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Schistosoma mansoni
cluster # 5367 cluster # 5367       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5367#0 length = 760 sequences # 3  

consensusID : consensus_5367#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 760
fasta sequence
                              [ATTTAATTCAAGCATTTGTTGTAATGCATTTTAAATGACACAGAAATTGAATTTTATTAGACCCATTTTCTGTAAAGATTCTTCATACATCAAGCAAGCTAGAGCCATATATTGATTGACGCCACGAAGATATAATGCTCTATCATTGTTTAAAATGATTGTTGCCCCAGTTTGCTCAGAGACAGGCGGATCAACAAAATTAGATTGGGGAGTGTAGATTGCTGCTACATCTACGACAACATCAATCATATCACAGCATAATTCATAAGTTTGCATGTCTACTGCATTTGAATCTGTTGCTAAATATATTTTACTTGTGACATCAAAAAGAAATGCTTTGTCCACCATTGAATTTGTAATAAATATATTTAATAAATGTTCAAATGCTTCTAAATAAGGAATTAATTTTTGTACCACTTTACTGAATGCTTCAAATATTGAATGATCATATATTGTAGTTAAATGAAATCCTATACTAATTCCAGCATTCGACGGTTGTTCACACAATAAATCCTCTAAGACACTTGTTACATGTTGAGTAATATCTCGTTGTATATCCATTTTTTGATCATCTGATAAACAATCAACTCTATGAATAAATACTCCGAATTTAATGTTCATATTAAAACGGAATGCTGACTCTAAAGTAGCGTGTAGGCGAGTTAAAGCCGCATGATAATCATCCTGAGCGTCGATAATGAAAATTATAGCACAAGAAGCTAAAAATATAGCTTCAGACTGAAATGTTTCATCACAGCAA]

[-] EMBL CD162154             [ATTTAATTCAAGCATTTGTTGTAATGCATTTTAAATGACACAGAAATTGAATTTTATTAGACCCATTTTCTGTAAAGATTCTTCATACATCAAGCAAGCTAGAGCCATATATTGATTGACGCCACGAAGATATAATGCTCTATCATTGTTTAAAATGATTGTTGCCCCAGTTTGCTCAGAGACAGGCGGATCAACAAAATTAGATTGGGGAGTGTAGATTGCTGCTACATCTACGACAACATCAATCATATCACAGCATAATTCATAAGTTTGCATGTCTACTGCATTTGAATCTGTTGCTAAATATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD112922             [                                                                                                                                                                                 AGAGACAGGCGGATCAACAAAATTAGATTGGGGAGTGTAGATTGCTGCTACATCTACGACAACATCAATCATATCACAGCATAATTCATAAGTTTGCATGTCTACTGCATTTGAATCTGTTGCTAAATATATTTTACTTGTGACATCAAAAAGAAATGCTTTGTCCACCATTGAATTTGTAATAAATATATTTAATAAATGTTCAAATGCTTCTAAATAAGGAATTAATTTTTGTACCACTTTACTGAATGCTTCAAATATTGAATGATCATATATTGTAGTTAAATGAAATCCTATACTAATTCCAGCATTCGACGGTTGTTCACACAATAAATCCTCTAAGACACTTGTTACATGTTGAGTAATATCTCGTTGTATATCCATTTTTTGATCATCTGATAAACAATCAACTCTATGAATAAATACTCCGAATTTAATGT                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD167475             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAGTTAAATGAAATCCTATACTAATTCCAGCATTCGACGGTTGTTCACACAATAAATCCTCTAAGACACTTGTTACATGTTGAGTAATATCTCGTTGTATATCCATTTTTTGATCATCTGATAAACAATCAACTTTATGAATAAATACTTCGAATTTAATGTTCATATTAAAACGGAATGCTGACTCTAAAGTAGCGTGTAGGCGAGTTAAAGCCGCATGATAATCATCCTGAGCGTCGATAATGAAAATTATAGCACAAGAAGCTAAAAATATAGCTTCAGACTGAAATGTTTCATCACAGCAA]


>consensus_5367#0 ATTTAATTCAAGCATTTGTTGTAATGCATTTTAAATGACACAGAAATTGAATTTTATTAG ACCCATTTTCTGTAAAGATTCTTCATACATCAAGCAAGCTAGAGCCATATATTGATTGAC GCCACGAAGATATAATGCTCTATCATTGTTTAAAATGATTGTTGCCCCAGTTTGCTCAGA GACAGGCGGATCAACAAAATTAGATTGGGGAGTGTAGATTGCTGCTACATCTACGACAAC ATCAATCATATCACAGCATAATTCATAAGTTTGCATGTCTACTGCATTTGAATCTGTTGC TAAATATATTTTACTTGTGACATCAAAAAGAAATGCTTTGTCCACCATTGAATTTGTAAT AAATATATTTAATAAATGTTCAAATGCTTCTAAATAAGGAATTAATTTTTGTACCACTTT ACTGAATGCTTCAAATATTGAATGATCATATATTGTAGTTAAATGAAATCCTATACTAAT TCCAGCATTCGACGGTTGTTCACACAATAAATCCTCTAAGACACTTGTTACATGTTGAGT AATATCTCGTTGTATATCCATTTTTTGATCATCTGATAAACAATCAACTCTATGAATAAA TACTCCGAATTTAATGTTCATATTAAAACGGAATGCTGACTCTAAAGTAGCGTGTAGGCG AGTTAAAGCCGCATGATAATCATCCTGAGCGTCGATAATGAAAATTATAGCACAAGAAGC TAAAAATATAGCTTCAGACTGAAATGTTTCATCACAGCAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)