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Schistosoma mansoni
cluster # 5272 cluster # 5272       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5272#0 length = 669 sequences # 3  

consensusID : consensus_5272#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 669
fasta sequence
                              [GTTGTCATAATACATGTCGACTGACTAATTGTAGAAGTGGGATCCGAGAGACTAGTTGAAGGTTTTAATGAATCTGTCGACTGTTGACAAACAACAGAAGTACTACTTATTGACTCATTAGTAGAATTATCAATAAATTCTTCATTAATAGATTGTGCTGGTAATGATAATGATGGTTGAAGCTCAAGTGGAGAAGGAGACGTTGTCATAATACATGTCGACTGACTAATTGTAGAAGTGGGATCCGAGAGACTAGTTGAAGGTTTTAATGAATCTGTCGACTGTTGACAAACAACAGAAGTACTACTTATTGTAGTAACAACAGTTGAGTTAAAAATATCAGTAATGGGAGAGGCAGCAGTAGCAGTATTAGTAGTAGCAACAGAAATAATATTTGTTTGTCTGGCTACTTCCATCGATAAACGTTCTTTTAATTCAGCCAACTGTGTAAAACAATGACCTTGATTCGCTTCAAGTTGTAAAATATGCCAATTTTGATCACGACACTTTTGAAAGTAAGTTGGCGCTCTTACTTGGAATTTAAGTAGTATTGAGTCTGTTTCACTATTTAAATAACCTTCATTAACTAATAAATCCAAACGAAAGAAACGATTATAACCCCAACATTCACCAACTTCAAAATGTGAAGCCGAATTCACGTACAATATT]

[+] EMBL CD114165             [GTTGTCATAATACATGTCGACTGACTAATTGTAGAAGTGGGATCCGAGAGACTAGTTGAAGGTTTTAATGAATCTGTCGACTGTTGACAAACAACAGAAGTACTACTTATTGACTCATTAGTAGAATTATCAATAAATTCTTCATTAATAGATTGTGCTGGTAATGATAATGATGGTTGAAGCTCAAGTGGAGAAGGAGACGTTGTCATAATACATGTCGACTGACTAATTGTAGAAGTGGGATCCGAGAGACTAGTTGAAGGTTTTAATGAATCTGTCGACTGTTGACAAACAACAGAAGTACTACTTATTGTAGTAACAACAGTTGAGTTAAAAATATCAGTAATGGGAGAGGCAGCAGTAGCAGTATTAGTAGTAGCAACAGAAATAATATTTGTTTGTCTGGCTACTTCCATCGATAAACGTTCTTTTAATTCAGCCAACTGTGTAAAACAATGACCTTGATTCGCTTCAAGTTGTAAAATATGCCAATTTTGATCACGACACTTTTGAAAGTAAGTTGGCGCTCTTACTTGGAATTTAAGTAGTATTGAGTCTGTTTCACTATTTAAATAACCTTCATTAACTAATAAATCCAAACGAAAGAAACGATTATAACCCCAACATTCACCAACTTCAAAATGTGAAGCCGAATTCACGTACAATATT]
[+] EMBL CD114246             [GTTGTCATAATACATGTCGACTGACTAATTGTAGAAGTGGGATCCGAGAGACTAGTTGAAGGTTTTAATGAATCTGTCGACTGTTGACAAACAACAGAAGTACTACTTATTGACTCATTAGTAGAATTATCAATAAATTCTTCATTAATAGATTGTGCTGGTAATGATAAAGATGGTTGAAGCTCAAGTGGAGAAGGAGACGTTGTCATAATACATGTCGACTGACTAATTGTAGAAGTGGGATCCGAGAGACTAGTTGAAGGTTTTAATGAATCTGTCGACTGTTGACAAACAACAGAAGTACTACTTATTGTAGTAACAACAGTTGAGTTAAAAATATCAGTAATGGGAGAGGCAGCAGTAGCAGTATTAGTAGTAGCAACAGAAATAATATTTGTTTGTCTGGCTACTTCCATCGATAAACGTTCTTTTAATTCAGCCAACTGTGTAAAACAATGACCTTGATTCGCTTCAAGTTGTAAAATATGCCAATTTTGATCACGACACTTTTGAAAGTAAGTTGGCGCTCTTACTTGGAATTTAAGTAGTATTGAGTCTGTTTCACTATTTAAATAACCTTCATTAACTAATAAATCCAAACGAAAGATACGATTATTACCCCCACATTCACCAACTT AAAATGTGAAG CGAA TCACGTAC ATATT]
[+] EMBL CD178128             [                                                                                                                                                                                                              CATAATACACGTCGACTGACTAATTGTAGAAGTGGGATCCGAGAGACTAGTTGAAGGTCTTAATGAATCTGTCGACTGTTGACAAACAACAGAAGTACTACTTATTGTAGTAACAACAGTTGAGTTAAAAATATCAGTAATGGGAGAGGCAGCAGTAGCAGTATTAGTAGTAGCAACAGAAATAATATTTGTTTGTCTGGCTACTTCCATCGATAAACGTTCTTTTAATTCAGCCAACTGTGTAAAACAATGACCTTGATTCGCTTCAAGTTGTAAAATATGCCAATTTTGATCACGACACTTTTGAAAGTAAGTTGGCGCTCTTACTTGGAATTTAAGTAGTATTGAGTCTGTTTCACTATTTAAATAACC                                                                                           ]


>consensus_5272#0 GTTGTCATAATACATGTCGACTGACTAATTGTAGAAGTGGGATCCGAGAGACTAGTTGAA GGTTTTAATGAATCTGTCGACTGTTGACAAACAACAGAAGTACTACTTATTGACTCATTA GTAGAATTATCAATAAATTCTTCATTAATAGATTGTGCTGGTAATGATAATGATGGTTGA AGCTCAAGTGGAGAAGGAGACGTTGTCATAATACATGTCGACTGACTAATTGTAGAAGTG GGATCCGAGAGACTAGTTGAAGGTTTTAATGAATCTGTCGACTGTTGACAAACAACAGAA GTACTACTTATTGTAGTAACAACAGTTGAGTTAAAAATATCAGTAATGGGAGAGGCAGCA GTAGCAGTATTAGTAGTAGCAACAGAAATAATATTTGTTTGTCTGGCTACTTCCATCGAT AAACGTTCTTTTAATTCAGCCAACTGTGTAAAACAATGACCTTGATTCGCTTCAAGTTGT AAAATATGCCAATTTTGATCACGACACTTTTGAAAGTAAGTTGGCGCTCTTACTTGGAAT TTAAGTAGTATTGAGTCTGTTTCACTATTTAAATAACCTTCATTAACTAATAAATCCAAA CGAAAGAAACGATTATAACCCCAACATTCACCAACTTCAAAATGTGAAGCCGAATTCACG TACAATATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)