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Schistosoma mansoni
cluster # 5374 cluster # 5374       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5374#0 length = 586 sequences # 3  

consensusID : consensus_5374#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 586
fasta sequence
                              [AAGGCAGTTTGTATAGATTTATAGGAATCAATCTCAGACGTTTTAAATTATTTTTATTTAATGGGTTACGTTTACTGAAAACCAGCAATAATTAACTAAATTTTCATGTTTGACTGAAAGGATATATGGGCTAAATTGTAATGATTGTTAAGGTAAGGAATATTAACATTATCACGCTCAAGTTTTTATTTGTATACGGCATATTATATTTTAGCTAGTGTGTAGTTTGTTTTAGACATGCCTTTATCAACGCGACTATAAGCGTTTTTCAGCTTAAAAGTAATCACAATCTTTTTAAATATTATTAGCTGTCTCCGCTGTGTGGTCATGCTGGGGTCCATTTATTACGCACTATTTTATGGATGTATTTTGTACCACAAAACGGCGAAATATGATTTTTCTAGATGATGTTGAAAGACTTTATTTTCAAGTTTTATGTTATATAGCTACTTTGATCATTTTGCGTAAATGTTATGTCCAGTCGCTTGTCTTTTTCGTAATGTCTTTACATATTCCATTACCTAGGACAGAATTTGTTGTACTGATTGATTAAGATGAGTTGTTCAAATATCTCGGAACCAATACT]

[+] EMBL CD157042             [AAGGCAGTTTGTATAGATTTATAGGAATCAATCTCAGACGTTTTAAATTATTTTTATTTAATGGGTTACGTTTACTGAAAACCAGCAATAATTAACTAAATTTTCATGTTTGACTGAAAGGATATATGGGCTAAATTGTAATGATTGTTAAGGTAAGGAATATTAACATTATCACGCTCAAGTTTTTATTTGTATACGGCATATTATATTTTAGCTAGTGTGTAGTTTGTTTTAGACATGCCTTTATCAACGCGACTATAAGCGTTTTTCAGCTTAAAAGTAATCACAATCTTTTTAAATATTATTAGCTGTCTCCGCTGTGTGGTCATGCTGGGGTCCATTTATTACGCACTATTTTATGGATGTATTTTGTACCACAAAACGGCGAAATATGATTTTTCTAGATGATGTTGAAAGACTTTATTTTCAAGTTTTATGTTATATAGCTACTTTGATCATTTTGCGTANATGTTATGTCCAGTCGCTTGTCTTTTTCGTAATGTCTTTACATATTCCATTACCTAGGACAGAATTTGTTGTACTGATTGATTAAGATGAGTTGTTCAAATATCTCGGAACCAATACT]
[+] EMBL CD156871             [AAGGCAGTTTGTATAGATTTATAGGAATCAATCTCAGACGTTTTAAATTATTTTTATTTAATGGGTTACGTTTACTGAAAACCAGCAATAATTAACTAAATTTTCATGTTTGACTGAAAGGATATATGGGCTAAATTGTAATGATTGTTAAGGTAAGGAATATTAACATTATCACGCTCAAGTTTTTATTTGTATACGGCATATTATATTTTAGCTAGTGTGTAGTTTGTTTTAGACATGCCTTTATCAACGCGACTATAAGCGTTTTTCAGCTTAAAAGTAATCACAATCTTTTTAAATATTATTAGCTGTCTCCGCTGTGTGGTCATGCTGGGGTCCATTTATTACGCACTATTTTATGGATGTATTTTGTACCACAAAACGGCGAAATATGATTTTTCTAGATGATGTTGAAAGACTTTATTTTCAAGTTTTATGTTATATAGCTACTTTGATCATTTTGCGTAAATGTTATGTCCAGTCGCTTGTCTTTTTCGTAATGTCTTTACATATTCCATTACCTANGACAGAATTTGTTGTACTGATTGATTAAGATGAGTTGTT AAATATCTCGGAA CAATAC ]
[+] EMBL CD156889             [AAGGCAGTTTGTATAGATTTATAGGAATCAATCTCCGACGTTTTAAATTATTTTTATTTAATGGGTTACGTTTACTGAAAACCAGCAATAATTAACTAAATTTTCATGTTAGACTGAAAGGATATATGGGCTAAATTGTAATGATTGTTAAGGTAAGGAATATTAACATTATCACGCTCAAGTTTTTATTTGTATACGGCATATTATATTTTAGCTAGTGTGTAGTTTGTTTTAGACATGCCTTTATCAACGCGACTATAAGCGTTTTTCAGCTTAAAAGTAATCACAATCTTTTTAAATATTATTAGCTGTCTCCGCTGTGTGGTCATGCTGGGGTCCATTTATTACGCACTATTTTATGGATGTATTTTGTACCACAAAACGGCGAAATATGATTTTTCTAGATGATGTTGAAAGACTTTATTTTCAAGTTTTATGTTATATAGCTACTTTGATCATTTTGCGTAAATGTTATGTCCAGTCGCTTGTCTTTTTCGTAATGTCTTTACATATTCCATTACCTAGGACAGAATTTGTTGTACTGATTGATTAAGATGAGTTGTT                      ]


>consensus_5374#0 AAGGCAGTTTGTATAGATTTATAGGAATCAATCTCAGACGTTTTAAATTATTTTTATTTA ATGGGTTACGTTTACTGAAAACCAGCAATAATTAACTAAATTTTCATGTTTGACTGAAAG GATATATGGGCTAAATTGTAATGATTGTTAAGGTAAGGAATATTAACATTATCACGCTCA AGTTTTTATTTGTATACGGCATATTATATTTTAGCTAGTGTGTAGTTTGTTTTAGACATG CCTTTATCAACGCGACTATAAGCGTTTTTCAGCTTAAAAGTAATCACAATCTTTTTAAAT ATTATTAGCTGTCTCCGCTGTGTGGTCATGCTGGGGTCCATTTATTACGCACTATTTTAT GGATGTATTTTGTACCACAAAACGGCGAAATATGATTTTTCTAGATGATGTTGAAAGACT TTATTTTCAAGTTTTATGTTATATAGCTACTTTGATCATTTTGCGTAAATGTTATGTCCA GTCGCTTGTCTTTTTCGTAATGTCTTTACATATTCCATTACCTAGGACAGAATTTGTTGT ACTGATTGATTAAGATGAGTTGTTCAAATATCTCGGAACCAATACT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)