cluster # 5290

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5290 cluster # 5290 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5290#0 length = 622 sequences # 3

consensusID : consensus_5290#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 622
fasta sequence

                              [TCCCTATAATTAAATTCCCATTCNTGCCATGCATTTTTTAATTCATTACTTAAACTATCAAAACGTTCATCCCAATTTACTGTACAACCTAATTCTACTGCA-ATATCATATAAAGCACGTTCAGCAAAATAAGCTAATGGTCTATTATTCATAGCATG-TTC-TTGTAT-TTGTCTAATCAATGCTGAATATGATCTTGAACAACGATCAGCATCTAAAGCACGAAAATCACCTTGACTATGATGTGATTGATGTGGATGATAATTATGTAATGAACGATGTGAATGTGTTTTTGCTGCTGCTGCTGCTGATGATGATGATGATATATCTGATGATGAAATTCTACTTTGATTATCTTCTAAATTTATATTACTTACACTACTACTTAAATTACAATTATAAGTAGAATTATTTATATCAATTTGATTTTTATTCTGTTCATCTAATGCTGATCTTATTAATTTACAAGCATTTAATGATTTAACTAAATCTAATAAATTTTTGAACGGAATTTTTAAATACATTAAATTCATTCCACATAAAATAGTCAATATCGGAAGTGTCCAAATTGAATTCAACTTTCCATTCACATATATCACTTATTCAACACATCATATTATCCATC]

[-] EMBL CD077649             [TCCCTATAATTAAATTCCCATTCNTGCCATGCATTTTTTAATTCATTACTTAAACTATCAAAACGTTCATCCCAATTTACTGTACAACCTAATTCTACTGCA ATATCATATAAAGCACGTTCAGCAAAATAAGCTAATGGTCTATTATTCATAGCATG TTC TTGTAT TTGTCTAATCAATGCTGAATATGATCTTGAACAACGATCAGCATCTAAAGCACGAAAATCACCTTGACTATGATGTGATTGATGTGGATGATAATTATGTAATGAACGATGTGAATGTGTTTTTGCTGCTGCTGCTGCTGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL AI559032             [     ATAATT AATTCCCATTCTTGCCATGCATTTTTTAATTCATTACTTAAACTATCTAAACGTTCATCCCAATTTACTGTACAACCTAATTCTACTGCACATATCATATAAAGCACGTTCAGCAAAATAAGCTAATGGTCTATTATTCATAGCATGTTTCTTTGTATATTGTCTAATCAATGCTGGATATGATCTCGGACAACGATCAGCATCTAAAGCACTGAAATCACCTTGACTATGATGTGATTGATGTGGATGATAATTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD195421             [                                                                                                                                                                                                                              ACGAAAATCACCTTGACTAT ATGTGATTGATGTGGATGATAATTATGTAATGAACGATGTGAATGTGTTTTTGCTGCTGCTGCTGCTGATGATGATGATGATATATCTGATGATGAAATTCTACTTTGATTATCTTCTAAATTTATATTACTTACACTACTACTTAAATTACAATTATAAGTAGAATTATTTATATCAATTTGATTTTTATTCTGTTCATCTAATGCTGATCTTATTAATTTACAAGCATTTAATGATTTAACTAAATCTAATAAATTTTTGAACGGAATTTTTAAATACATTAAATTCATTCCACATAAAATAGTCAATATCGGAAGTGTCCAAATTGAATTCAACTTTCCATTCACATATATCACTTATTCAACACATCATATTATCCATC]




>consensus_5290#0
TCCCTATAATTAAATTCCCATTCNTGCCATGCATTTTTTAATTCATTACTTAAACTATCA
AAACGTTCATCCCAATTTACTGTACAACCTAATTCTACTGCAATATCATATAAAGCACGT
TCAGCAAAATAAGCTAATGGTCTATTATTCATAGCATGTTCTTGTATTTGTCTAATCAAT
GCTGAATATGATCTTGAACAACGATCAGCATCTAAAGCACGAAAATCACCTTGACTATGA
TGTGATTGATGTGGATGATAATTATGTAATGAACGATGTGAATGTGTTTTTGCTGCTGCT
GCTGCTGATGATGATGATGATATATCTGATGATGAAATTCTACTTTGATTATCTTCTAAA
TTTATATTACTTACACTACTACTTAAATTACAATTATAAGTAGAATTATTTATATCAATT
TGATTTTTATTCTGTTCATCTAATGCTGATCTTATTAATTTACAAGCATTTAATGATTTA
ACTAAATCTAATAAATTTTTGAACGGAATTTTTAAATACATTAAATTCATTCCACATAAA
ATAGTCAATATCGGAAGTGTCCAAATTGAATTCAACTTTCCATTCACATATATCACTTAT
TCAACACATCATATTATCCATC

clustalw multiple alignements is not computed in this case