATCAGGTGAATTAATTGATTTCAGCCAATGGAATTTAA                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD073121             [                                                                                                                                                                                                                                                   AGATTCAAATGATTTTCATATACCAGTAATAACACCATTTGAAATGGAATGTGCTATACGTTCATGTTATATGAATGAATACTTATCAATTGATGAACGTACATGGACAGCAGAGAAACTTTGGGTAGATTTTCATGATTTATTACCAGGTGGTCGAGCTTATATACCTCTGGAGAATGTTATTCCACAAGTAACTGAATCATTCGCTATTGTTTCATTAATTAATGGACATAGCCATTTGATTCCAGAAAATAAGCCTCATTCTGATTCAGATCATGGCAAAGATAATTCTCAATCTTTAATAGTTCGATCATCAGGTGAATTAATTGATTTCAGCCAATGGAATTTAAACTCTCGTCGAACATGGTATGGTTTAGATCCGAAAATTGGTCAAACACCTATAGCACAAATAAAAGATGGTCGTACTGGTTTACCAATACAGTATACAGATGAAAAGAACGTACTATCATCCGATTAATGATTATTATTATACGCTTT GATCCTCTGATCCGTGGACAG TTTGACTTTGTACATAAATTTTCGTGATATTGGAATGTTTGCCATGTTGAGATGATTTACTAAAATATTTATT]
[+] EMBL SM694                [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATGGACATAGGCATTTGATTCNAGAAAATAAGCCTCATTCTGATTCAGATCATGGNAAAGATAATTCTCAATCTTTANTAGTTCGATCATCAGGTGAATTAATTGATTTCAGCCAATGGAATTTAANCTCTCGTCGAACATGGTATGGTTTAGATCCGAAAATTGGTCAAACACCTATAGCACAAATAAAAGATGGTCGTACTGGTTTACCAATACAGTATACAGATGAAAAGAACGTACTATCATCCGANTAATGATTATTATTATACGCTTTGGATCCTCTGATCCGTGGACAGNTTGGACTTNGTACATAAATTTTCGTGATATTGGNATGTTTGCCATGTTGAGATGATTTACTA           ]




>consensus_5245#0
ATTATTAAAAAGAAGATCATATTTAATTGAAAAAGCTAAAGATGCACAATATATTGGAAT
ACTTGTTTGTACATTATCGATCAAACATTATCAACATATTATTGATCGTTTAAAATCATT
ATTACACTATGCAAAACGTTCATGTATCACATTAATTGTTGGTCGATTAAATCCAGAAAA
ATTAGCTAATTTACCTGAATTACAATTATTAATATTAATAGCATGTCCTGAGACAAGTTT
ATTAGATTCAAATGATTTTCATATACCAGTAATAACACCATTTGAAATGGAATGTGCTAT
ACGTTCATGTTATATGAATGAATACTTATCAATTGATGAACGTACATGGACAGCAGAGAA
ACTTTGGGTAGATTTTCATGATTTATTACCAGGTGGTCGAGCTTATATACCTCTGGAGAA
TGTTATTCCACAAGTAACTGAATCATTCGCTATTGTTTCATTAATTAATGGACATAGCCA
TTTGATTCCAGAAAATAAGCCTCATTCTGATTCAGATCATGGCAAAGATAATTCTCAATC
TTTAATAGTTCGATCATCAGGTGAATTAATTGATTTCAGCCAATGGAATTTAAACTCTCG
TCGAACATGGTATGGTTTAGATCCGAAAATTGGTCAAACACCTATAGCACAAATAAAAGA
TGGTCGTACTGGTTTACCAATACAGTATACAGATGAAAAGAACGTACTATCATCCGATTA
ATGATTATTATTATACGCTTTGATCCTCTGATCCGTGGACAGTTTGACTTTGTACATAAA
TTTTCGTGATATTGGAATGTTTGCCATGTTGAGATGATTTACTAAAATATTTATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case