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Schistosoma mansoni
cluster # 5284 cluster # 5284       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5284#0 length = 678 sequences # 3  

consensusID : consensus_5284#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 678
fasta sequence
                              [GTCTAGTGCTTCATTCAAAAAACATACAAATGACTATATCACCAGATTCTAGTGAAAATGATCCTAACAATAGTTATGATATTAACCAGCAAACATGTTGTTCCGAAACCGCTACGTCGGCTTCAAGTTGTTCTAGTTGTTGCTATTTCTGCTGCTGTAGTAGTTGTTGTGCCTATGGTGGAGGTAGTCTAAGTTGCTGCAGTGGAAGTACAAGCGGGTTCGGATCAAATTCTTCAGATATATCACTTAACAGTAGTGTTAACTATTCCAGGACGAAATCTAATACATACCACAATAAAAAGCAACACAATTGTTCAAATTGTACATGTCATGATAATAAAACAGATGAAATAAGTAAATGTTCAATGGATTACAATTGTTCCACTCACCGATCCTATTATCATCACCAATCTCGACGTGCTAATGAATTCAGGTACCCTCAACTACCACAAACTGGCCAGGTCAATATAAATAGTAATGAAGGTGAAAAGGGTGCATCTATATTTACAAATGGTAATTCTGGAAATTTTCAGCACTCTAATAATACTCAACAAACGTCTTATGTTACATCGGGACAAAATAATTCGATTGTAAATATAAACGAATCAGCTTCACCTATTGCAAATACCAACGTAACCACGACATCATTAACAACAACAACAACTATTCCTACCCGAC]

[+] EMBL CD114159             [GTCTAGTGCTTCATTCAAAAAACATACAAATGACTATATCACCAGATTCTAGTGAAAATGATCCTAACAATAGTTATGATATTAACCAGCAAACATGTTGTTCCGAAACCGCTACGTCGGCTTCAAGTTGTTCTAGTTGTTGCTATTTCTGCTGCTGTAGTAGTTGTTGTGCCTATGGTGGAGGTAGTCTAAGTTGCTGCAGTGGAAGTACAAGCGGGTTCGGATCAAATTCTTCAGATATATCACTTAACAGTAGTGTTAACTATTCCAGGACGAAATCTAATACATACCACAATAAAAAGCAACACAATTGTTCAAATTGTACATGTCATGATAATAAAACAGATGAAATAAGTAAATGTTCAATGGATTACAATTGTTCCACTCACCGATCCTATTATCATCACCAATCTCGACGTGCTAATGAATTCAGGTACCCTCAACTACCACAAACTGGCCAGGTCAATATAAATAGTAATGAAGGTGAAAAGGGTGCATCTATATTTACAAATGGTAATTCTGGAAATTTTCAGCACTCTAATAATACTCAACAAACGTCTTATGTTACATCGGGACAAAATAATTCGATTGTAAATATAAACGAATCAGCTTCAC                                                               ]
[+] EMBL CD114127             [GTCTAGTGCTTCATTCAAAAAACATACAAATGACTATATCACCAGATTCTAGTGAAAATGATCCTAACAATAGTTATGATATTAACCAGCAAACATGTTGTTCCGAAACCGCTACGTCGGCTTCAAGTTGTTCTAGTTGTTGCTATTTCTGCTGCTGTAGTAGTTGTTGTGCCTATGGTGGAGGTAGTCTAAGTTGCTGCAGTGGAAGTACAAGCGGGTTCGGATCAAATTCTTCAGATATATCACTTAACAGTAGTGTTAACTATTCCAGGACGAAATCTAATACATACCACAATAAAAAGCAACACAATTGTTCAAATTGTACATGTCATGATAATAAAACAGATGAAATAAGTAAATGTTCAATGGATTACAATTGTTCCACTCACCGATCCTATTATCATCACCAATCTCGACGTGCTAATGAATTCAGGTACCCTCAACTACCACAAACTGGCCAGGTCAATATAAATAGTAATGAAGGTGAAAAGGGTGCATCTATATTTACAAATGGTAATTCTGGAAATTTTCAGCACTCTAATTATACTCAACANACGTCTTATGTTACATCGGGACCAAATAATTCGATTGTAAATATAAACGAATCAGCTCCAC                                                               ]
[-] EMBL CD135315             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTACATGTCATGATAATAAAACAGATGAAATAAGTAAATGTTCAATGGATTACAATTGTTCCACTCACCGATCCTATTATCATCACCAATCTCGACGTGCTAATGAATTCAGGTACCCTCAACTACCACAAACTGGCCAGGTCAATATAAATAGTAATGAAGGTGAAAAGGGTGCATCTATATTTACAAATGGTAATTCTGGAAATTTTCAGCACTCTAATAATACTCAACAAACGTCTTATGTTACATCGGGACAAAATAATTCGATTGTAAATATAAACGAATCAGCTTCACCTATTGCAAATACCAACGTAACCACGACATCATTAACAACAACAACAACTATTCCTACCCGAC]


>consensus_5284#0 GTCTAGTGCTTCATTCAAAAAACATACAAATGACTATATCACCAGATTCTAGTGAAAATG ATCCTAACAATAGTTATGATATTAACCAGCAAACATGTTGTTCCGAAACCGCTACGTCGG CTTCAAGTTGTTCTAGTTGTTGCTATTTCTGCTGCTGTAGTAGTTGTTGTGCCTATGGTG GAGGTAGTCTAAGTTGCTGCAGTGGAAGTACAAGCGGGTTCGGATCAAATTCTTCAGATA TATCACTTAACAGTAGTGTTAACTATTCCAGGACGAAATCTAATACATACCACAATAAAA AGCAACACAATTGTTCAAATTGTACATGTCATGATAATAAAACAGATGAAATAAGTAAAT GTTCAATGGATTACAATTGTTCCACTCACCGATCCTATTATCATCACCAATCTCGACGTG CTAATGAATTCAGGTACCCTCAACTACCACAAACTGGCCAGGTCAATATAAATAGTAATG AAGGTGAAAAGGGTGCATCTATATTTACAAATGGTAATTCTGGAAATTTTCAGCACTCTA ATAATACTCAACAAACGTCTTATGTTACATCGGGACAAAATAATTCGATTGTAAATATAA ACGAATCAGCTTCACCTATTGCAAATACCAACGTAACCACGACATCATTAACAACAACAA CAACTATTCCTACCCGAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)