These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5351#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 411 fasta sequence [TATATTGTTCATCAGAAGATTTGATACCTATAGATCTTCTCAGTGTTCTATGGAATCTGCATTAGTTTCAGATATTTAAAAGTTTAATACTATTATTTCACTCTTTCCATAAAATGAATCTAATTAATGGGAGAATGTTGTTAAATATCCTAAGAAAATCAGTCTGTTTATTTTCCTCTGGTACTATAAATGTATTAACTATTTCGTAATAGTAAGCTGTTGGGTGATTAATTAAGTCTTTAAGTTATCCATTCTTCCATTTTATAAGAAAACCTATGGAAGGAGAAGACACGTTAGTTACTGGATAAGTATATTATCTGACTGACCGTAGAACTCACTGTTGAATCGAAAAAGATTATTCATCGTGAACCAAGTATTAA----CTTTTCTATTGTATCGCTATAAACCAACTGT] [+] EMBL CD089499 [TATATTGTTCATCAGAAGATTTGATACCTATAGATCTTCTCAGTGTTCTATGGAATCTGCATTAGTTTCAGATATTTAAAAGTTTAATACTATTATTTCACTCTTTCCATAAAATGAATCTAATTAATGGGAGAATGTTGTTAAATATCCTAAGAAAATCAGTCTGTTTATTTTCCTCTGGTACTATAAATGTATTAACTATTTCGTAATAGTAAGCTGTTGGGTGATTAATTAAGTCTTTAAGTTATCCATTCTTCCATTTTATAAGAAAACCTATGGAAGGAGAAGACACGTTAGTTACTGGATAAGTATATTATCTGACTGACCGTAGAACTCACTGTTGAATCGAAAAAGATTATTCATCGTGAACCAAGTATTAA CTTTTCTATTGTATCGCTATAAACCAACTGT] [+] EMBL CD089552 [TATATTGTTCATCAGAAGATTTGATACCTATAGATCTTCTCAGTGTTCTATGGAATCTGCATTAGTTTCAGATATTTAAAAGTTTAATACTATTATTTCACTCTTTCCATAAAATGAATCTAATTAATGGGAGAATGTTGTTAAATATCCTAAGAAAATCAGTCTGTTTATTTTCCTCTGGTACTATAAATGTATTAACTATTTCGTAATAGTAAGCTGTTGGGTGATTAATTAAGTCTTTAAGTTATCCATTCTTCCATTTTATAAGAAAACCTATGGAAGGAGAAGACACGTTAGTTACTGGATAAGTATATTATCTGACTGACCGTAGAACTCACTGTTGAATCGAAAAAGATTATTCATCGTGAACCAAGTATTAAACCCCTTTTTTTTT ] [+] EMBL CD089524 [TATATTGTTCATCAGAAGATTTGATACCTATAGATCTTCTCAGTGTTCTATGGAATCTGCATTAGTTTCAGATATTTAAAAGTGTAATACTATTATTTCACTCTTTCCATAAAATGAATCTAATTAATGGGAGAATGTTGTTAAATATCCTAAGAAAATCAGTCTGTTTATTTTCCTCTGGTACTATAAATGTATTAACTATTTCGTAATAGTAAGCTGTTGGGTGATTAATTAAGTCTTTAAGTTATCCATTCTTCCATTTTATAAGAAAACCTATGGAAGGAGAAGACACGTTAGTTACTGGATAAGTATATTATCTGACTGACCGTAGAACTCACTGTTGAATCGAAAAAGATTATTCATCGTGAACCAAG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||