cluster # 5325

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Schistosoma mansoni
cluster # 5325 cluster # 5325 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5325#0 length = 1033 sequences # 3
consensusID : consensus_5325#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1033
fasta sequence
                              [AAATACCTTAAATTATGAACTTCAAATTAAGAATTGGTGGATTCAAGAAATATGCGGCATACCAGTCGTTTCAATCTAAATCAATATTTAAATAAAAAAATGACATGTCGTGATAATGTAATGCAGTTCATGACTCACCGTATTGTCTAGTTGCATTTAGATCCGGTTCAGATTTTCGATAACAGTTATATTTAAATGAATCATCCGTAAACGGTACACATAAATTATGCAACTGACGTGAAATTACATTTGAATTTAATTTCTGACT--TAAACAGTAATGGTTTATTCTTGTCCGATGGAGAGTTAGTTTCGATTGGCAAAGGTGGCAAAAGACCAGCCCAACATGATTGTGCACATATCATATCCCAGCTTACATGATGTCCATAATCACCGTTCATTAATTTAGTTACTTGTTCAGCTGACAATTGTCTCCTATCAGTGCATTCTTCCAGACACCGATTAAATGACTTTTCCATATGAAATAGACGAGGTGCAAACCAAGTCACTTCTTCATTAATAATTGATTCCATTTGTTCCGGAGTTAATGCATCAGACTTTCTACAGCTAGGTCCTCTTATGGTAGCCATTGTGTTAAAAAAACGACTTAAGACTAAGAACATCTCTTTTGGTTACTTCGGATACCAAAGCTCCCAGGAGAGATTTTAATTTCCCCGACGTGGTTATTTCTGTATCAAGACCAGTTAAAACAGATGCACGAAAAGCCCGATGAATAAGCTGACGAATTTTTAGAGGTAGACCTTGACGTCCTGGTAATAAACCATCTGATAAGGCGAATGCTAAAGCACGACTATGATCGACCAATACTCGATAGGCGGTATCTCGATGCCACATATCAATAAGATCGTTATCCATGTTAAAATTTTTCCAAGACTGATCTAGGGCGAGATGTGATTTTGAGCAGACAGCAGAAGATGAAGATTTTCCAGATATTTTGTTCCACAGAGAAGATAGAGTAATTTCTGAGTGATCTTTGTCTGTTTTAATTTCACCATCTTGTAGAGGATTGGATAAA]

[+] EMBL CD155823             [AAATACCTTAAATTATGAACTTCAAATTAAGAATTGGTGGATTCAAGAAATATGCGGCATACCAGTCGTTTCAATCTAAATCAATATTTAAATAAAAAAATGACATGTCGTGATAATGTAATGCAGTTCATGACTCACCGTATTGTCTAGTTGCATTTAGATCCGGTTCAGATTTTCGATAACAGTTATATTTAAATGAATCATCCGTAAACGGTACACATAAATTATGCAACTGACGTGAAATTACATTTGAATTTAATTTCTGACTTCTAAACAGTAATGGTTTATTCTTGTCCGATGGAGAGTTAGTTTCGATTGGCAAAGGTGGCAAAAGACCAGCCCAACATGATTGTGCACATATCATATCCCAGCTTACATGATGTCCATAATCACCGTTCATTAATTTAGTTACTTGTTCAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD061772             [                                                                                                                                                                                                                                                             ctggacgTTCTGACT  TAAACAGTAATGGTTTATTCTTGTCCGATGGAGAGTTAGTTTCGATTGGCAAAGGTGGCAAAAGACCAGCCCAACATGATTGTGCACATATCATATCCCAGCTTACATGATGTCCATAATCACCGTTCATTAATTTAGTTACTTGTTCAGCTGACAATTGTCTCCTATCAGTGCATTCTTCCAGACACCGATTAAATGACTTTTCCATATGAAATAGACGAGGTGCAAACCAAGTCACTTCTTCATTAATAATTGATTCCATTTGTTCCGGAGTTAATGCATCAGACTTTCTACAGCTAGGTCCTCTTATGGTAGCCATTGTGTTAAAAAAACGACTTAAGACTAAGAACATCTCTTTTGGTTACTTCGGATACCAAAGCTCCCAGGAGAGATTTTAATTTCCCCGACGTGGTTATTTCTGTATCAAGACCAGTTAAAACAGATGCACGAAAAGCCCGATGAATAAGCTGACGAATTTTTAGAGGTAGACCTTGACGTCCTGGTAATAAACCATCTGATAAGGCG                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD112205             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGTT AAAAAACGACTTAAGACTAAGAACATCTCTTTTGGTTACTTCGGATACCAAAGCTCCCAGGAGAGATTTTAATTTCCCCGACGTGGTTATTTCTGTATCAAGACCAGTTAAAACAGATGCACGAAAAGCCCGATGAATAAGCTGACGAATTTTTAGAGGTAGACCTTGACGTCCTGGTAATAAACCATCTGATAAGGCGAATGCTAAAGCACGACTATGATCGACCAATACTCGATAGGCGGTATCTCGATGCCACATATCAATAAGATCGTTATCCATGTTAAAATTTTTCCAAGACTGATCTAGGGCGAGATGTGATTTTGAGCAGACAGCAGAAGATGAAGATTTTCCAGATATTTTGTTCCACAGAGAAGATAGAGTAATTTCTGAGTGATCTTTGTCTGTTTTAATTTCACCATCTTGTAGAGGATTGGATAAA]




>consensus_5325#0
AAATACCTTAAATTATGAACTTCAAATTAAGAATTGGTGGATTCAAGAAATATGCGGCAT
ACCAGTCGTTTCAATCTAAATCAATATTTAAATAAAAAAATGACATGTCGTGATAATGTA
ATGCAGTTCATGACTCACCGTATTGTCTAGTTGCATTTAGATCCGGTTCAGATTTTCGAT
AACAGTTATATTTAAATGAATCATCCGTAAACGGTACACATAAATTATGCAACTGACGTG
AAATTACATTTGAATTTAATTTCTGACTTAAACAGTAATGGTTTATTCTTGTCCGATGGA
GAGTTAGTTTCGATTGGCAAAGGTGGCAAAAGACCAGCCCAACATGATTGTGCACATATC
ATATCCCAGCTTACATGATGTCCATAATCACCGTTCATTAATTTAGTTACTTGTTCAGCT
GACAATTGTCTCCTATCAGTGCATTCTTCCAGACACCGATTAAATGACTTTTCCATATGA
AATAGACGAGGTGCAAACCAAGTCACTTCTTCATTAATAATTGATTCCATTTGTTCCGGA
GTTAATGCATCAGACTTTCTACAGCTAGGTCCTCTTATGGTAGCCATTGTGTTAAAAAAA
CGACTTAAGACTAAGAACATCTCTTTTGGTTACTTCGGATACCAAAGCTCCCAGGAGAGA
TTTTAATTTCCCCGACGTGGTTATTTCTGTATCAAGACCAGTTAAAACAGATGCACGAAA
AGCCCGATGAATAAGCTGACGAATTTTTAGAGGTAGACCTTGACGTCCTGGTAATAAACC
ATCTGATAAGGCGAATGCTAAAGCACGACTATGATCGACCAATACTCGATAGGCGGTATC
TCGATGCCACATATCAATAAGATCGTTATCCATGTTAAAATTTTTCCAAGACTGATCTAG
GGCGAGATGTGATTTTGAGCAGACAGCAGAAGATGAAGATTTTCCAGATATTTTGTTCCA
CAGAGAAGATAGAGTAATTTCTGAGTGATCTTTGTCTGTTTTAATTTCACCATCTTGTAG
AGGATTGGATAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case