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Schistosoma mansoni
cluster # 5259 cluster # 5259       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5259#0 length = 1042 sequences # 3  
consensusID : consensus_5259#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1042
fasta sequence 
                              [ACTGATACTGTTACAAGACGTGATCACTGTAATTGTACATGTCATCATAAACCATCTTCCATTCTCGATAATCACCAGCAATCTCATCACTCTAAAGATACTCAAAGTCCTGTAAATCCATCAGTCGGTTTTCTTGATAAAATCCACAATCGATCACTACATGGTTCAGGTCAAGAATGGTGTGCTGATCGACGATCTTCTGTACCATATACAACAAAAGCGAATATGAGAGGAGATTTAAATGTTCCAGAGAATAAAAGAAAATCTATTCCGGAAGTTAACTCAAACCGATCGAAACAATTAACTGTTCCCAATGCTTACATACAGAACAATAATGATTTAAACAGTTCACTACAGTTAATCGACAATAGTTTTGATGGAATCAATGAATCGAATGTTGGCGATATTTCTCTTCAATTGAATAATAATAATAATCTTAAGAATAAACTGGACAAATTGGTCACTCAGGAAGAAGATGATACTGTTTTCCCAATGGATTAGAAGAATTTGGTTGGTTCTATTCTTTGTTGGTTTATTTGAAAGGAGACATCGATAACAACGCATGTGGTAGCCACGATTGAATATAATATTGATACTAGTTGTTTGTATTAATTGAGCGTTGNTGCACTTTCTTTGTATTCAATAAATTAAAAGTGCTAACAAAGTTTTTATATCTTTGTAGTACCTATTTGCCTTGAAATATCTCATCAGCTTTTGCTTTCTTTCATAATATATGTACATGACTGAAGAAAATAGAATAAACAAACTTCTGAATGATGATATATACATTCATATATATTTTCCGGTCGTGAAGAAAACACATATTACATACATCAGTCTATGCATACTCAACATATTCTTTTACTATTGTTGTTTCTTTAGTTAACAGAAACATGAATAGATGTTCATCACTGGCATATAATCACCCGTTTTTGTGGTTAAACGTAACTCTGTCGAATACTTTAGTGTTTTTTTATATGTGTATTTCATTTATTTTCATTTCTTTTATAAAAATCATGATTTTTAATAAAATTTAATTGGT]

[+] EMBL CD078681             [ACTGATACTGTTACAAGACGTGATCACTGTAATTGTACATGTCATCATAAACCATCTTCCATTCTCGATAATCACCAGCAATCTCATCACTCTAAAGATACTCAAAGTCCTGTAAATCCATCAGTCGGTTTTCTTGATAAAATCCACAATCGATCACTACATGGTTCAGGTCAAGAATGGTGTGCTGATCGACGATCTTCTGTACCATATACAACAAAAGCGAATATGAGAGGAGATTTAAATGTTCCAGAGAATAAAAGAAAATCTATTCCGGAAGTTAACTCAAACCGATCGAAACAATTAACTGTTCCCAATGCTTACATACAGAACAATAATGATTTAAACAGTTCACTACAGTTAATCGACAATAGTTTTGATGGAATCAATGAATCGAATGTTGGCGATATTTCTCTTCAATTGAATAATAATAATAATCTTAAGAATAAACTGGACAAATTGGTCACTCAGGAAGAAGATGATACTGTTTTCCCAATGGATTAGAAGAATTTGGTTGGTTCTATTCTTTGTTGGTTTATTTGAAAGGAGACATCGATAACAACGCATGTGGTAGCCACGATTGAATATAATATTGATACTAGTTGTTTGTATTAATTGAGCGTTGNTGCACTTTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD188872             [                                                                                                                                                                     TCAGGTCAAGAATGGTGTGCTGATCGACGATCTTCTGTACCATATACAACAAAAGCGAATATGAGAGGAGATTTAAATGTTCCAGAGAATAAAAGAAAATCTATTCCGGAAGTTAACTCAAACCGATCGAAACAATTAACTGTTCCCAATGCTTACATACAGAACAATAATGATTTAAACAGTTCACTACAGTTAATCGACAATAGTTTTGATGGAATCAATGAATCGAATGTTGGCGATATTTCTCTTCAATTGAATAATAATAATAATCTTAAGAATAAACTGGACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD073144             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAAATTGGTCACTCAGGAAGAAGATGATACTGTTTTCCCAATGGATTAGAAGAATTTGGTTGGTTCTATTCTTTGTTGGTTTATTTGAAAGGAGACATCGATAACAACGCATGTGGTAGCCACGATTGAATATAATATTGATACTAGTTGTTTGTATTAATTGAGCGTTGTTGCACTTTCTTTGTATTCAATAAATTAAAAGTGCTAACAAAGTTTTTATATCTTTGTAGTACCTATTTGCCTTGAAATATCTCATCAGCTTTTGCTTTCTTTCATAATATATGTACATGACTGAAGAAAATAGAATAAACAAACTTCTGAATGATGATATATACATTCATATATATTTTCCGGTCGTGAAGAAAACACATATTACATACATCAGTCTATGCATACTCAACATATTCTTTTACTATTGTTGTTTCTTTAGTTAACAGAAACATGAATAGATGTTCATCACTGGCATATAATCACCCGTTTTTGTGGTTAAACGTAACTCTGTCGAATACTTTAGTGTTTTTTTATATGTGTATTTCATTTATTTTCATTTCTTTTATAAAAATCATGATTTTTAATAAAATTTAATTGGT]




>consensus_5259#0
ACTGATACTGTTACAAGACGTGATCACTGTAATTGTACATGTCATCATAAACCATCTTCC
ATTCTCGATAATCACCAGCAATCTCATCACTCTAAAGATACTCAAAGTCCTGTAAATCCA
TCAGTCGGTTTTCTTGATAAAATCCACAATCGATCACTACATGGTTCAGGTCAAGAATGG
TGTGCTGATCGACGATCTTCTGTACCATATACAACAAAAGCGAATATGAGAGGAGATTTA
AATGTTCCAGAGAATAAAAGAAAATCTATTCCGGAAGTTAACTCAAACCGATCGAAACAA
TTAACTGTTCCCAATGCTTACATACAGAACAATAATGATTTAAACAGTTCACTACAGTTA
ATCGACAATAGTTTTGATGGAATCAATGAATCGAATGTTGGCGATATTTCTCTTCAATTG
AATAATAATAATAATCTTAAGAATAAACTGGACAAATTGGTCACTCAGGAAGAAGATGAT
ACTGTTTTCCCAATGGATTAGAAGAATTTGGTTGGTTCTATTCTTTGTTGGTTTATTTGA
AAGGAGACATCGATAACAACGCATGTGGTAGCCACGATTGAATATAATATTGATACTAGT
TGTTTGTATTAATTGAGCGTTGNTGCACTTTCTTTGTATTCAATAAATTAAAAGTGCTAA
CAAAGTTTTTATATCTTTGTAGTACCTATTTGCCTTGAAATATCTCATCAGCTTTTGCTT
TCTTTCATAATATATGTACATGACTGAAGAAAATAGAATAAACAAACTTCTGAATGATGA
TATATACATTCATATATATTTTCCGGTCGTGAAGAAAACACATATTACATACATCAGTCT
ATGCATACTCAACATATTCTTTTACTATTGTTGTTTCTTTAGTTAACAGAAACATGAATA
GATGTTCATCACTGGCATATAATCACCCGTTTTTGTGGTTAAACGTAACTCTGTCGAATA
CTTTAGTGTTTTTTTATATGTGTATTTCATTTATTTTCATTTCTTTTATAAAAATCATGA
TTTTTAATAAAATTTAATTGGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)