cluster # 5284

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Schistosoma mansoni
cluster # 5284 cluster # 5284 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5284#0 length = 678 sequences # 3

consensusID : consensus_5284#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 678
fasta sequence

                              [GTCTAGTGCTTCATTCAAAAAACATACAAATGACTATATCACCAGATTCTAGTGAAAATGATCCTAACAATAGTTATGATATTAACCAGCAAACATGTTGTTCCGAAACCGCTACGTCGGCTTCAAGTTGTTCTAGTTGTTGCTATTTCTGCTGCTGTAGTAGTTGTTGTGCCTATGGTGGAGGTAGTCTAAGTTGCTGCAGTGGAAGTACAAGCGGGTTCGGATCAAATTCTTCAGATATATCACTTAACAGTAGTGTTAACTATTCCAGGACGAAATCTAATACATACCACAATAAAAAGCAACACAATTGTTCAAATTGTACATGTCATGATAATAAAACAGATGAAATAAGTAAATGTTCAATGGATTACAATTGTTCCACTCACCGATCCTATTATCATCACCAATCTCGACGTGCTAATGAATTCAGGTACCCTCAACTACCACAAACTGGCCAGGTCAATATAAATAGTAATGAAGGTGAAAAGGGTGCATCTATATTTACAAATGGTAATTCTGGAAATTTTCAGCACTCTAATAATACTCAACAAACGTCTTATGTTACATCGGGACAAAATAATTCGATTGTAAATATAAACGAATCAGCTTCACCTATTGCAAATACCAACGTAACCACGACATCATTAACAACAACAACAACTATTCCTACCCGAC]

[+] EMBL CD114159             [GTCTAGTGCTTCATTCAAAAAACATACAAATGACTATATCACCAGATTCTAGTGAAAATGATCCTAACAATAGTTATGATATTAACCAGCAAACATGTTGTTCCGAAACCGCTACGTCGGCTTCAAGTTGTTCTAGTTGTTGCTATTTCTGCTGCTGTAGTAGTTGTTGTGCCTATGGTGGAGGTAGTCTAAGTTGCTGCAGTGGAAGTACAAGCGGGTTCGGATCAAATTCTTCAGATATATCACTTAACAGTAGTGTTAACTATTCCAGGACGAAATCTAATACATACCACAATAAAAAGCAACACAATTGTTCAAATTGTACATGTCATGATAATAAAACAGATGAAATAAGTAAATGTTCAATGGATTACAATTGTTCCACTCACCGATCCTATTATCATCACCAATCTCGACGTGCTAATGAATTCAGGTACCCTCAACTACCACAAACTGGCCAGGTCAATATAAATAGTAATGAAGGTGAAAAGGGTGCATCTATATTTACAAATGGTAATTCTGGAAATTTTCAGCACTCTAATAATACTCAACAAACGTCTTATGTTACATCGGGACAAAATAATTCGATTGTAAATATAAACGAATCAGCTTCAC                                                               ]
[+] EMBL CD114127             [GTCTAGTGCTTCATTCAAAAAACATACAAATGACTATATCACCAGATTCTAGTGAAAATGATCCTAACAATAGTTATGATATTAACCAGCAAACATGTTGTTCCGAAACCGCTACGTCGGCTTCAAGTTGTTCTAGTTGTTGCTATTTCTGCTGCTGTAGTAGTTGTTGTGCCTATGGTGGAGGTAGTCTAAGTTGCTGCAGTGGAAGTACAAGCGGGTTCGGATCAAATTCTTCAGATATATCACTTAACAGTAGTGTTAACTATTCCAGGACGAAATCTAATACATACCACAATAAAAAGCAACACAATTGTTCAAATTGTACATGTCATGATAATAAAACAGATGAAATAAGTAAATGTTCAATGGATTACAATTGTTCCACTCACCGATCCTATTATCATCACCAATCTCGACGTGCTAATGAATTCAGGTACCCTCAACTACCACAAACTGGCCAGGTCAATATAAATAGTAATGAAGGTGAAAAGGGTGCATCTATATTTACAAATGGTAATTCTGGAAATTTTCAGCACTCTAATTATACTCAACANACGTCTTATGTTACATCGGGACCAAATAATTCGATTGTAAATATAAACGAATCAGCTCCAC                                                               ]
[-] EMBL CD135315             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTACATGTCATGATAATAAAACAGATGAAATAAGTAAATGTTCAATGGATTACAATTGTTCCACTCACCGATCCTATTATCATCACCAATCTCGACGTGCTAATGAATTCAGGTACCCTCAACTACCACAAACTGGCCAGGTCAATATAAATAGTAATGAAGGTGAAAAGGGTGCATCTATATTTACAAATGGTAATTCTGGAAATTTTCAGCACTCTAATAATACTCAACAAACGTCTTATGTTACATCGGGACAAAATAATTCGATTGTAAATATAAACGAATCAGCTTCACCTATTGCAAATACCAACGTAACCACGACATCATTAACAACAACAACAACTATTCCTACCCGAC]




>consensus_5284#0
GTCTAGTGCTTCATTCAAAAAACATACAAATGACTATATCACCAGATTCTAGTGAAAATG
ATCCTAACAATAGTTATGATATTAACCAGCAAACATGTTGTTCCGAAACCGCTACGTCGG
CTTCAAGTTGTTCTAGTTGTTGCTATTTCTGCTGCTGTAGTAGTTGTTGTGCCTATGGTG
GAGGTAGTCTAAGTTGCTGCAGTGGAAGTACAAGCGGGTTCGGATCAAATTCTTCAGATA
TATCACTTAACAGTAGTGTTAACTATTCCAGGACGAAATCTAATACATACCACAATAAAA
AGCAACACAATTGTTCAAATTGTACATGTCATGATAATAAAACAGATGAAATAAGTAAAT
GTTCAATGGATTACAATTGTTCCACTCACCGATCCTATTATCATCACCAATCTCGACGTG
CTAATGAATTCAGGTACCCTCAACTACCACAAACTGGCCAGGTCAATATAAATAGTAATG
AAGGTGAAAAGGGTGCATCTATATTTACAAATGGTAATTCTGGAAATTTTCAGCACTCTA
ATAATACTCAACAAACGTCTTATGTTACATCGGGACAAAATAATTCGATTGTAAATATAA
ACGAATCAGCTTCACCTATTGCAAATACCAACGTAACCACGACATCATTAACAACAACAA
CAACTATTCCTACCCGAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case